不同水稻品系對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
發(fā)布時(shí)間:2021-08-18 23:04
稻縱卷葉螟(Cnaphaalocrocis medinalisGuenee)(Rice leaf folder,RLF)是一種世界范圍內(nèi)危害水稻、大麥、小麥、甘蔗等作物的重要害蟲。腸道微生物在宿主的食物消化、生長發(fā)育、免疫以及代謝方面起著重要的作用,近年來新一代測序技術(shù)大大推動了腸道微生物的研究。為分析稻縱卷葉螟腸道微生物對宿主的功能,本文綜合運(yùn)用傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)技術(shù)、變性梯度凝膠電泳技術(shù)(DGGE)、16SrRNA基因測序技術(shù)以及宏基因組測序技術(shù)對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性及其功能進(jìn)行了分析,具體結(jié)果如下:一、取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能采用傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)方法,共分離得到10種不同的細(xì)菌,其中變形菌門Proteobacteria和厚壁菌門Firmicutes所占比例分別為70%和30%,表明變形菌門為稻縱卷葉螟腸道可培養(yǎng)細(xì)菌中的優(yōu)勢菌群。采用DGGE方法,分離得到的變形菌門所占比例為77%,厚壁菌門所占比例為23%,在門的水平上腸道微生物的組成與傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)方法一致。利用16SrRNA基因測序技術(shù)分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌組成,結(jié)果表明,稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌主要由變形菌門...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 稻縱卷葉螟的生物學(xué)特征、危害及防治
1.2 昆蟲腸道微生物的研究概況
1.3 昆蟲腸道微生物的研究意義
1.4 昆蟲腸道微生物的功能
1.4.1 腸道微生物消化食物與提供營養(yǎng)的功能
1.4.2 腸道微生物對昆蟲的保護(hù)防御功能
1.4.3 腸道微生物與Bt抗性的關(guān)系
1.4.4 腸道微生物的其他功能
1.5 昆蟲腸道微生物的研究方法
1.6 本研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 主要儀器及試劑配置
2.1.1 主要儀器
2.1.2 主要試劑
2.1.3 培養(yǎng)基配制
2.1.4 DGGE試劑配制
2.1.5 引物設(shè)計(jì)與合成
2.2 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的研究
2.2.1 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的分離與培養(yǎng)
2.2.2 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的PCR-DGGE分析
2.2.3 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌16S rRNA基因V4高變區(qū)測序
2.2.4 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌宏基因組測序與分析
2.2.5 宏基因組測序分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的功能
2.3 取食不同品系水稻稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異的研究
2.3.1 供試蟲源與食源
2.3.2 PCR-DGGE分析不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
2.3.3 16S rRNA基因測序分析不同品系水稻稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
2.4 Bt水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)影響的研究
2.4.1 稻縱卷葉螟的飼養(yǎng)
2.4.2 16S rRNA基因測序分析轉(zhuǎn)基因水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
3 結(jié)果與分析
3.1 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的分析
3.1.1 傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)法分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性
3.1.2 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌DGGE分析
3.1.3 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌16S rRNA基因V4高變區(qū)測序分析
3.1.4 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌宏基因組分析
3.1.5 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌功能研究
3.2 不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.2.1 DGGE法分析不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.2.2 16S rRNA基因測序分析不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.3 轉(zhuǎn)基因水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.3.1 基于門水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.2 基于綱水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.3 基于目水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.4 基于科水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.5 基于屬水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.6 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌LEfSe分析
4 總結(jié)與討論
4.1 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的研究
4.2 不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
4.3 轉(zhuǎn)基因水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
參考文獻(xiàn)
附錄1
附錄2
附錄3
致謝
本文編號:3350793
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 稻縱卷葉螟的生物學(xué)特征、危害及防治
1.2 昆蟲腸道微生物的研究概況
1.3 昆蟲腸道微生物的研究意義
1.4 昆蟲腸道微生物的功能
1.4.1 腸道微生物消化食物與提供營養(yǎng)的功能
1.4.2 腸道微生物對昆蟲的保護(hù)防御功能
1.4.3 腸道微生物與Bt抗性的關(guān)系
1.4.4 腸道微生物的其他功能
1.5 昆蟲腸道微生物的研究方法
1.6 本研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 主要儀器及試劑配置
2.1.1 主要儀器
2.1.2 主要試劑
2.1.3 培養(yǎng)基配制
2.1.4 DGGE試劑配制
2.1.5 引物設(shè)計(jì)與合成
2.2 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的研究
2.2.1 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的分離與培養(yǎng)
2.2.2 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的PCR-DGGE分析
2.2.3 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌16S rRNA基因V4高變區(qū)測序
2.2.4 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌宏基因組測序與分析
2.2.5 宏基因組測序分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的功能
2.3 取食不同品系水稻稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異的研究
2.3.1 供試蟲源與食源
2.3.2 PCR-DGGE分析不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
2.3.3 16S rRNA基因測序分析不同品系水稻稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
2.4 Bt水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)影響的研究
2.4.1 稻縱卷葉螟的飼養(yǎng)
2.4.2 16S rRNA基因測序分析轉(zhuǎn)基因水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
3 結(jié)果與分析
3.1 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的分析
3.1.1 傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)法分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性
3.1.2 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌DGGE分析
3.1.3 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌16S rRNA基因V4高變區(qū)測序分析
3.1.4 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌宏基因組分析
3.1.5 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌功能研究
3.2 不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.2.1 DGGE法分析不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.2.2 16S rRNA基因測序分析不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.3 轉(zhuǎn)基因水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.3.1 基于門水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.2 基于綱水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.3 基于目水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.4 基于科水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.5 基于屬水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.6 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌LEfSe分析
4 總結(jié)與討論
4.1 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的研究
4.2 不同品系水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
4.3 轉(zhuǎn)基因水稻對稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
參考文獻(xiàn)
附錄1
附錄2
附錄3
致謝
本文編號:3350793
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