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高毒力肺炎克雷伯菌基因組序列分析及其與中性粒細(xì)胞的作用機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2020-12-24 02:49
  背景:高毒力肺炎克雷伯菌(HypervirulentKlebsiella pneumoniae,HvKP)常導(dǎo)致健康人群的嚴(yán)重社區(qū)獲得性感染,而且感染易于發(fā)生多部位的播散。HvKP菌株具有較厚的莢膜,攜帶rmpA和aerobactin等毒力基因,毒力明顯高于普通肺炎克雷伯菌(classic Klebsiellapneumoniae,cKP)。中性粒細(xì)胞可以通過胞內(nèi)吞噬和胞外釋放中性粒細(xì)胞胞外誘捕網(wǎng)(Neutrophil extracellular traps,NETs)2種途徑抵抗病原微生物的感染。為了揭示HvKP高毒力和高致病性的機(jī)制,選取了 6株HvKP進(jìn)行第三代測(cè)序和分析,并進(jìn)一步研究人體中性粒細(xì)胞在抗HvKP感染中的作用。方法:選取不同莢膜血清分型的6株HvKP菌株(K1、K2、K57型HvKP各2株),利用PacBio第三代單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)(SMRT)進(jìn)行測(cè)序,主要從毒力基因、耐藥基因兩方面展開分析,探索HvKP高致病性及高毒力的遺傳基礎(chǔ)。根據(jù)黏液絲試驗(yàn)、莢膜血清分型、rmpA和aerobactin基因檢測(cè)結(jié)果,本研究共篩選了 45株肺炎克雷伯菌,包括16株HvKP-K1、... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】:94 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

高毒力肺炎克雷伯菌基因組序列分析及其與中性粒細(xì)胞的作用機(jī)制研究


圖1?6株HvKP基因組圈圖??大圈為染色體基因組,小圈為質(zhì);蚪M??

序列,聚類,基因功能,染色體基因


大圈為染色體基因組,小圈為質(zhì);蚪M??3.5測(cè)序菌株染色體與質(zhì);蚬δ芫垲??本研究中6株HvKP的染色體基因功能聚類無(wú)明顯差別(圖2A),但是對(duì)質(zhì);??因的功能聚類發(fā)現(xiàn),除編號(hào)為11305菌株外,其他5株測(cè)序菌株質(zhì)粒上多數(shù)基因與菌??株毒力、致病性、抗性以及鐵載體相關(guān)(圖2B),可見質(zhì)粒在肺炎克雷伯菌中發(fā)揮重??要的作用。值得注意的是,編號(hào)為11305菌株的質(zhì);蚪M序列與其他5個(gè)菌株差別??較大,此菌株缺失了與毒力緊密相關(guān)的rm/M基因,攜帶一個(gè)耐藥性質(zhì)粒,該質(zhì)粒上??含有編碼耐碳青霉烯類、氨基糖苷類和喹諾酮類藥物的耐藥基因??和gw?沿

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基因(編號(hào)為11420和11492)以及編碼聚酮肽基因毒素(colibactin)的??c歷基因(編號(hào)為11420、11492和KP52.145),但cKP均不含有編碼微菌素的mce??基因和編碼colibactin的基因(見圖4)。??進(jìn)一步對(duì)KJ、K2、K57型HvKP菌株和cKP菌株的毒力基因數(shù)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)??果顯示,編號(hào)為11420菌株含有75個(gè)毒力基因,編號(hào)為11492菌株含有69個(gè)毒力基??因,編號(hào)為11454菌株含有22個(gè)毒力基因,編號(hào)為11305菌株含有9個(gè)毒力基因,??編號(hào)為11311和23菌株均含有18?jìng)(gè)毒力。分析結(jié)果顯示K1型HvKP菌株(編號(hào)為??11420和11492)含有的毒力基因數(shù)量最多,其次為K2型、K57型(圖5)。??/??\?f?^?廣?x??p——?^?^?1|?爾2??;1?15??r?i^s^BaM^giaBaaaBgMBosg^^^BS^MiB?sfeg??Vi?'i""i?"iiJ[f"


本文編號(hào):2934832

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