【目的】草地貪夜蛾Spodoptera frugiperda是一種新近入侵我國的重要害蟲。本研究旨在對草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲兩個不同發(fā)育階段的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行比較分析�！痉椒ā坷酶咄繙y序技術(shù)對草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序和數(shù)據(jù)組裝,并對轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行功能注釋和比較分析。【結(jié)果】經(jīng)de novo組裝共獲得209 002條轉(zhuǎn)錄本,平均長度為687.55 bp,N50為982 bp。共有46 198條(57.43%) unigene在至少一個數(shù)據(jù)庫中獲得功能注釋,其中1 713條(2.13%) unigene在所有數(shù)據(jù)庫中均能獲得注釋。在GO數(shù)據(jù)庫中獲得205 269條unigene的注釋,主要包括68個功能分類;在KEGG數(shù)據(jù)庫中共有3 408條unigene得到注釋,涉及277個代謝通路。共鑒定到424個嗅覺相關(guān)的基因,并且在雄性成蟲和5齡幼蟲之間的表達(dá)存在差異。通過比較轉(zhuǎn)錄組分析,在雄性成蟲中鑒定到9 162個上調(diào)和6 399個下調(diào)差異表達(dá)基因(DEGs);功能富集分析發(fā)現(xiàn)在上調(diào)DEGs中涉及信息素以及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的代謝通路顯著富集,而下調(diào)DEGs中涉及解毒相關(guān)的通路顯著...

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

圖1草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene序列長度分布

草地貪夜蛾轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝后的unigene序列與CDD,KOG,COG,NR,NT,PFAM,Swiss-Prot和TrEMBL等多個數(shù)據(jù)庫比對,共有46198條(57.43%)unigene在至少1個數(shù)據(jù)庫中獲得功能注釋,1713條(2.13%)unigene在....

圖2草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene在NR數(shù)據(jù)庫的同源物種分布

根據(jù)GO數(shù)據(jù)庫注釋結(jié)果,共有205269條草地貪夜蛾unigene被劃分為68個功能分類(圖4),生物學(xué)過程注釋到的unigene最多,共有91666個,占44.66%,其中注釋較多的功能分別為細(xì)胞過程(14535個,7.08%)、代謝過程(11439個,5.57%)....

圖3草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene的KOG功能分類

表3草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組中與解毒相關(guān)基因的統(tǒng)計Table3Statisticsofunigenesassociatedwithdetoxificationinthetranscriptomesofmaleadultandthe5th....

圖4草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene的GO功能分類

圖3草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene的KOG功能分類根據(jù)KEGG數(shù)據(jù)庫注釋結(jié)果,主要分為5大類功能,包括代謝(1815個,29.25%)、有機(jī)系統(tǒng)(1496個,24.11%)、遺傳信息處理(1118個,18.01%)、細(xì)胞過程(917個,14.78....

本文編號：3900975