MALDI-TOFMS技術(shù)在鑒定臨床少見(jiàn)非發(fā)酵菌中的應(yīng)用
本文關(guān)鍵詞:MALDI-TOFMS技術(shù)在鑒定臨床少見(jiàn)非發(fā)酵菌中的應(yīng)用 出處:《中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志》2017年09期 論文類(lèi)型:期刊論文
更多相關(guān)文章: 基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜 非發(fā)酵菌 鑒定
【摘要】:目的評(píng)價(jià)基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)技術(shù)在快速鑒定臨床少見(jiàn)非發(fā)酵菌中的應(yīng)用價(jià)值。方法選取2013年7月-2016年10月安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科分離的67株臨床少見(jiàn)非發(fā)酵菌,包括痰液分離的21株,尿液分離的13株,血液分離的9株,骨髓液分離的9株,分泌物分離的8株,腹透液分離的2株,腦脊液分離的1株,膽汁分離的1株,其他體液分離的3株。以16S核糖體RNA(16SrRNA)序列分析為金標(biāo)準(zhǔn),比較MALDI-TOF MS與Vitek2 Compact鑒定系統(tǒng)鑒定的準(zhǔn)確性。結(jié)果 67株臨床少見(jiàn)非發(fā)酵菌中,MALDI-TOF MS將66株(98.5%)鑒定到種水平,1株(1.5%)鑒定到屬水平;Vitek2Compact鑒定系統(tǒng)將59株(88.1%)鑒定到種水平,8株(11.9%)未能鑒定;67株少見(jiàn)非發(fā)酵菌均擴(kuò)增到16SrRNA目的基因片段并成功測(cè)序,67株(100.0%)都成功鑒定到種水平。以16SrRNA序列分析為金標(biāo)準(zhǔn),MALDITOF MS和Vitek2 Compact鑒定系統(tǒng)正確鑒定到種水平準(zhǔn)確性分別為98.5%(66/67)和88.1%(59/67)。結(jié)論與傳統(tǒng)的細(xì)菌生化反應(yīng)方法相比,MALDI-TOF MS技術(shù)操作簡(jiǎn)便、耗時(shí)短、費(fèi)用低,鑒定結(jié)果與16SrRNA序列分析的符合率高,可以提高臨床對(duì)少見(jiàn)非發(fā)酵菌鑒定的準(zhǔn)確率。
[Abstract]:Objective to evaluate MALDI-TOF MS by matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF). Methods from July 2013 to October 2016, 67 strains of clinical rare non-fermentative bacteria isolated from the laboratory of the first affiliated hospital of Anhui medical university were selected for rapid identification of clinical non-fermentative bacteria. Bacteria. There were 21 strains of sputum, 13 strains of urine, 9 strains of blood, 9 strains of bone marrow fluid, 8 strains of secretions, 2 strains of peritoneal dialysis and 1 strain of cerebrospinal fluid. 1 strain isolated from bile and 3 strains isolated from other humoral fluids. The 16s ribosomal RNAs 16s rRNA sequence analysis was regarded as the gold standard. The accuracy of MALDI-TOF MS and Vitek2 Compact identification system was compared. MALDI-TOF MS identified 66 plants at the seed level and 1 strain at the genus level. Vitek2Compact identification system identified 59 strains (88. 1) to the seed level, 8 (11. 9) could not be identified; The 16s rRNA target gene fragment was amplified from 67 strains of non-fermentative bacteria and 67 strains were sequenced successfully. The 16s rRNA sequence analysis was regarded as the gold standard. The accuracy of MALDITOF MS and Vitek2 Compact identification system was 98.566 / 67 and 88.1 / 59 / 67, respectively. Conclusion compared with the traditional method of bacterial biochemical reaction. MALDI-TOF MS technique is simple, time consuming and low cost. The result of identification has a high coincidence rate with 16s rRNA sequence analysis, which can improve the accuracy of clinical identification of rare non-fermentative bacteria.
【作者單位】: 安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科;
【分類(lèi)號(hào)】:R446.5
【正文快照】: 臨床上分離的常見(jiàn)非發(fā)酵菌以銅綠假單胞菌、(美國(guó)Sigma公司),-80℃超低溫冰箱(日本SANYO鮑曼不動(dòng)桿菌等為主[1-2],對(duì)較少分離的非發(fā)酵菌目公司)。前用傳統(tǒng)的生化反應(yīng)方法鑒定,影響因素較多,鑒定1.3質(zhì)控和校準(zhǔn)菌株結(jié)果不理想。基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜質(zhì)控:大腸埃希菌
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