群感信號AHLs對楊樹幼苗細根形態(tài)建成的影響與調(diào)控
【學位單位】:山東農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:S792.11
【部分圖文】:
圖 17 轉錄組拼接、測序流程圖Figure 17 The flowchart of transcriptome splicing and sequencing序原始數(shù)據(jù)質量評估與轉錄本拼接 2 所示,共測了 49281244 條 reads,堿基數(shù)目為 7392186600;經(jīng)過濾基,得到的 clean reads 數(shù)目為 46446436 條,堿基 6962046219 個。有,其中,Q30 占到 90.4%,GC 占到 47%。所以質量合格,可以進行后表 2 測序原始數(shù)據(jù)以及質控數(shù)據(jù)統(tǒng)計Table 2 Sequencing raw data and quality control data statistics樣品名 Sample_Hy_1原始 reads 數(shù)目 49281244原始測序量,即堿基數(shù)目 7392186600過濾后得到的 clean reads 數(shù)目 46446436過濾后得到的測序量,堿基數(shù)目 6962046219有效堿基百分比 94.18%Q30(raw bases 中 Phred 數(shù)值大于 30 的堿基占總體
群感信號 AHLs 對楊樹幼苗細根形態(tài)建成的影響與調(diào)控從樣本的數(shù)據(jù)中隨機抽取 25 萬對 reads,然后與 ntverage 大于 80%的最好的一條結果。由圖可得:前 1胡楊-18.74%;杞柳-4.54%;毛果楊×美洲黑楊-4.2%;2.05%;鰻弧菌- 1.17%;貓眼草-0.96%;紅皮柳-0.9%;種基本為本物種或近緣物種,初步判斷樣本無污染。
山東農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文GC 含量是基因組堿基序列的重要特征之一,能反映基因的結構C 分布不均勻會導致基因組不同 GC 含量序列其性質和功能也有 GC 含量平均值為 42.50%,其中 GC 含量過高(大于 60%)或過nigenes 不存在,GC 含量基本呈正態(tài)分布。從另一方面說明測序
【參考文獻】
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本文編號:2835217
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