自然界中,宿主與寄生生物之間的競(jìng)爭(zhēng)一直存在。宿主必須不斷進(jìn)化出新的抵抗寄生生物的機(jī)制以避免滅絕。反過來,寄生生物會(huì)進(jìn)化出新機(jī)制來抵抗這些防御措施。這種生存之戰(zhàn)在細(xì)菌-噬菌體共同進(jìn)化動(dòng)力學(xué)中得以體現(xiàn),其中細(xì)菌會(huì)進(jìn)化出先天性免疫系統(tǒng)和適應(yīng)性免疫的規(guī)律成簇間隔短回文重復(fù)序列（CRISPR-Cas）系統(tǒng)。CRISPR-Cas防御的特點(diǎn)是利用CRISPR RNA（crRNA）對(duì)入侵遺傳元件進(jìn)行序列特異性靶向并降解。與此同時(shí),噬菌體會(huì)編碼抵抗CRISPR-Cas系統(tǒng)的抗CRISPR蛋白（Acr）來入侵細(xì)菌。由于Acr蛋白的獨(dú)特作用機(jī)制,其可以被應(yīng)用于構(gòu)建轉(zhuǎn)錄抑制系統(tǒng),以及作為基因編輯的特異性抑制劑來提高基因治療的安全性。II類型的CRISPR-Cas9系統(tǒng)憑借其高效、快速、簡(jiǎn)便、高特異性等特點(diǎn)被廣泛應(yīng)用于基因治療,疾病模型的構(gòu)建,臨床診斷和生物大反應(yīng)器等。CRISPR-Cas9系統(tǒng)主要包括三個(gè)核心組分,其中反式激活crRNA（tracrRNA）具有保守的促進(jìn)crRNA成熟和間隔序列整合的功能,這對(duì)于CRISPR-Cas9系統(tǒng)的功能發(fā)揮具有重要作用。目前針對(duì)抗CRISPR系統(tǒng)僅鑒定到Acr蛋白,基于... 

【文章來源】：沈陽(yáng)化工大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

CRISPR-Cas9系統(tǒng)的示意圖

沈陽(yáng)化工大學(xué)碩士學(xué)位論文 第三章 結(jié)果與討論第三章 結(jié)果與討論3.1 細(xì)菌基因組中 tracrRNA 序列的確定3.1.1 六種細(xì)菌基因組的獲取我們首先輸入 Genbank 號(hào)（II-A：釀膿鏈球菌 M1 476（AP012491.2），變形鏈球菌 UA159（NC_004350.2）和無害李斯特菌 Clip11262（NC_003212）；II-B：弗朗西斯氏菌 novicida U112（NC_008601.1）；II-C：空腸彎曲桿菌 NCTC 11168（NC_002163.1）和腦膜炎奈瑟球菌 Z2491（NC_003116.1）），保存序列的 fasta 文件或者單擊 fasta 來查看序列，具體操作以釀膿鏈球菌 M1 476 為例（圖 3-1）。

學(xué)碩士學(xué)位論文 第形鏈球菌UA159GTTGGAATCATTCGAAACAACACAGCAAGTTAAAATAAGGCAGTGATTTAATCCAGTCCGTACACAACTTGAAAAAGTGCGCACCGATTCGGTGCTTT李斯特菌lip11262ATTGTTAGTATTCAAAATAACATAGCAAGTTAAAATAAGGCTTTGTCCGTTCAACTTTTAATTAAGTAGCGCTGTTTCGGCGCTTT西斯氏菌icida U112ATCTAAAATTATAAATGTACCAAATAATTAATGCTCTGTAATCATTTAAAATTTTGAACGGACCTCTGTTTGACACGTCTGAATAACTAAAAA彎曲桿菌TC 11168AAGAAATTTAAAAAGGGACTAAAATAAAGAGTTTGCGGGACTCTGCGGGTACAATCCCCTAAAACCGCTTTT炎奈瑟球菌Z2491ACATATTGTCGCACTGCGAAATGAGAACCGTTGCTACAATAAGGCCGTCTAAGATGTGCCGCAACGCTCTGCCCCTTAAAGCTTCTGCTTTAAGGGGCA


本文編號(hào)：3051841