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東北紅豆杉的譜系地理結(jié)構(gòu)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-12-27 09:54
  近年?yáng)|北紅豆杉(Taxus cuspidata Sieb.et Zucc)遭受到了嚴(yán)重的人為破壞,自然種群數(shù)量銳減。了解東北紅豆杉自然種群的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)對(duì)于評(píng)價(jià)和保護(hù)東北紅豆杉的自然種群資源具有重要的理論價(jià)值和實(shí)踐意義。東北紅豆杉是第三紀(jì)孑遺植物,研究其譜系地理可以為推測(cè)種群遺傳多樣性的形成機(jī)制和物種遷移演化歷史提供依據(jù)。本研究選用三個(gè)父性遺傳的葉綠體DNA片段和一個(gè)母性遺傳線粒體DNA片段作為遺傳標(biāo)記,以采集東北紅豆杉中國(guó)分布范圍25個(gè)居群共231個(gè)個(gè)體為研究材料,分析其居群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu),從而推測(cè)居群歷史動(dòng)態(tài),并為該物種的保護(hù)提供理論依據(jù)。研究發(fā)現(xiàn)東北紅豆杉居群具有較高的遺傳多樣性,聯(lián)合葉綠體序列分析得到14個(gè)葉綠體單倍型,總的葉綠體單倍型多態(tài)性(Hd)為0.86,總的核苷酸多態(tài)性(π)為2.5 × 10-4;線粒體基因片段只檢測(cè)出二種單倍型,單倍型多態(tài)性(Hd)為0.44,核苷酸多態(tài)性(i)為4.0 × 10-4。葉綠體數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示遺傳變異主要分布在居群內(nèi)(98.5%),單倍型數(shù)據(jù)分析得到的遺傳分化系數(shù)GsT為0.10,與Nsr(0.09)相比沒有顯著差異說(shuō)明東... 

【文章來(lái)源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

東北紅豆杉的譜系地理結(jié)構(gòu)研究


圖1-2東北紅豆杉自然地理分布(摘自吳榜華,1995)??Fig.?1-2?Natural?geographical?distribution?of?Z?cuspidate?(Wu,?1995)??

電泳圖,東北紅豆杉,基因組,電泳


?東北紅豆杉的譜系地理結(jié)構(gòu)研究所有提取的DNA用超微量紫外分光光度計(jì)(NanoDrop?8000)測(cè)定OD260OD280的比值(當(dāng)A260/A280?=?1_8,表示DNA提取純度較高,若A260/A280?<?1.8表示總DNA中有蛋白污染,而A260/A280?>1.9,則樣品可能有RNA污染),再適量lkbDNA?Ladder?Marker同時(shí)在1%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳跑膠,凝膠成像(JY04S-3C)拍照,結(jié)果如下:??

瓊脂糖膠,紅豆杉,引物


d??圖2-3引物在東北紅豆杉中的PCR擴(kuò)增結(jié)果在瓊脂糖膠中的檢測(cè)??a:?^77//-;?認(rèn)4引物的擴(kuò)增效果;b:?引物的擴(kuò)增效果;??c:?/^D-^7?r引物的擴(kuò)增效果;d:?m必/4-5引物的擴(kuò)增效果??注:M代表Marker?(Marker?II?),數(shù)字1-24代表擴(kuò)增產(chǎn)物??Fig.?2-3?PCR?results?of?3?cpDNA?and?1?mtDNA?primers?used?in?this?study??a:?amplification?product?of?trnH-psbA?primer;?b:?amplification?product?of?/rwL-/'primer;??c:?amplification?product?ofpsbD-trnTprimer;?d:?amplification?product?oinad5/A-5?primer??Note:?M:?Marker?(Marker?II),?number?1-24:?PCR?product??2.1.2.4?PCR產(chǎn)物測(cè)序??根據(jù)測(cè)序結(jié)果選擇了四對(duì)多態(tài)性好且具有穩(wěn)定可靠突變位點(diǎn)的引物,基于上PCR反應(yīng)體系和程序,進(jìn)行批量擴(kuò)增,本研宄從采樣的25個(gè)種群,從中選取了?23個(gè)個(gè)體進(jìn)行批量擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物用0.8%瓊脂糖電泳檢測(cè),然后用北京擎科新業(yè)物技術(shù)公司(TsingKe,?Beijing,?China)的磁珠法進(jìn)行純化。實(shí)驗(yàn)流程如下:??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):2941536

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