鐮孢菌是重要的植物病原真菌之一,可引起多種植物發(fā)生病害。本研究以供試的尖鐮孢菌菌株為研究對象,利用生物信息學方法分析尖鐮孢菌全基因組SSR位點的分布特點,在此基礎上開發(fā)SSR引物用來分析尖鐮孢種內的SSR遺傳多樣性;以山西不同地區(qū)采集的鐮孢菌株為研究對象,采用線粒體小亞基（mtSSUrDNA）和組蛋白H3（histone H3）兩個基因序列探討不同種的鐮孢菌的系統(tǒng)發(fā)育關系。其主要研究結果如下:1.對7條已公布的尖鐮孢菌染色體基因組序列進行生物信息學分析,結果表明:基因組中7條染色體共有860個SSR位點,平均每條染色體出現122個SSR位點,大約每44.2kb出現一個長度不小于18bp的SSR位點。其中四、五核苷酸重復為主要重復類型,占全部SSR的比例分別為23.84%和32.56%;435種重復基元的分布情況存在差異,基元為ACAA/TTGT出現次數最多,為33次,其次為CAAA/TTTG,出現32次。說明尖鐮抱菌基因組中含有豐富的SSR位點,為Genomic-SSR標記在尖鐮孢菌鑒別中的應用奠定了理論基礎。2.采用SSR分子標記技術對尖鐮孢菌進行遺傳多樣性分析,結果表明,60對SS... 

【文章來源】：山西農業(yè)大學山西省

【文章頁數】：59 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

引物(GTAG)7和(TGATT)10對21株尖鐮袍菌基因組DN人的S5R-PCR擴增效果

玻敝曇飭?呔?櫻櫻遙?校茫依┰黿峁?木劾嚳治觶崳?聚類分析結果表明（圖２），尖鐮孢菌菌株類群間總體遺傳相似系數在０．?５６？０．?９５。??當遺傳相似系數為０．?５６時，２１株尖鐮孢菌可分成２個ＳＳＲ類群（ＳＳＲ?ｇｒｏｕｐｓ，ＳＧ）；當??相似系數為０．７０時，２１株尖鐮孢菌可分成５個ＳＳＲ亞類群；當相似系數為０．９５時，??２１株尖鐮孢菌可完全分開。表明尖鐮孢菌基因組ＤＮＡ的ＳＳＲ區(qū)域具有遺傳分化明顯的??特點，全基因組ＳＳＲ標記技術是一種尖鐮孢菌遺傳分化研究的有效方法。??同一地理來源不同寄主，如分離自夏縣的黃瓜９號和西瓜１３號菌株、祁縣的茄子１??號和綠豆２號菌株、太谷的蠶豆５號和地豆６號菌株聚在不同的類群或亞類群（圖２）；??同一寄主不同地理來源的菌株聚于不同類群，如分離自太谷候縣番茄（１４號）與大同番??茄（１５號）分別聚在了?ＳＧ－１和ＳＧ－２中（圖２）。另外，雖然分離自黃瓜的９號、１０??號、１１號和１２號聚在了不同類群，但來自夏縣黃瓜９號和太原黃瓜１１號聚在一支上，??太谷黃瓜１０號和１２號聚在了一起；分離自運城棉花１７號和１９號菌株聚在一起

圖２．２部分樣品電泳圖??Ｆｉｇｕｒｅ２．２?ｓａｍｐｌｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｔｏｇｒａｍ??－３３?－??

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本文編號：3485004