發(fā)布時間：2021-11-05 11:51

　　農業(yè)害蟲和入侵昆蟲每年對全球的農業(yè)、經濟和人類健康都會造成巨大損失和危害。近年來由于過量使用農藥等原因,不少害蟲產生了高水平的抗藥性,使農業(yè)生產和人類健康都面臨巨大威脅。同時我國由于國土面積廣闊,國際線長,國際貿易交流等原因,也飽受入侵昆蟲的威脅,因此研究昆蟲抗藥性和入侵性對于農業(yè)可持續(xù)發(fā)展,生態(tài)環(huán)境和人類健康都有重要意義。本文圍繞昆蟲抗藥性和入侵性兩方面內容,運用生物信息學和機器學習的技術方法進行了以下研究。（1）乙酰膽堿酯酶發(fā)生基因突變,導致殺蟲劑對其靶標作用敏感度下降是昆蟲產生抗藥性的重要原因。本文提出直接使用轉錄組數(shù)據(jù),檢測乙酰膽堿酯酶抗藥性相關的突變位點,縮短了使用傳統(tǒng)基于聚合酶鏈式反應的實驗方法進行突變位點檢測所需的時間。針對乙酰膽堿酯酶基因,本文建立了全面的乙酰膽堿酯酶基因數(shù)據(jù)庫和乙酰膽堿酯酶抗藥性相關的基因突變位點數(shù)據(jù)庫。并設計了一套完整的計算流程,利用Bowtie2軟件進行快速短序列比對,從轉錄組中獲取對應物種的乙酰膽堿酯酶基因上的測序片段,并與突變位點數(shù)據(jù)庫比較,獲取抗性測序片段數(shù)量和敏感測序片段數(shù)量,最后計算抗性頻率。同時為該算法建立網站,提供在線系統(tǒng),方便其他研... 

【文章來源】：南京師范大學江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２．丨乙酰膽堿酯酶在神經突出中分解乙酰膽堿??

第一輪測序的模板鏈，用對讀測序模塊（Ｐａｉｅｄ－Ｅｎｄ?Ｍｏｄｕｌｅ）引導互補鏈在原位置??再生和擴增，以達到第二輪測序所用的模板量，進行第二輪互補鏈的合成測序。??單端測序和雙端測序制備的文庫如圖３．１。??Ｓｉｎｇｌｅ－ｅｎｄ??Ｒｅａｄ?１??Ｐａｉｒｅｄ－ｅｎｄ??Ｒｅａｄ?１??—Ａ??Ｒｅａｄ?２??圖３．１單端測序和雙端測序??１２??

找到這些突變位點之后，針對每個物種，獲取以突變位點為中心的１１個堿??基長度的片段并建立數(shù)據(jù)庫。將這些突變位點對齊到加利福尼亞電鰩的乙酰膽堿??酯酶基因上，并將其分布繪制成圖３．６。圖中紅色字母代表對應于ＡＣｈＥｌ蛋白上??１７??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]乙酰膽堿酯酶基因突變與蚊蟲抗藥性關系的研究進展[J]. 陸靖,程鵬,公茂慶,沈波,朱昌亮,崔文,譚文彬.  中國媒介生物學及控制雜志. 2017(06)
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[4]發(fā)現(xiàn)紅火蟻入侵中國10年:發(fā)生歷史、現(xiàn)狀與趨勢[J]. 陸永躍,曾玲.  植物檢疫. 2015(02)
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[7]第二代測序序列比對方法綜述[J]. 楊燁,劉娟.  武漢大學學報(理學版). 2012(05)
[8]第三代測序基本原理[J]. 李明爽,趙敏.  現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2012(10)
[9]中國水果和蔬菜昆蟲授粉的經濟價值評估[J]. 安建東,陳文鋒.  昆蟲學報. 2011(04)
[10]乙酰膽堿酯酶生物功能的研究進展及其應用[J]. 張千,王取南.  國外醫(yī)學(衛(wèi)生學分冊). 2008(03)

博士論文
[1]煙粉虱為害對番茄生長與生化物質的影響及防治技術研究[D]. 胡榮利.揚州大學 2015
[2]基于GIS的多尺度生態(tài)地理物種入侵預測建模[D]. 陳浩.武漢大學 2010
[3]斜紋夜蛾的抗藥性及其機理研究[D]. 黃水金.南京農業(yè)大學 2006
[4]煙粉虱種群抗藥性及其機理研究[D]. 何玉仙.福建農林大學 2006

碩士論文
[1]三對農藥對乙酰膽堿酯酶的聯(lián)合毒性效應研究[D]. 蔣曼.海南大學 2015
[2]外來有害生物西花薊馬在中國的適生性風險分析[D]. 程俊峰.華中農業(yè)大學 2005



本文編號：3477746