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水稻抗、感稻瘟病材料鑒定技術(shù)體系研發(fā)、集成與應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2020-07-18 17:02
【摘要】:稻瘟病是限制水稻高產(chǎn)的主要病害之一。由于稻瘟病菌生理小種的易變性,所推廣的抗稻瘟病品種常常在種植不久之后就喪失其抗病性,導(dǎo)致其失去使用價(jià)值。因此,快速、有效地篩選和利用優(yōu)良的抗稻瘟病品種一直是國內(nèi)外研究重點(diǎn)。其中,抗稻瘟病基因分子鑒定是水稻抗稻瘟病材料輔助選擇的重要方面。針對(duì)目前抗稻瘟病基因分子鑒定主要是以DNA為模板定性檢測(cè)水稻中抗性基因的有無及組成,不能鑒定抗稻瘟病功能基因是否表達(dá)的不足,本文以水稻所含的稻瘟病抗性基因(已被克隆,且為江蘇省水稻品種的主要抗病基因)為對(duì)象,集成和研發(fā)了抗稻瘟病功能基因組成、表達(dá)鑒定和病菌接種鑒定技術(shù)體系。主要研究結(jié)果如下:1.稻瘟病菌的培養(yǎng)及接種方法比較本實(shí)驗(yàn)首先對(duì)所收集和保存的稻瘟病菌進(jìn)行培養(yǎng),獲得稻瘟病菌孢子液。在此期間對(duì)水稻進(jìn)行培養(yǎng),于三葉一心期分別用噴施法、創(chuàng)傷法、誘發(fā)法進(jìn)行稻瘟病菌接種,結(jié)果表明,創(chuàng)傷法對(duì)水稻傷害較大,易造成水稻枯萎,影響結(jié)果。所以噴施法接種相對(duì)較好。2.抗稻瘟病基因鑒定方法的研發(fā)、集成與應(yīng)用利用水稻稻瘟病抗性基因的分子標(biāo)記,研發(fā)了同時(shí)檢測(cè)稻瘟病抗性基因Pikh與Pi1的多重PCR體系,集成了同時(shí)檢測(cè)稻瘟病抗性基因Pita與Pib的多重PCR體系。由于Pikm是由兩個(gè)緊密連鎖的具有獨(dú)立功能NBS-LRR類基因組成,故建立了分別檢測(cè)Pikm1-TS和Pikm2-TS兩個(gè)片段的Pikm基因鑒定方法。并用這兩套體系和Pikm基因鑒定方法對(duì)江蘇潤揚(yáng)種業(yè)股份有限公司所選育的114份雜交后代水稻材料中的抗病基因Pita、Pib、Pikh、Pi1和Pikm進(jìn)行了檢測(cè),以確定這些雜交后代水稻材料中抗稻瘟病基因的分布情況。檢測(cè)結(jié)果表明,114份材料中含抗稻瘟病基因Pita的有81份,含Pib的有106份,含Pikh的有35份,含Pikm的有13份,含Pi1的僅有3份。分別占檢測(cè)材料的71.0%、92.9%、30.7%、11.4%、2.6%,表明了Pib、Pita和Pikh這三個(gè)抗稻瘟病基因廣泛存在于江蘇潤揚(yáng)種業(yè)股份有限公司所選育的雜交后代水稻材料中。這可能與該公司在雜交配組時(shí)注重對(duì)抗稻瘟病親本的選擇和選育過程中長(zhǎng)期注重對(duì)稻瘟病抗性的篩選有關(guān)。3.水稻對(duì)穗頸瘟抗性的稻瘟病菌接種鑒定對(duì)田間水稻進(jìn)行稻瘟病菌接種,接種7 d后進(jìn)行病情調(diào)查。穗頸瘟接種鑒定結(jié)果表明:114份材料中經(jīng)人工接種鑒定表現(xiàn)為高抗的有2份,抗病的有27份,中抗的有32份,感病的有33份,高感的有20份。分別占鑒定總數(shù)的1.7%、23.7%、28.1%、28.9%、17.5%?沟疚敛』蚝退腩i瘟抗性之間的相關(guān)性分析表明:Pita、Pikh基因與穗頸瘟的抗性呈顯著(P0.05)的正相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別為0.297、0.239。Pib、Pi1和Pikm基因與穗頸瘟的抗性之間相關(guān)性不顯著。4.水稻對(duì)稻瘟病抗性的基因表達(dá)評(píng)價(jià)本試驗(yàn)針對(duì)多數(shù)育種單位不具備配備熒光定量PCR儀的實(shí)際情況,研發(fā)了抗稻瘟病基因表達(dá)水平的半定量RT-PCR便捷檢測(cè)技術(shù)。以Ubq5為內(nèi)參,選擇Pb、Pita和Pikh為抗性基因進(jìn)行檢測(cè)。在所抽檢的11個(gè)材料中,盡管Pita基因是組成型表達(dá),但經(jīng)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)在抗稻瘟病材料中該基因的表達(dá)仍然受到稻瘟病菌接種的誘導(dǎo)。Pikh和Pib基因是誘導(dǎo)型表達(dá),稻瘟病菌接種后Pikh和Pib基因在抗稻瘟病材料中上調(diào)表達(dá),而在感稻瘟病材料中Pikh和Pib基因均明顯下調(diào)表達(dá)。這表明,在抗稻瘟病水稻材料中抗稻瘟病基因Pib、Pita和Pikh的表達(dá)受到稻瘟病菌接種處理的誘導(dǎo),而在感稻瘟病水稻材料中這種表達(dá)誘導(dǎo)作用不明顯,甚至Pikh和Pib基因出現(xiàn)表達(dá)下調(diào)。這一方面說明,抗稻瘟病基因表達(dá)水平可用于對(duì)含有抗稻瘟病主效基因水稻品種的抗性評(píng)價(jià),另一方面說明,瘟病菌接種處理后抗稻瘟病基因的差異表達(dá)能更合理解釋在生產(chǎn)上某些含有抗稻瘟病主效基因的水稻品種其抗性經(jīng)常表現(xiàn)不理想的現(xiàn)象。5.水稻受稻瘟病侵染標(biāo)志基因預(yù)測(cè)方法的建立根據(jù)轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測(cè)結(jié)果,篩選出一個(gè)有可能作為一個(gè)水稻是否受到稻瘟病侵染的標(biāo)志基因(Barwin),經(jīng)本文所研發(fā)的半定量RT-PCR檢測(cè)發(fā)現(xiàn),不管在抗稻瘟病材料還是感稻瘟病材料中Barwin基因均隨稻瘟病菌接種時(shí)間的推移其表達(dá)量逐步升高。因此,可通過檢測(cè)Barwin基因表達(dá)水平隨時(shí)間的變化來預(yù)測(cè)特定品種或特定田塊的水稻是否受到稻瘟病侵染。6.感稻瘟病材料標(biāo)志基因表達(dá)鑒定方法的建立根據(jù)轉(zhuǎn)錄組學(xué)檢測(cè)結(jié)果,篩選出兩個(gè)有可能作為感稻瘟病水稻材料鑒定的標(biāo)志基因,即與防御相關(guān)的幾丁質(zhì)酶3和葡聚糖內(nèi)切-β-1,3-葡萄糖苷酶基因。據(jù)此,本文設(shè)計(jì)引物并建立了這兩個(gè)基因表達(dá)水平的半定量RT-PCR檢測(cè)方法。檢測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn),這兩個(gè)基因的表達(dá)在感稻瘟病水稻材料中受到稻瘟病菌接種的顯著誘導(dǎo),在抗稻瘟病材料中未見表達(dá)或者表達(dá)量很低。因此,可以通過檢測(cè)這兩個(gè)基因在稻瘟病菌接種條件下的表達(dá)水平鑒別某水稻材料是否為感稻瘟病材料。
【學(xué)位授予單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S435.111.41
【圖文】:

體系,基因,抗稻瘟病基因,材料


以去年己鑒定的4個(gè)材料,P32邋(含有尸/to、P/6、朽姑、Pz7基因)、P165邋(含P沾基逡逑因)、P178邋(含戶/to、尸訪、P/妨基因)、P218邋(含P/6、乃7基因)為DNA模板進(jìn)行PCR逡逑擴(kuò)增的優(yōu)化,優(yōu)化結(jié)果見圖3-3。圖3-3表明,本試驗(yàn)己成功研發(fā)出能同時(shí)檢測(cè)P/從和P/7逡逑基因的多重PCR體系I,同時(shí)建立了能同時(shí)檢測(cè)和乃Ya基因多重PCR體系II,并且逡逑能擴(kuò)增出和八7、和基因片段清晰的條帶(圖3-3)。逡逑圖3-3體系I和體系IIPCR擴(kuò)增優(yōu)化結(jié)果逡逑Fig.3-3邋The邋optimization邋results邋of邋system邋I邋and邋system邋II邋PCR邋amplification逡逑注:A表示體系I的優(yōu)化結(jié)果;B表示體系II的優(yōu)化結(jié)果。逡逑利用水稻抗稻瘟病基因P/妨和Pz7、P/ta和的多重PCR檢測(cè)體系,于2017年對(duì)逡逑江蘇潤揚(yáng)種業(yè)股份有限公司所選育的114份雜交后代水稻材料中的抗稻瘟病基因組成進(jìn)行逡逑了檢測(cè),不同水稻材料中抗稻瘟病基因組成的多重PCR檢測(cè)結(jié)果圖3-4和3-5所示,圖3-4逡逑顯示了朽似和P沾的檢測(cè)結(jié)果,圖3-5顯示了邋P/M和八7的檢測(cè)結(jié)果。含乃Ya、/%和尸拙、逡逑朽7基因的材料可以分別擴(kuò)增出1024邋bp、365邋bp和216/359邋bp、460邋bp的特異性片段,不逡逑含抗性基因的材料則無擴(kuò)增產(chǎn)物。經(jīng)檢測(cè),114份材料中含稻瘟病基因P/to的81份,含逡逑P泌的有106份,含尸焌的35份

循環(huán)數(shù),抗稻瘟病


注:從左至右依次是Maker;邋18?jìng)(gè)循環(huán);20個(gè)循環(huán);22個(gè)循環(huán);24個(gè)循環(huán);26個(gè)循環(huán);28?jìng)(gè)循環(huán)。逡逑將22個(gè)材料分為抗稻瘟病和感稻瘟病兩組,分別進(jìn)行模板濃度的調(diào)試,使各個(gè)材料逡逑在24個(gè)循環(huán)時(shí)Ubq5的亮度保持一致。調(diào)試結(jié)果如圖3-8和圖3-9。圖中結(jié)果表明,各樣逡逑品cDNA濃度基本調(diào)適一致,可以進(jìn)行各基因的半定量分析。逡逑

循環(huán)數(shù),基因,調(diào)試結(jié)果,抗稻瘟病基因


邐43逡逑i?§:L—.羞」逡逑圖3-8抗稻瘟病材料模板濃度的調(diào)試結(jié)果逡逑Fig.3-8邋Debugging邋results邋of邋template邋concentration邋in邋rice邋blast邋resistance邋material逡逑注:從左至右依次是Maker;邋】035處理、j035對(duì)照、JI045處理、〗045對(duì)照、】059處理、j059對(duì)照、j070逡逑處理、J070對(duì)照、J085處理、J085對(duì)照、Jll丨處理、川1對(duì)照、J131處理、J131對(duì)照材料的Ubq5表逡逑達(dá)量。逡逑圖3-9感稻瘟病材料模板濃度的調(diào)試結(jié)果逡逑Fig.3-9邋Debugging邋results邋of邋template邋concentration邋in邋rice邋blast邋susceptible邋material逡逑注:從左至右依次是Maker;邋K)19處理、*J019對(duì)照、J024處理、J024對(duì)照、*1065處理、J065對(duì)照、J125逡逑處理、J125對(duì)照材料的Ubq5表達(dá)量。逡逑3.邋7.邋2抗稻瘟病基因表達(dá)水平的半定量RT-PCR檢測(cè)逡逑對(duì)各個(gè)基因進(jìn)行循環(huán)數(shù)

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2761174

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