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MRI影像特征預測PLGG基因型價值分析

發(fā)布時間:2020-06-24 14:13
【摘要】:背景小兒低級別膠質(zhì)瘤(Pediatric Low Grade Gliomas,PLGG)是指發(fā)生在小兒人群中的WHO分級較低級別的一組原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤。該類疾病占小兒中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤30%以上。PLGG的總體預后良好,5年總生存率大約為95%。但是,存活人群常常因為疾病本身或者治療而遭受神經(jīng)功能、內(nèi)分泌等方面的并發(fā)癥。特別是手術(shù)不能完全切除的PLGG患者患者,還存在著病情進展的可能。因此對于僅可活檢或者部分切除的腦干、間腦、視路等位置的PLGG,特別是切除后進展時,需要一定的輔助治療。傳統(tǒng)的放化療方法存在的較高不良反應發(fā)生率限制其廣泛臨床應用,新的放化療方法還存在著各種各樣的不足之處。近年來基因組學的研究進展為PLGG的靶向治療提供了很多潛在的治療靶點。并且基于基因表型的分子病理分型對PLGG的預后意義重大。因此PLGG常見基因型的無創(chuàng)性檢測顯得意義尤為重大。多模態(tài)的MRI檢測為基因型的無創(chuàng)性檢測提供了一條可行之路。并且文獻檢索未發(fā)現(xiàn)MRI影像特征對PLGG基因型預測方面的研究。目的探究MRI影像特征對PLGG一些常見基因型的預測意義。方法回顧性分析2001年至2016年間在鄭州大學第一附屬醫(yī)院接受手術(shù)治療的PLGG患者基因型與MRI影像特征間的關(guān)系,通過對留存福爾馬林固定石蠟包埋病理組織進行基因檢測獲取基因型信息,對醫(yī)院留存的MRI電子影像資料進行影像特征分析獲取MRI影像特征資料。統(tǒng)計學分析描述性影像特征、MRI影像量化指標等MRI影像特征與基因型的相關(guān)性及評估影像特征對基因型的預測意義。結(jié)果描述性影像特征中對各個基因型可能的獨立預測特征有KIAA1549-BRAF融合的瘤體位置(P=0.045),BRAF突變的腫瘤邊緣清晰度(P=0.035),MYB擴增的瘤體位置(P=0.038)、ADC信號強度(P=0.032)。MRI影像量化指標FLAIR序列1%界值可能是KIAA1549-BRAF融合的獨立預測指標(P=0.019)。AUC結(jié)果顯示KIAA1549-BRAF融合聯(lián)合描述性影像特征和MRI影像量化指標=0.842(0.746-0.939)聯(lián)合可能獨立預測的描述性影像特征和MRI影像量化指標=0.819(0.719-0.919)總體描述性影像特征=0.809(0.708-0.909)和總體MRI影像量化指標=0.661(0.533-0.789),總體MRI影像量化指標=0.661(0.533-0.789)不大于每個單個MRI影像量化指標(T1增強序列1%界值=0.651(0.515-0.786)、FLAIR序列1%界值=0.665(0.533-0.796)、FLAIR序列最小值=0.676(0.547-0.805));BRAF突變聯(lián)合描述性影像特征和MRI影像量化指標=0.954(0.889-1.000)聯(lián)合可能獨立預測的描述性影像特征和MRI影像量化指標=0.871(0.718-1.000)≥總體描述性影像特征=0.768(0.556-0.981)和總體MRI影像量化指標=0.871(0.718-1.000),總體MRI影像量化指標=0.871(0.718-1.000)不大于每個單個MRI影像量化指標(FLAIR序列最大值=0.871(0.718-1.000));MYB擴增聯(lián)合描述性影像特征和MRI影像量化指標=0.706(0.520-0.892)=聯(lián)合可能獨立預測的描述性影像特征和MRI影像量化指標=0.706(0.520-0.892)總體描述性影像特征=0.903(0.788-1.000)和總體MRI影像量化指標=0.753(0.601-0.906),總體MRI影像量化指標不大于每個單個MRI影像量化指標(T1增強序列方差=0.741(0.582-0.901)、ADC序列10%界值=0.754(0.579-0.929))。結(jié)論瘤體位置、FLAIR序列1%界值可能是KIAA1549-BRAF融合的獨立預測指標,腫瘤邊緣清晰度可能是BRAF突變的獨立預測指標,瘤體位置、ADC信號強度可能是MYB擴增的獨立預測指標。端腦PLGG比小腦PLGG更不易發(fā)生KIAA1549-BRAF融合的改變,邊緣清晰的PLGG較邊緣不清的PLGG更不易發(fā)生BRAF突變,端腦PLGG較小腦PLGG更易發(fā)生MYB擴增。高ADC信號強度的PLGG更不易發(fā)生MYB擴增。單純相關(guān)MRI影像量化指標種類的增加并不能提高對基因型的預測效果,聯(lián)合描述性影像特征和MRI影像量化指標時增加相關(guān)指標的數(shù)目能提高對基因的預測效果。單純的描述性影像特征或者MRI影像量化指標間對基因型的預測無特定優(yōu)劣傾向。
【學位授予單位】:鄭州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R445.2;R739.4
【圖文】:

世界衛(wèi)生組織,中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤,病理分級


2016年世界衛(wèi)生組織中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分級

峰形,測序,缺失,探針


正向(5'-TGCTTGCTCTGATAGGAAAATG-3'),反向(5'-CCACAAAATGGATCCAGACA-3'),序列長度為173 bp。TERTp、H3F3A、BRAF突變的典型測序結(jié)果的峰形圖如圖2。2.2 KIAA1549-BRAF 融合、MYB 擴增和 CDKN2A 缺失熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)分析用FISH方法對KIAA1549-BRAF融合、MYB擴增和CDKN2A缺失進行評價[61,26]。在KIAA1549-BRAF融合檢測中,利用3個跨越整個BRAF基因的P1衍生的人工染色體克隆(Rp4-726N20、Rp5-839B19和Rp4-813F11)和7號染色體著絲粒計數(shù)探針(CEP7)。使用一種商品化的探針進行MYB擴增(Cytocell,英國細胞公司)檢測。采用Vysis LSI CDKN2A SpectrumOrange/CEP 9 SpectrumGreen Probes(Vysis)探針研究CDKN2A基因的缺失情況。每個病例至少統(tǒng)計分析100個非重疊信號。KIAA1549-BRAF融合被定義為20%以上的腫瘤細胞表現(xiàn)出BRAF:CEP7值≥1.15[62]。當>5%的細胞呈簇狀或目標(紅色)與參考(綠色)信號之比>2時,考慮MYB擴增[61]。當>20%的腫瘤細胞出現(xiàn)兩種信號丟失時,考慮CDKN2A純合缺失[26]。KIAA1549-BRAF融合陽性、MYB擴增陽性、CDKN2A缺失陽性的腫瘤典型圖片見圖3。

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本文編號:2727964

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