常州地區(qū)抗酸桿菌菌種鑒定及耐藥性研究
本文關(guān)鍵詞:常州地區(qū)抗酸桿菌菌種鑒定及耐藥性研究
【摘要】:目的:通過(guò)對(duì)常州地區(qū)收集標(biāo)本的抗酸桿菌進(jìn)行菌種鑒定并開(kāi)展藥敏結(jié)果分析,了解該區(qū)域抗酸桿菌菌型分布及其耐藥情況,并對(duì)其耐藥原因進(jìn)行分析,擬為該區(qū)域肺結(jié)核和NTM肺病的診斷與鑒別診斷、合理用藥提供參考。方法:1.收集2011年04月~2013年03月常州?漆t(yī)院進(jìn)行抗酸桿菌菌種鑒定和耐藥性研究的標(biāo)本400份,其中300份為痰液,70份為胸腹水,30份為支氣管肺泡灌洗液。2.采用NaOH-NaCl標(biāo)本處理法對(duì)400份標(biāo)本進(jìn)行標(biāo)本預(yù)處理。細(xì)菌學(xué)檢測(cè)方法進(jìn)行菌型和耐藥性鑒定:(1)菌種鑒定:標(biāo)本采用BacT/Alert 3D系統(tǒng)進(jìn)行分離培養(yǎng),分別做抗酸染色和革蘭染色?顾崛旧珵殛(yáng)性標(biāo)本進(jìn)一步采用Gen-Probe分子生物學(xué)診斷的AccuProbe探針檢測(cè)試劑盒檢測(cè),完成NTM和MTB的菌群檢測(cè)和鑒定。(2)耐藥試驗(yàn):對(duì)分枝桿菌培養(yǎng)陽(yáng)性的菌株采用絕對(duì)濃度法對(duì)六種抗結(jié)核藥物:INH(異煙肼)、RFP(利福平)、EMB(乙胺丁醇)、SM(鏈霉素)、LFX(左氧氟沙星)、AMK(丁胺卡那)進(jìn)行藥敏試驗(yàn)(每一種藥物有低、高兩種濃度)。3.基因芯片檢測(cè)方法:采用基因芯片檢測(cè)利福平耐藥基因rpoB位點(diǎn)所包含的6個(gè)基因變化情況,及異煙肼耐藥基因KatG和inhA基因啟動(dòng)子各1個(gè)位點(diǎn)。對(duì)標(biāo)本進(jìn)行核酸提取,PCR擴(kuò)增及雜交進(jìn)行抗酸桿菌的分離及菌種鑒定:采用LuxScan10k-B微陣列芯片掃描儀,并運(yùn)行配套的芯片判別系統(tǒng),對(duì)芯片進(jìn)行掃描和結(jié)果判讀。記錄判讀結(jié)果和芯片信息。結(jié)果:1.標(biāo)本細(xì)菌學(xué)檢測(cè)結(jié)果:400例可疑標(biāo)本中,191例可疑標(biāo)本為抗酸桿菌陽(yáng)性菌株,209例可疑標(biāo)本為陰性標(biāo)本;191例抗酸桿菌陽(yáng)性菌株中175例抗酸桿菌培養(yǎng)陽(yáng)性菌株為mtb菌株(91.62%);16例抗酸桿菌菌株為ntm(8.38%)。2.耐藥結(jié)果:(1)mtb與ntm耐藥情況比較:175例mtb對(duì)6種抗結(jié)核藥全部敏感比例高達(dá)63.43%,對(duì)各藥的耐藥情況為16.57%對(duì)inh耐藥,12.00%對(duì)rfp耐藥,9.14%對(duì)emb耐藥,16.00%對(duì)sm耐藥,15.43%對(duì)lfx耐藥,9.14%對(duì)amk耐藥;而ntm對(duì)常用的該6種抗結(jié)核藥物敏感率較低,敏感比例僅23.08%;16例ntm菌株中僅有13例有耐藥結(jié)果,該13例ntm菌株中76.92%對(duì)inh耐藥,38.46%對(duì)rfp耐藥,53.85%對(duì)emb耐藥,61.54%對(duì)sm耐藥,61.54%對(duì)lfx耐藥,46.15%對(duì)amk耐藥。(2)mtb與ntm對(duì)不同濃度藥物敏感性存在的差異性:175例mtb中對(duì)inh、rfp、emb、sm、lfx、amk6種抗結(jié)核藥,低濃度耐藥率最高的為lfx,耐藥率為17.42%,其次依次為emb7.30%,inh7.30%,amk6.18%,sm5.62%,rfp5.06%;而13例ntm對(duì)以上6種抗結(jié)核藥呈現(xiàn)普遍耐藥,其中低濃度耐藥率最高的為emb,低濃度耐藥率高達(dá)50.00%,其次依次為lfx41.67%,sm33.33%,inh25.00%,amk25.00%,rfp16.67%。3.基因芯片檢測(cè):(1)菌種鑒定:191例抗酸桿菌陽(yáng)性標(biāo)本基因芯片法檢測(cè)陽(yáng)性率100%;209例陰性標(biāo)本中檢測(cè)出mtb5例、ntm2例。(2)耐藥基因檢測(cè):191例抗酸桿菌陽(yáng)性標(biāo)本采用基因芯片檢測(cè)耐利福平與傳統(tǒng)耐藥分析檢測(cè)一致率為90.1%(172/191)、耐利福平檢測(cè)的敏感性為79.3%(23/29)、特異性為98.2%(159/162)、陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為88.5%(23/26)、陰性預(yù)測(cè)值為96.4%(159/165)。191例抗酸桿菌陽(yáng)性標(biāo)本采用基因檢測(cè)耐異煙肼與傳統(tǒng)耐藥分析檢測(cè)一致率為93.7%(179/191);耐異煙肼檢測(cè)敏感性為87.1%(34/29)、特異性為95.4%(145/152)、陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為82.9%(34/41)、陰性預(yù)測(cè)值為96.0%(145/151)。191例抗酸桿菌陽(yáng)性標(biāo)本耐多藥基因檢測(cè)與傳統(tǒng)耐藥分析檢測(cè)一致率為96.7%(173/191);耐多藥檢測(cè)敏感性為86.7%(52/60)、特異性為92.4%(121/131)、陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為83.9%(52/62)、陰性預(yù)測(cè)值為93.8%(121/129)。結(jié)論:1.常州地區(qū)抗酸桿菌檢出以mtb為主,分離率高于全國(guó)水平,ntm分離率低于全國(guó)水平。2.基因芯片法與傳統(tǒng)細(xì)菌菌種鑒定及耐藥性鑒定具有較高的符合率,且有快速、高效、特異等優(yōu)點(diǎn),為臨床可以使用的檢測(cè)方法之一。3.不同標(biāo)本中,支氣管肺泡灌洗液檢測(cè)抗酸桿菌陽(yáng)性和耐多藥檢出率較高,其次是痰液和胸腹水。
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R446.5
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,本文編號(hào):1142611
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