煙草叢頂病毒不依賴帽子翻譯機制的RNA結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)與分子進化
發(fā)布時間:2021-08-14 18:24
煙草叢頂病毒(Tobacco bushy top virus,TBTV)屬于番茄叢矮病毒科幽影病毒屬,基因組由一條正義單鏈RNA(+ssRNA)組成,全長約4,152 nt。5’端缺乏帽子結(jié)構(gòu)(m7GPPPN),3’末端也不帶poly(A)尾,編碼4個ORF,包括復(fù)制酶組分p35蛋白及其-1位移碼產(chǎn)物p98蛋白(RNA依賴RNA聚合酶,RdRp),運動蛋白p26和p27。前人研究表明,TBTV基因組的3’UTR含有不依賴帽子翻譯元件BTE,可以調(diào)控報告基因的表達。本文分析了BTE在全長TBTV中對p35蛋白翻譯的調(diào)控作用以及對TBTV在BY-2原生質(zhì)體中的RNA積累的作用。另外從中國云南地區(qū)克隆了3個新的TBTV弱毒分離物,發(fā)現(xiàn)其p35表達量相對于野生型(TBTV-Ch)明顯降低,且p35表達量降低與BTE元件的結(jié)構(gòu)變異相關(guān)。利用體外翻譯系統(tǒng)WGE,以TBTV基因組全長RNA為材料全面分析其不依賴帽子翻譯,發(fā)現(xiàn)TBTV基因組中除BTE外還存在至少1種類型的不依賴帽子翻譯元件。具體結(jié)果如下:(1)TBTV全基因組克隆及分子進化:通過5’RACE和3’RACE結(jié)合一步RT-PCR的方法,克...
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:115 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
真核細(xì)胞mRNA翻譯模式圖(Jacksonetal.,2005;Dresiosetal.,2006;Deforgesetal.,2015)
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文僅可以與 eIF4F 互作,還和 5’UTR 存在遠距離的 RNA-RNA 互作,將 eIF4F 傳遞到 5’末端以高效的起始翻譯(Nicholson et al., 2010)。玉米壞死條紋病毒的 5’端也會形成類似 TBSV 5’端形成的 T 型結(jié)構(gòu)域,并且和其不依賴帽子翻譯調(diào)控元件(I-Shape結(jié)構(gòu))存在遠距離的RNA-RNA互作(Miller et al., 2007)。
圖 1-3 結(jié)構(gòu)分析原理圖(Soukup and Breaker, 2009;Wilkinsone et al., 2006;Smola et al., 2015)A. 分子內(nèi)轉(zhuǎn)酯反應(yīng);B. NMIA 修飾后形成穩(wěn)定的復(fù)合物Fig. 1-3 Principle of the structural probing.A. Transesterification of nucleotides; B. NMIA reacts preferentially with the 2'-hydroxyl group in flexible nucleotides toform a stable 2'-O-ester adduct1.5 煙草叢頂病毒的研究進展煙草叢頂病是近年來我國云南西部煙區(qū)頻繁爆發(fā)流行的一種煙草病害(李凡等,2001),感病煙株葉色淡綠或黃化,并伴有系統(tǒng)壞死枯斑或壞死線紋,苗期感病煙株嚴(yán)重矮化、縮頂,晚期感病煙株腋芽過度增生。煙草叢頂病最早發(fā)生在津巴布韋,對該國的煙草生產(chǎn)造成了嚴(yán)重威脅(Ndowora et al., 2002)。另外,煙草叢頂病還引起了幾次大規(guī)模的損失,包括 1960 年在非洲南部國家(Gates et al., 1962)和 1990 年在中國云南省的大爆發(fā)(Chen et al., 2006)。從 1993 到 2001 年間,煙草從頂病造成我國云南煙區(qū)的 51,300 公頃煙草感染病害,直接經(jīng)濟損失近千萬(Mo et al., 2003)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2種類型的煙草扭脈病毒外殼蛋白基因的序列和結(jié)構(gòu)分析[J]. 張振甲,王德亞,于成明,王增輝,師科榮,李凡,原雪峰. 植物病理學(xué)報. 2016(02)
[2]煙草叢頂病毒ORF1蛋白的多克隆抗體制備及應(yīng)用[J]. 王國魯,王德亞,于成明,原雪峰. 植物病理學(xué)報. 2016(01)
[3]煙草叢頂病穴TBTV雪傳毒特性及寄主范圍研究[J]. 段玉琪,秦西云,莫笑晗,王曉云,譚仲夏. 中國煙草科學(xué). 2003(04)
[4]云南煙草叢枝癥病害初步研究[J]. 李凡,周雪平,蔡紅,陳海如,李德葆. 植物病理學(xué)報. 2001(04)
本文編號:3342962
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:115 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
真核細(xì)胞mRNA翻譯模式圖(Jacksonetal.,2005;Dresiosetal.,2006;Deforgesetal.,2015)
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文僅可以與 eIF4F 互作,還和 5’UTR 存在遠距離的 RNA-RNA 互作,將 eIF4F 傳遞到 5’末端以高效的起始翻譯(Nicholson et al., 2010)。玉米壞死條紋病毒的 5’端也會形成類似 TBSV 5’端形成的 T 型結(jié)構(gòu)域,并且和其不依賴帽子翻譯調(diào)控元件(I-Shape結(jié)構(gòu))存在遠距離的RNA-RNA互作(Miller et al., 2007)。
圖 1-3 結(jié)構(gòu)分析原理圖(Soukup and Breaker, 2009;Wilkinsone et al., 2006;Smola et al., 2015)A. 分子內(nèi)轉(zhuǎn)酯反應(yīng);B. NMIA 修飾后形成穩(wěn)定的復(fù)合物Fig. 1-3 Principle of the structural probing.A. Transesterification of nucleotides; B. NMIA reacts preferentially with the 2'-hydroxyl group in flexible nucleotides toform a stable 2'-O-ester adduct1.5 煙草叢頂病毒的研究進展煙草叢頂病是近年來我國云南西部煙區(qū)頻繁爆發(fā)流行的一種煙草病害(李凡等,2001),感病煙株葉色淡綠或黃化,并伴有系統(tǒng)壞死枯斑或壞死線紋,苗期感病煙株嚴(yán)重矮化、縮頂,晚期感病煙株腋芽過度增生。煙草叢頂病最早發(fā)生在津巴布韋,對該國的煙草生產(chǎn)造成了嚴(yán)重威脅(Ndowora et al., 2002)。另外,煙草叢頂病還引起了幾次大規(guī)模的損失,包括 1960 年在非洲南部國家(Gates et al., 1962)和 1990 年在中國云南省的大爆發(fā)(Chen et al., 2006)。從 1993 到 2001 年間,煙草從頂病造成我國云南煙區(qū)的 51,300 公頃煙草感染病害,直接經(jīng)濟損失近千萬(Mo et al., 2003)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2種類型的煙草扭脈病毒外殼蛋白基因的序列和結(jié)構(gòu)分析[J]. 張振甲,王德亞,于成明,王增輝,師科榮,李凡,原雪峰. 植物病理學(xué)報. 2016(02)
[2]煙草叢頂病毒ORF1蛋白的多克隆抗體制備及應(yīng)用[J]. 王國魯,王德亞,于成明,原雪峰. 植物病理學(xué)報. 2016(01)
[3]煙草叢頂病穴TBTV雪傳毒特性及寄主范圍研究[J]. 段玉琪,秦西云,莫笑晗,王曉云,譚仲夏. 中國煙草科學(xué). 2003(04)
[4]云南煙草叢枝癥病害初步研究[J]. 李凡,周雪平,蔡紅,陳海如,李德葆. 植物病理學(xué)報. 2001(04)
本文編號:3342962
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