基于轉錄組的蘋小卷葉蛾殺蟲劑靶標及解毒代謝相關基因分析
發(fā)布時間:2021-05-17 23:45
【目的】建立蘋小卷葉蛾Adoxophyes orana轉錄組數(shù)據(jù)庫,挖掘殺蟲劑靶標及解毒代謝相關基因!痉椒ā坎捎肐llumina HiSeqTM 2000高通量測序技術對蘋小卷葉蛾進行轉錄組測序,挖掘并分析殺蟲劑靶標基因;利用qPCR檢測6個殺蟲劑靶標基因在蘋小卷葉蛾卵、幼蟲、蛹和成蟲各不同發(fā)育階段的表達;挖掘并分析蘋小卷葉蛾轉錄組中解毒代謝相關基因的代謝通路及進化關系!窘Y果】通過組裝有效序列共獲得48 610條unigene(GenBank登錄號:GGMW00000000)。挖掘鑒定到155個殺蟲劑靶標unigene;qPCR結果顯示,1個蛻皮激素受體(ecdysone receptor, ECR)、2個乙酰膽堿酯酶(acetylcholinesterase, AChE)、1個氯離子通道蛋白(chloride channel, CLC)、1個幾丁質酶(chitinase, CS)和1個魚尼丁受體(ryanodine receptor, RyR)基因在蘋小卷葉蛾不同發(fā)育階段均存在表達差異。挖掘鑒定到69個羧酸酯酶(carboxylesterase, CarE)...
【文章來源】:昆蟲學報. 2020,63(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 害蟲飼養(yǎng)
1.2 cDNA文庫構建和測序
1.3 生物信息學分析
1.4 殺蟲劑靶標基因的鑒定及表達模式分析
1.5 解毒代謝相關基因的挖掘及代謝通路、進化關系分析
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結果
2.1 蘋小卷葉蛾轉錄組組裝結果
2.2 蘋小卷葉蛾轉錄組中unigenes的功能注釋及序列特征
2.3 蘋小卷葉蛾轉錄組中殺蟲劑靶標基因的預測及表達模式分析
2.4 蘋小卷葉蛾轉錄組中解毒代謝相關基因的挖掘、代謝通路及進化關系分析
3 討論
本文編號:3192687
【文章來源】:昆蟲學報. 2020,63(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 害蟲飼養(yǎng)
1.2 cDNA文庫構建和測序
1.3 生物信息學分析
1.4 殺蟲劑靶標基因的鑒定及表達模式分析
1.5 解毒代謝相關基因的挖掘及代謝通路、進化關系分析
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結果
2.1 蘋小卷葉蛾轉錄組組裝結果
2.2 蘋小卷葉蛾轉錄組中unigenes的功能注釋及序列特征
2.3 蘋小卷葉蛾轉錄組中殺蟲劑靶標基因的預測及表達模式分析
2.4 蘋小卷葉蛾轉錄組中解毒代謝相關基因的挖掘、代謝通路及進化關系分析
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