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基于改進Unet的腦腹部多模態(tài)影像分割

發(fā)布時間:2020-10-26 22:29
   深度學習是人工智能領域的基礎,近幾年,在圖像處理中深度學習的應用廣泛,基于圖像的任務有很多,比如圖像識別、目標檢測、目標分割等……,本文主要研究醫(yī)學影像分割。本文中我們的研究對象為核磁共振醫(yī)學影像(MRI)和正電子發(fā)射型計算機斷層掃描影像(PET),分別為低場強的腹部MRI影像和腦部MRI和PET多模態(tài)醫(yī)學影像。其中腹部MRI影像中的分割目標是胃部區(qū)域,屬于人體自身器官,由于本文中腹部MRI影像主要輔助放療過程中放療儀聚焦,所以采用低場強MRI,使得影像質量較差,對比度低,胃部邊緣模糊,不利于胃部分割,為得到良好的分割結果,本文提出了基于遷移自編碼網絡約束的全卷積神經網絡分割方法。腦部影像的分割目標是癲癇病灶區(qū)域,屬于腦組織病變區(qū)域。腦部影像主要包含MRI影像和PET影像,針對腦部MRI/PET多模態(tài)影像,本文提出了多模態(tài)特征融合的全卷積神經網絡(Ynet),該網絡能夠同時利用MRI和PET影像對癲癇病灶進行學習,并結合了前景背景互補的分割思想。綜上,本文具體研究了以下三方面。(1)提出了一種基于胃部標簽的自編碼網絡約束的全卷積神經網絡遷移學習方法。采用全卷積神經網絡U-net作為基本網絡,并構造一個自編碼網絡用于學習胃部區(qū)域標簽的結構信息,將訓練好的自編碼網絡分別作用于腹部MRI影像的標簽圖和U-net網絡對腹部MRI影像的分割結果圖,分別生成兩個重構圖img1、img2,利用img1和img2構造一個Dice損失來引導U-net基本網絡的優(yōu)化方向。U-net網絡結構是完全對稱的,網絡結構簡單描述如下:四次下采樣層,下采樣層之間包含卷積核數目不同的卷積層,四次上采樣層,上采樣層之間同樣包含卷積核數目不同的卷積層,下采樣結構層又稱作編碼層,上采樣結構層又稱解碼層,在編碼層和解碼層之間有跳躍連接層,跳躍連接層用來將淺層卷積特征和深層卷積特征融合,聯合了高層語義和底層的細粒度表層信息,能夠很好的符合分割對高層語義信息和底層細粒度表層信息的依賴。用U-net網絡首先在高質量的腹部MRI影像上學習胃部區(qū)域的紋理信息,并且使用低質量影像的標簽訓練自編碼網絡,以學習胃部區(qū)域的輪廓、形狀信息,再將學習好的網絡在低質量的腹部影像上進行fine-tuning。(2)提出了一種基于多模態(tài)特征融合的前背景互補癲癇病灶分割方法。該多模態(tài)網絡的兩個支網絡分別用于學習MRI影像特征和PET影像特征,支網絡的網絡結構采用U-net的編碼解碼結構。多模態(tài)網絡的深層結構用于將支網絡提取的MRI影像特征和PET影像特征進行特征融合,融合的方法我們采用了特征層疊加、特征層加權求和,實驗表明特征疊加的方法更適用于癲癇病的多模態(tài)影像特征的融合和分割。另外,我們采用以上模型著重學習非癲癇病灶的背景區(qū)域,采用基于背景學習的模型和基于癲癇病灶的學習模型在決策級進行分割結果融合,實驗表明結合基于背景的分割方法能夠對僅基于前景分割的方法進行一個補充和改善。(3)對于醫(yī)學影像數量少,不足以使網絡充分學習影像數據分布規(guī)律的問題,前兩個工作中我們采用了簡單的圖像處理方法進行圖像擴充,這樣擴充的數據與原始數據相似性較高。為了進一步充分利用有限的影像數據,我們提出了基于CycleGAN進行影像模態(tài)轉換的癲癇病灶分割方法。首先利用CycleGAN訓練學習MRI和PET影像之間的映射關系,從而能夠實現兩種模態(tài)之間的相互轉換獲取更多的樣本。實驗表明從MRI到PET的轉換更具有真實性,使用生成的PET影像能夠改善分割結果。
【學位單位】:西安電子科技大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2019
【中圖分類】:R445.2;TP391.41
【部分圖文】:

曲線圖,導函數,曲線圖,函數


sigmoid函數及導函數曲線圖

函數曲線圖,函數值,可導,輸出結果


tanh函數曲線圖

函數曲線圖,導數值,網絡參數,弊端


relu函數曲線圖
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