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動物源和人源金黃色葡萄球菌的種屬特異性標(biāo)志物研究

發(fā)布時間:2021-04-22 20:37
  目的:掌握不同動物源和人源金黃色葡萄球菌(簡稱金葡菌)的耐藥和毒素基因流行情況;并比較不同來源菌株之間的分子型別和分子特征的差異,以揭示不同來源金葡菌的特異性表型和分子標(biāo)志物。為預(yù)測動物相關(guān)金葡菌跨種屬傳播風(fēng)險提供重要理論依據(jù),以有效控制和遏制動物相關(guān)金葡菌向人群傳播。方法:采用橫斷面研究設(shè)計,對廣東省珠三角地區(qū)4個城市(深圳市、佛山市、東莞市、江門市)的動物和人群進(jìn)行鼻拭子采樣。所有金葡菌進(jìn)行抗生素敏感性試驗(yàn),運(yùn)用PCR擴(kuò)增技術(shù)檢測耐藥基因(erm(A)/erm(C)、linA等)、超抗原毒素基因(中毒性休克綜合征毒素基因tsst1和腸毒素基因sea、seb、sec等)、免疫逃逸集群(IEC)基因(scn、chp、sak、sea、sep)、溶血毒素基因(hla、hlb、hld)殺白細(xì)胞毒素pvl基因、粘附因子相關(guān)基因(bbp、clfA、cna等);應(yīng)用多位點(diǎn)序列分型MLST實(shí)驗(yàn)得到金葡菌的分子型別。采用χ2檢驗(yàn)或者確切概率法、logistic回歸進(jìn)行各組率的比較,通過對應(yīng)分析揭示不同來源金葡菌中CC分型和表型-分子特征之間的對應(yīng)關(guān)系。研究金葡菌來源(動物源、人源... 

【文章來源】:廣東藥科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】:100 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 前言
第二章 材料與方法
    2.1 倫理學(xué)
    2.2 研究對象
        2.2.1 人群樣本來源
        2.2.2 動物樣本來源
        2.2.3 估計樣本量
    2.3 標(biāo)本收集
        2.3.1 人群標(biāo)本的采集
        2.3.2 動物標(biāo)本的采集
    2.4 主要培養(yǎng)基、試劑
        2.4.1 培養(yǎng)基
        2.4.2 試劑
        2.4.3 藥敏實(shí)驗(yàn)材料
        2.4.4 PCR實(shí)驗(yàn)材料
    2.5 金葡菌的分離鑒定
    2.6 金葡菌分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
        2.6.1 菌株DNA的提取
        2.6.2 菌株的分子分型和分子特征
        2.6.3 引物的設(shè)計
        2.6.4 反應(yīng)體系
        2.6.5 擴(kuò)增條件
        2.6.6 MLST分型和確定克隆復(fù)合體(CCs)
    2.7 金葡菌的抗菌藥物敏感性試驗(yàn)
        2.7.1 藥敏紙片選取
        2.7.2 紙片擴(kuò)散法實(shí)驗(yàn)
        2.7.3 多藥耐藥性金葡菌
    2.8 相關(guān)定義
    2.9 數(shù)據(jù)分析
    2.10 質(zhì)量控制
        2.10.1 現(xiàn)場采樣的質(zhì)量控制
        2.10.2 實(shí)驗(yàn)室的質(zhì)量控制
第三章 結(jié)果
    3.1 人群和動物金葡菌(MRSA)菌株的克隆群分布情況
    3.2 動物源和人源金葡菌表型和分子特征的比較
        3.2.1 動物源和人源金葡菌的耐藥情況比較
        3.2.2 動物源和人源金葡菌的毒素基因攜帶情況比較
    3.3 動物源和人源MRSA表型和分子特征的比較
        3.3.1 動物源與人源MRSA的耐藥情況比較
        3.3.2 動物源和人源MRSA的毒素基因攜帶情況比較
    3.4 動物源和人源金葡菌克隆群與表型和分子特征的關(guān)聯(lián)性分析
        3.4.1 金葡菌克隆群與腸毒素基因數(shù)量的關(guān)聯(lián)性分析
        3.4.2 金葡菌克隆群與粘附基因數(shù)量的關(guān)聯(lián)性分析
        3.4.3 金葡菌克隆群與IEC基因數(shù)量的關(guān)聯(lián)性分析
        3.4.4 金葡克隆群與溶血毒素基因數(shù)量的關(guān)聯(lián)性分析
        3.4.5 克隆群與耐藥模式的關(guān)聯(lián)性分析
    3.5 隨機(jī)森林和分類與回歸樹探究不同來源菌株的表型和分子特征
        3.5.1 耐藥表型
        3.5.2 耐藥基因
        3.5.3 IEC基因
        3.5.4 腸毒素基因
        3.5.5 溶血毒素基因
        3.5.6 粘附因子基因
第四章 討論
    4.1 動物相關(guān)和社區(qū)相關(guān)菌株的流行克隆群
    4.2 菌株的分子分型與表型-分子特征間對應(yīng)關(guān)系
    4.3 不同來源菌株的表型和分子特征標(biāo)志
    4.4 本研究優(yōu)點(diǎn)與不足
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士論文學(xué)位期間發(fā)表的論文


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]耐甲氧西林金黃色葡萄球菌不同來源株耐藥性及流行特征分析[J]. 趙紅慶,徐萍,周聲安,胡守奎.  疾病監(jiān)測. 2017(07)
[2]金黃色葡萄球菌基因組DNA提取方法的比較[J]. 蘇麗婷,梁景龍,郭小建,馮飛.  仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院學(xué)報. 2011(01)



本文編號:3154430

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