松墨天牛超氣門蛋白的克隆與功能研究
發(fā)布時間:2021-10-28 16:41
松墨天牛(Monochamus alternatus Hope)屬于鞘翅目(Coleoptera),天?疲–erambycidae)是危害馬尾松(Pinus massoniana)等松材的重大森林害蟲,是松材線蟲(Bursaphelenchus xylophilus)的主要傳播媒介。近3年來,松墨天牛分子生物學(xué)領(lǐng)域的研究從個別基因的克隆發(fā)展到轉(zhuǎn)錄組研究,為高通量研究基因奠定了基礎(chǔ);從單純的生物信息學(xué)分析發(fā)展到結(jié)合生理學(xué)、毒理學(xué)及化學(xué)生態(tài)學(xué)等綜合研究,充分展現(xiàn)了分子生物學(xué)的研究優(yōu)勢。超氣門蛋白(ultraspiracle,USP)處于昆蟲發(fā)育、變態(tài)及繁殖等過程級聯(lián)調(diào)控的開始位置,研究不同目昆蟲USP的結(jié)構(gòu)及功能特點,深入地了解其作用方式及開展應(yīng)用研究,無論對益蟲生長發(fā)育的調(diào)控亦或是對害蟲的防治都有重要的理論和實用價值。本文研究松墨天牛超氣門蛋白cDNA的序列特征、功能等,對于開發(fā)環(huán)境友好型新藥劑和基因調(diào)控開關(guān)等方面具有重要指導(dǎo)作用。本研究采用RACE方法克隆得到松墨天牛USP基因全場序列,應(yīng)用RNA干擾(RNA interference,RNAi)方法對其功能進(jìn)行了研究,同時進(jìn)行了生物...
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
松墨天牛4齡幼蟲總RNA電泳圖
25圖 2 MaUSP 的核苷酸及推導(dǎo)的氨基酸序列Fig.2 Nucleotide and deduced amino acid sequences of MaUSP注:起始密碼子 ATG 以下劃波浪線表示,終止密碼子 TAA 以* 表示,20 個絲氨酸磷酸化位點、14 個蘇氨酸磷酸化位點、4 個酪氨酸磷酸化位點分別以圓形、矩形、三角形表示,2 個糖基化位點以五角星形表示,加尾信號 AATAAA 以雙下劃線表示。使用 DNAMAN 序列分析軟件將測序所得的 3′ RACE 序列和 5′ RACE 序列與從松墨天牛 cDNA 文庫中篩選得到的松墨天牛超氣門蛋白基因片段序列拼接得到如圖 2所示序列。該序列全長為 1583 bp,命名為 MaUSP(GenBank 登陸號:KU587580),其中包含 186 bp 的 5′ 端非編碼區(qū)及 241 bp 的 3′ 端非編碼區(qū),ORF 為 1155 bp,編碼 384 個氨基酸,包含 12 bp 的 Poly A 尾巴和從第 1547 位至 1552 位的一個特征性序列,即加尾信號 AATAAA。通過 MaUSP 的磷酸化修飾位點預(yù)測發(fā)現(xiàn),Tn 分值>0.5
的磷酸化位點有:絲氨酸( Ser )磷酸化位點 20 個,蘇氨酸( Thr )磷酸化位點 14 個,酪氨酸( Tyr )磷酸化位點 4 個,共計 38 個磷酸化位點,這些位點相對均勻地分布在整個多肽鏈中。NetOGlye 預(yù)測表明,MaUSP 在 256 和 379 氨基酸位點存在 N-糖基化修飾。3.3 USP 基因序列相似性比對
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]松墨天牛Homothorax基因的鑒定及表達(dá)分析[J]. 陳敬祥,劉琪司,林同. 華北農(nóng)學(xué)報. 2017(01)
[2]松墨天牛葡萄糖-6-磷酸異構(gòu)酶基因克隆及序列分析[J]. 蔡紫玲,陳敬祥,林同. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(05)
[3]松墨天;瘜W(xué)感受組織熒光定量PCR內(nèi)參基因的鑒定與篩選[J]. 馮波,郭前爽,毛必鵬,杜永均. 昆蟲學(xué)報. 2016(04)
[4]孟氏隱唇瓢蟲氣味結(jié)合蛋白ComOBP1基因的克隆和時空表達(dá)[J]. 潘暢,張宇宏,謝佳沁,李浩森,龐虹. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2016(02)
[5]松墨天牛核糖體蛋白(RPS15A)cDNA的克隆及農(nóng)藥脅迫對其表達(dá)的影響[J]. 羅淋淋,蔡紫玲,林同. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2016(02)
[6]松墨天牛包囊蛋白基因的克隆及表達(dá)特性分析[J]. 毛珊珊,吳華俊,林同. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報. 2016(01)
[7]DNA條形碼試劑盒檢測技術(shù)在墨天牛鑒定中的應(yīng)用[J]. 陳夢義,徐梅,錢路,安榆林,郝德君. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2015(06)
[8]松墨天牛肌球蛋白輕鏈2基因的鑒定及表達(dá)模式[J]. 吳華俊,蔡紫玲,羅淋淋,林同. 華北農(nóng)學(xué)報. 2015(03)
[9]家蠶的蛻皮激素受體和超氣門蛋白在大腸桿菌中的共表達(dá)和純化[J]. 唐詩蕊,王濤,王旻. 藥物生物技術(shù). 2015(03)
[10]松墨天牛OBP基因MaltOBP2和MaltOBP6的克隆、序列分析及組織表達(dá)譜和原核表達(dá)研究[J]. 錢凱,馮波,巫詡亮,勞沖,沈幼蓮,杜永均. 昆蟲學(xué)報. 2015(05)
博士論文
[1]擬黑多刺蟻蛻皮激素受體(EcR)和超氣門蛋白(USP)的cDNA測序、mRNA表達(dá)及其與雌激素相關(guān)受體(ERR)的功能相關(guān)性分析[D]. 劉曉明.陜西師范大學(xué) 2013
[2]熱休克蛋白同源物Hsc70等5種基因在蛻皮激素信號途徑中的功能及相互作用研究[D]. 鄭薇薇.山東大學(xué) 2010
碩士論文
[1]松褐天牛氣味結(jié)合蛋白基因的克隆與功能分析[D]. 王娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]家蠶蛻皮激素受體和超氣門蛋白在絲腺中的表達(dá)特征及其相關(guān)功能研究[D]. 杜杰.蘇州大學(xué) 2015
[3]松褐天牛OBPs基因克隆與分析[D]. 高雄.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]黃花蒿EβF合成酶基因及麥長管蚜蛻皮素受體基因USP和EcR的克隆和遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 陳紅梅.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]家蠶蛻皮激素受體和超氣門蛋白基因的啟動子分析[D]. 黃明霞.蘇州大學(xué) 2014
[6]超氣門蛋白(USP)基因及蛻皮激素受體(EcR)基因?qū)M黑多刺蟻和黃臉油葫蘆生長發(fā)育調(diào)節(jié)功能的研究[D]. 黨亮.陜西師范大學(xué) 2014
[7]甜菜夜蛾幼蟲期EcR和USP基因表達(dá)模式與功能研究[D]. 劉鵬琰.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]家蠶蛻皮激素受體和超氣門蛋白基因的表達(dá)調(diào)控研究[D]. 蘇保錦.蘇州大學(xué) 2012
本文編號:3463063
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
松墨天牛4齡幼蟲總RNA電泳圖
25圖 2 MaUSP 的核苷酸及推導(dǎo)的氨基酸序列Fig.2 Nucleotide and deduced amino acid sequences of MaUSP注:起始密碼子 ATG 以下劃波浪線表示,終止密碼子 TAA 以* 表示,20 個絲氨酸磷酸化位點、14 個蘇氨酸磷酸化位點、4 個酪氨酸磷酸化位點分別以圓形、矩形、三角形表示,2 個糖基化位點以五角星形表示,加尾信號 AATAAA 以雙下劃線表示。使用 DNAMAN 序列分析軟件將測序所得的 3′ RACE 序列和 5′ RACE 序列與從松墨天牛 cDNA 文庫中篩選得到的松墨天牛超氣門蛋白基因片段序列拼接得到如圖 2所示序列。該序列全長為 1583 bp,命名為 MaUSP(GenBank 登陸號:KU587580),其中包含 186 bp 的 5′ 端非編碼區(qū)及 241 bp 的 3′ 端非編碼區(qū),ORF 為 1155 bp,編碼 384 個氨基酸,包含 12 bp 的 Poly A 尾巴和從第 1547 位至 1552 位的一個特征性序列,即加尾信號 AATAAA。通過 MaUSP 的磷酸化修飾位點預(yù)測發(fā)現(xiàn),Tn 分值>0.5
的磷酸化位點有:絲氨酸( Ser )磷酸化位點 20 個,蘇氨酸( Thr )磷酸化位點 14 個,酪氨酸( Tyr )磷酸化位點 4 個,共計 38 個磷酸化位點,這些位點相對均勻地分布在整個多肽鏈中。NetOGlye 預(yù)測表明,MaUSP 在 256 和 379 氨基酸位點存在 N-糖基化修飾。3.3 USP 基因序列相似性比對
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]松墨天牛Homothorax基因的鑒定及表達(dá)分析[J]. 陳敬祥,劉琪司,林同. 華北農(nóng)學(xué)報. 2017(01)
[2]松墨天牛葡萄糖-6-磷酸異構(gòu)酶基因克隆及序列分析[J]. 蔡紫玲,陳敬祥,林同. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(05)
[3]松墨天;瘜W(xué)感受組織熒光定量PCR內(nèi)參基因的鑒定與篩選[J]. 馮波,郭前爽,毛必鵬,杜永均. 昆蟲學(xué)報. 2016(04)
[4]孟氏隱唇瓢蟲氣味結(jié)合蛋白ComOBP1基因的克隆和時空表達(dá)[J]. 潘暢,張宇宏,謝佳沁,李浩森,龐虹. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2016(02)
[5]松墨天牛核糖體蛋白(RPS15A)cDNA的克隆及農(nóng)藥脅迫對其表達(dá)的影響[J]. 羅淋淋,蔡紫玲,林同. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2016(02)
[6]松墨天牛包囊蛋白基因的克隆及表達(dá)特性分析[J]. 毛珊珊,吳華俊,林同. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報. 2016(01)
[7]DNA條形碼試劑盒檢測技術(shù)在墨天牛鑒定中的應(yīng)用[J]. 陳夢義,徐梅,錢路,安榆林,郝德君. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2015(06)
[8]松墨天牛肌球蛋白輕鏈2基因的鑒定及表達(dá)模式[J]. 吳華俊,蔡紫玲,羅淋淋,林同. 華北農(nóng)學(xué)報. 2015(03)
[9]家蠶的蛻皮激素受體和超氣門蛋白在大腸桿菌中的共表達(dá)和純化[J]. 唐詩蕊,王濤,王旻. 藥物生物技術(shù). 2015(03)
[10]松墨天牛OBP基因MaltOBP2和MaltOBP6的克隆、序列分析及組織表達(dá)譜和原核表達(dá)研究[J]. 錢凱,馮波,巫詡亮,勞沖,沈幼蓮,杜永均. 昆蟲學(xué)報. 2015(05)
博士論文
[1]擬黑多刺蟻蛻皮激素受體(EcR)和超氣門蛋白(USP)的cDNA測序、mRNA表達(dá)及其與雌激素相關(guān)受體(ERR)的功能相關(guān)性分析[D]. 劉曉明.陜西師范大學(xué) 2013
[2]熱休克蛋白同源物Hsc70等5種基因在蛻皮激素信號途徑中的功能及相互作用研究[D]. 鄭薇薇.山東大學(xué) 2010
碩士論文
[1]松褐天牛氣味結(jié)合蛋白基因的克隆與功能分析[D]. 王娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]家蠶蛻皮激素受體和超氣門蛋白在絲腺中的表達(dá)特征及其相關(guān)功能研究[D]. 杜杰.蘇州大學(xué) 2015
[3]松褐天牛OBPs基因克隆與分析[D]. 高雄.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]黃花蒿EβF合成酶基因及麥長管蚜蛻皮素受體基因USP和EcR的克隆和遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 陳紅梅.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]家蠶蛻皮激素受體和超氣門蛋白基因的啟動子分析[D]. 黃明霞.蘇州大學(xué) 2014
[6]超氣門蛋白(USP)基因及蛻皮激素受體(EcR)基因?qū)M黑多刺蟻和黃臉油葫蘆生長發(fā)育調(diào)節(jié)功能的研究[D]. 黨亮.陜西師范大學(xué) 2014
[7]甜菜夜蛾幼蟲期EcR和USP基因表達(dá)模式與功能研究[D]. 劉鵬琰.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]家蠶蛻皮激素受體和超氣門蛋白基因的表達(dá)調(diào)控研究[D]. 蘇保錦.蘇州大學(xué) 2012
本文編號:3463063
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