甘蔗赤條病是由燕麥食酸菌燕麥亞種Acidovorax avenae subsp.avenae(Aaa)引起的甘蔗主要細菌性病害之一。為從轉(zhuǎn)錄組水平探討甘蔗應答Aaa侵染的分子機制,本研究以抗赤條病新臺糖22號(ROC22)和感赤條病閩糖11-610(MT11-610)品種為實驗材料。處理組用剪葉法接種Aaa菌液(SC-026),對照組接種無菌培養(yǎng)基,分別在接種0 h、24 h、48 h、72 h后采集甘蔗葉片(3次生物學重復)。采用RNA-seq技術構(gòu)建甘蔗響應Aaa侵染的轉(zhuǎn)錄組文庫,探尋甘蔗應答Aaa侵染的差異表達基因(DEGs)及其代謝和信號通路,并對病程相關蛋白ScPR1基因進行克隆和功能驗證。主要研究結(jié)果如下:(1)從兩個品種中篩選出29,887個顯著DEGs,其中從抗病品種ROC22中獲得18,689個DEGs(45.5%的DEGs為上調(diào)表達),而從感病品種MT11-610中獲得15,782個差異基因(55.8%的DEGs為上調(diào)表達)。KEGG富集分析顯示,共有3,818個DEGs富集在67條通路上,主要是苯丙烷生物合成途徑(ko00940)、光合作用天線蛋白途徑(ko001...

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-1兩個品種不同時間點的差異基因（DEGs）韋恩圖

3結(jié)果與分析24（R_AaavsR0_CK）中有18,689個，感病品種MT11-610處理組（S_AaavsS0_CK）中有15,782個。在ROC22處理組鑒定到的上下調(diào)DEGs分別有8,498和10,196個；MT11-610處理組中鑒定到的上下調(diào)DEGs分別有8,807和....

圖3-2抗病品種新臺糖22處理組差異基因GO功能注釋(A):上調(diào)差異基因；(B)：下調(diào)差異基因；BP:生物進程；CC:分子組成；MF:分子功能Fig3-2.GeneOntology(GO)annotationofdifferentiallyexpressedgenes(DEGs)intheAaa-resistantcultivarROC22.Up-(A)anddownregulated(B)BP:biologicalprocess,CC:cellularcomponent,...

3結(jié)果與分析26圖3-2抗病品種新臺糖22處理組差異基因GO功能注釋(A):上調(diào)差異基因；(B)：下調(diào)差異基因；BP:生物進程；CC:分子組成；MF:分子功能Fig3-2.GeneOntology(GO)annotationofdifferentiallyexpressedgen....

圖3-3感病品種閩糖11-610處理組差異基因GO功能注釋(A):上調(diào)差異基因；(B)：下調(diào)差異基因；BP:生物進程；CC:分子組成；MF:分子功能Fig3-3.GeneOntology(GO)annotationofdifferentiallyexpressedgenes(DEGs)intheAaa-susceptiblecultivarMT11-610.Up-(A)anddownregulated(B).BP:biologicalprocess,CC:cellularc...

甘蔗響應赤條病菌侵染的ScPR1基因的鑒定與功能分析27最多的是催化活性，2,641個，其次是作用于糖基鍵的水解酶活性，有211個DEGs。圖3-3感病品種閩糖11-610處理組差異基因GO功能注釋(A):上調(diào)差異基因；(B)：下調(diào)差異基因；BP:生物進程；CC:分子組成；MF:....

圖3-4基于qRT-PCR驗證12個差異基因相對表達量（2ΔΔCT）熱圖

3結(jié)果與分析30圖3-4基于qRT-PCR驗證12個差異基因相對表達量（2ΔΔCT）熱圖注：星號表示每個時間點相對表達水平的顯著性差異（*表示p<0.05;**表示p<0.01）;紅色表示上調(diào)表達，藍色表示下調(diào)表達。Fig3-4.Heatmapdepictingrelativee....

本文編號：3894992