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基于組學分析的短密木霉降解咪唑乙煙酸基因鑒定

發(fā)布時間:2020-05-17 11:49
【摘要】:咪唑乙煙酸(Imazethapyr)是我國農(nóng)田中常用的除草劑之一,因咪唑乙煙酸除草效果好,價格低廉,被廣泛應用與推廣,特別是黑龍江省大豆田中使用量較大,但咪唑乙煙酸的長殘性使其長期殘留在土壤中,給農(nóng)作物輪作帶來了一定的困難,也給環(huán)境帶來了巨大壓力,因此找到咪唑乙煙酸降解機制,對解決咪唑乙煙酸的污染問題至關重要。為研究短密木霉(Trichodermta brevicompactum)發(fā)酵液對咪唑坐乙煙酸的降解能力,用富集培養(yǎng)基培養(yǎng)短密木霉,分別取3、5、7、9和11d的發(fā)酵液,同時用無機鹽培養(yǎng)基和含咪唑乙煙酸的無機鹽培養(yǎng)基分別培養(yǎng)短密木霉。將不同發(fā)酵液分別進行離心處理獲得發(fā)酵液上清,用0.22 μm和0.45 μm微孔混合濾膜抽濾獲得發(fā)酵液抽濾液。不同發(fā)酵液的降解率結(jié)果為:發(fā)酵液上清0.22 μm混合濾膜抽濾液,發(fā)酵液上清0.45 μm混合濾膜抽濾液,0.45 μm混合濾膜抽濾液和0.22 μm混合濾膜抽濾液無明顯區(qū)別;富集培養(yǎng)基發(fā)酵液中,第7 d降解率相對較高。為探究短密木霉降解咪唑乙煙酸的蛋白質(zhì)表達變化和相關代謝途徑并鑒定咪唑乙煙酸降解基因,進行了蛋白質(zhì)組測序,完成了蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)聯(lián)合分析。利用同重同位素相對與絕對定量(Isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRA Q)技術分析咪唑乙煙酸對短密木霉蛋白組的影響。蛋白質(zhì)組共鑒定到4003個蛋白質(zhì),差異表達蛋白有353個,184個蛋白上調(diào),169個蛋白下調(diào);在差異蛋白顯著富集的GO條目中,生物過程有195個差異表達的蛋白,富集在351條通路中,細胞組分中有129個差異表達蛋白,富集在62條通路中,分子功能中有220個差異表達的蛋白,富集在157條通路中;KEGG富集通路分析結(jié)果顯示,有258個差異蛋白富集在105條通路中。通過蛋白質(zhì)組分析,可有效找到短密木霉降解咪唑乙煙酸的相關蛋白,進而了解其代謝途徑,為降解咪唑乙煙酸提供蛋白質(zhì)水平和代謝水平的分子理論基礎。完成了蛋白質(zhì)組與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行關聯(lián)分析。定量蛋白質(zhì)和基因的表達關聯(lián)系數(shù)為-0.0472,顯著差異蛋白質(zhì)和顯著差異基因表達關聯(lián)系數(shù)為-0.1420,表達變化趨勢相同蛋白質(zhì)和基因表達關聯(lián)系數(shù)為-0.7413,表達變化趨勢相反蛋白質(zhì)和基因表達關聯(lián)系數(shù)為-0.7916;關聯(lián)到24個差異表達基因與蛋白豐度相應變化,其中表達趨勢相同有12個基因,同時上調(diào)7個,同時下調(diào)5個;同時上調(diào)的7個基因NCBInr數(shù)據(jù)庫中功能已知的基因有2個,分別為TBU1425A和TBU3981A。經(jīng)Q-pcr驗證,表達變化趨勢與蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組一致,將TBU1425A和TBU3981A基因作為降解咪唑乙煙酸的候選基因。
【圖文】:

咪唑乙煙酸,咪草煙,化學結(jié)構(gòu)圖


的雜草防治,多用于我國大豆產(chǎn)區(qū)防治雜草[1]。特別是在黑龍江省農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,咪唑乙逡逑煙酸作出了巨大的貢獻。逡逑咪唑乙煙酸化學結(jié)構(gòu)見圖1-1,化學名稱為(RS)邋-5-乙基-2-邋(4-異丙基-4-甲基-5-逡逑1H-2-咪挫啉-2-基)煙酸[2],英文通用名imazapyr,商品名有arsenal、assaul、滅草煙和逡逑阿時拉等,具有殺草種類多、活性高、選擇性強等優(yōu)點。咪唑乙煙酸可以抑制乙酰乳酸逡逑合成酶(AcetolactateSynthase,邋ALS),阻礙蛋白質(zhì)合成,進而抑制植物的生長而死亡。逡逑在豆科植物在體內(nèi),咪唑乙煙酸吸收后很快被分解,對大豆生長發(fā)育沒有影響,因此成逡逑為大豆田中優(yōu)良而常用的除草劑[3,4]。但因其殘留期較長,易對后茬作物產(chǎn)生藥害,并逡逑且咪唑乙煙酸使用量仍在逐年增加,對未來我國的農(nóng)業(yè)經(jīng)濟發(fā)展也將產(chǎn)生重大威脅,,同逡逑時也將會帶來食品安全問題,因此解決咪唑乙煙酸的污染問題迫在眉睫。逡逑_邋八邋COOH逡逑圖1-1咪唑乙煙酸(咪草煙)化學結(jié)構(gòu)圖逡逑Figurel-1邋Chemical邋structure邋of邋imazapyr逡逑1.1.1邐_乙煙賊留的危害逡逑1990年我國開始批量進口咪唑乙煙酸并在黑龍江省應用

咪唑乙煙酸,液相色譜圖,水溶液


逡逑效液相圖,由圖2-1可知:咪唑乙煙酸的保留時間為6.269邋min。逡逑1-80:邐I邐|逡逑|逡逑1.60-邐g邐.逡逑1.40..逡逑1.20邋j逡逑1.00邋!逡逑?邋1逡逑0.80邋j逡逑0.60-J逡逑①.邐i逡逑0邋20邋J邐Z邋?邋s邋!邐s邋§逡逑j邐SI邐^邋i邋\逡逑n邋nn邋1邐£邐邐I邋.…X邐00、00邐逡逑U.UU邋■邐ij邐T:.邐 ̄邐?;邐Hr邋\5邋T.逡逑1.00邐2.00邐3.00邐4.00邐5.00邐6.00邐7.00邐8.00邐9.00邐10.00逡逑分鐘逡逑圖2-1咪唑乙煙酸水溶液液相色譜圖逡逑Figure邋2-1邋Liquid邋chromatogram邋of邋aqueous邋solution邋of邋imazapyr逡逑2.2.2邋_乙煙酸標準曲線逡逑咪唑乙煙酸標準品用超純水溶解,濃度為100-1000邋mg/kg,與色譜峰面積繪制標準逡逑曲線:y=8504x+20393
【學位授予單位】:東北林業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S481.8

【參考文獻】

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本文編號:2668499

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