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基于G-四鏈體及其熒光探針構(gòu)建的UDG生物傳感器

發(fā)布時(shí)間:2017-05-25 21:08

  本文關(guān)鍵詞:基于G-四鏈體及其熒光探針構(gòu)建的UDG生物傳感器,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:尿嘧啶DNA糖苷酶(Uracil DNA Glycosylase, UDG)是一種高度保守的修復(fù)蛋白,它通過(guò)移除DNA中錯(cuò)誤出現(xiàn)的尿嘧啶堿基來(lái)防止DNA中的基因錯(cuò)配或突變,保持基因的完整性。因此,對(duì)該酶的活性檢測(cè)有重要意義。但是傳統(tǒng)的UDG活性檢測(cè)方法繁瑣耗時(shí),存在污染風(fēng)險(xiǎn),因此急需開(kāi)發(fā)新型的檢測(cè)手段,如核酸生物傳感器,實(shí)現(xiàn)對(duì)UDG的快速檢測(cè)。G-四鏈體DNA是一種富含鳥(niǎo)嘌呤(G)的核酸二級(jí)結(jié)構(gòu);贕-四鏈體構(gòu)建的熒光核酸生物傳感器在生化分析與診斷等領(lǐng)域有廣泛的應(yīng)用。本論文,針對(duì)G-四鏈體二級(jí)結(jié)構(gòu)的對(duì)稱性,設(shè)計(jì)合成了C1-,C2-,C3-對(duì)稱的芳香乙烯取代吡啶衍生物作為G-四鏈體熒光探針,并篩選出最優(yōu)熒光探針與G-四鏈體共同構(gòu)建UDG生物傳感器。本論文主要內(nèi)容及結(jié)果包括:1)設(shè)計(jì)合成新型熒光探針。針對(duì)G-四鏈體DNA的結(jié)構(gòu)對(duì)稱性,設(shè)計(jì)了一系列C1-、 C2-、C3-對(duì)稱的芳香乙烯取代吡啶衍生物,并以簡(jiǎn)單的合成步驟得到了三個(gè)系列C1-(單取代1個(gè))、C2-(雙取代2個(gè))、C3-(三取代2個(gè))共5個(gè)有對(duì)稱規(guī)律的衍生物。2)評(píng)價(jià)與篩選最優(yōu)熒光探針。通過(guò)熒光滴定,PAGE實(shí)驗(yàn)、CD光譜、紫外滴定、FRET熔點(diǎn)實(shí)驗(yàn)等手段考察了衍生物對(duì)G-四鏈體的選擇性、最低檢測(cè)限及其相互作用模式。該衍生物在不同類型的核酸中優(yōu)先結(jié)合了G-四鏈體,更重要的是,取代基的數(shù)目、種類以及衍生物的對(duì)稱性對(duì)其與G-四鏈體的熒光響應(yīng)的影響顯著。其中,雙吲哚基取代C2-對(duì)稱衍生物2a對(duì)G-四鏈體DNA有最佳的選擇性和靈敏度(K=2.17×105M-1, LOD= 33nM),并在細(xì)胞熒光成像實(shí)驗(yàn)中顯示出優(yōu)良的性能。3)構(gòu)建與評(píng)價(jià)UDG生物傳感器。傳感器中含有G-四鏈體DNA (ON1)和含尿嘧啶的DNA鏈(ON2)組成的雙鏈DNA, UDG酶作用于該雙鏈后,釋放出ON1,進(jìn)而形成G-四鏈體,與2a特異性作用后產(chǎn)生顯著的熒光信號(hào)。該傳感器的檢測(cè)線性范圍:0.05-1.00 U/mL,檢測(cè)限:0.005 U/mL。此外,在胎牛血清樣品中的UDG回收率為75.05%-102.7%,并能應(yīng)用于UDG抑制劑的篩選。
【關(guān)鍵詞】:尿嘧啶DNA糖苷化酶 生物傳感器 G-四鏈體 熒光探針
【學(xué)位授予單位】:廣東工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:O657.3;TP212
【目錄】:
  • 摘要4-5
  • Abstrate5-13
  • 第一章 緒論13-31
  • 1.1 尿嘧啶DNA糖苷酶簡(jiǎn)介13-19
  • 1.1.1 尿嘧啶DNA糖苷酶家族Ⅰ(UDG)16-17
  • 1.1.2 UDG的功能17-18
  • 1.1.3 UDG活性的測(cè)試18-19
  • 1.2 基于核酸二級(jí)結(jié)構(gòu)構(gòu)建的酶檢測(cè)的生物傳感器19-24
  • 1.2.1 生物傳感器19-20
  • 1.2.2 光學(xué)生物傳感器20-21
  • 1.2.3 核酸生物傳感器21
  • 1.2.4 熒光核酸生物傳感器21-24
  • 1.3 G-四鏈體/熒光探針構(gòu)建的UDG生物傳感器24-29
  • 1.3.1 G-四鏈體簡(jiǎn)介24-25
  • 1.3.2 小分子熒光探針與G-四鏈體DNA作用的研究方法25-28
  • 1.3.3 G-四鏈體/熒光探針構(gòu)建的UDG生物傳感器28-29
  • 1.4 本論文的研究構(gòu)想29-31
  • 第二章 吡啶苯乙烯衍生物的設(shè)計(jì)合成及表征31-37
  • 2.1 引言31
  • 2.2 吡啶苯乙烯衍生物的設(shè)計(jì)思路31-32
  • 2.3 苯乙烯取代吡啶衍生物的合成路線32-33
  • 2.4 結(jié)果與討論33-34
  • 2.5 實(shí)驗(yàn)部分34-37
  • 2.5.1 實(shí)驗(yàn)試劑及儀器34
  • 2.5.2 實(shí)驗(yàn)步驟34-37
  • 第三章 衍生物作為G-四鏈體DNA熒光探針的性能研究37-54
  • 3.1 引言37-38
  • 3.2 衍生物的光譜學(xué)性質(zhì)研究38
  • 3.3 G-四鏈體熒光探針的篩選38-44
  • 3.3.1 衍生物對(duì)G-四鏈體DNA的熒光響應(yīng)38-41
  • 3.3.2 衍生物的熒光量子產(chǎn)率測(cè)試41-42
  • 3.3.3 衍生物對(duì)telo21的結(jié)合常數(shù)的測(cè)試42-43
  • 3.3.4 衍生物對(duì)telo21 DNA的檢出限的測(cè)試43-44
  • 3.4 2a與G-四鏈體的相互作用及細(xì)胞成像44-48
  • 3.4.1 2a對(duì)不同DNA結(jié)構(gòu)的選擇性45
  • 3.4.2 2a與G-四鏈體結(jié)合的CD光譜實(shí)驗(yàn)45
  • 3.4.3 2a對(duì)G-四鏈體的穩(wěn)定作用45-46
  • 3.4.4 2a的PAGE染色實(shí)驗(yàn)和細(xì)胞成像46-48
  • 3.5 本章小結(jié)48-49
  • 3.6 實(shí)驗(yàn)部分49-54
  • 3.6.1 實(shí)驗(yàn)試劑及儀器49-50
  • 3.6.2 實(shí)驗(yàn)方法及步驟50-54
  • 第四章 基于G-四鏈體/熒光探針的UDG生物傳感器54-64
  • 4.1 前言54
  • 4.2 UDG傳感器的設(shè)計(jì)原理54-55
  • 4.3 結(jié)果與討論55-61
  • 4.3.1 可行性實(shí)驗(yàn)55
  • 4.3.2 對(duì)照實(shí)驗(yàn)55-57
  • 4.3.3 關(guān)于該體系實(shí)驗(yàn)結(jié)果的驗(yàn)證性實(shí)驗(yàn)57-59
  • 4.3.4 該檢測(cè)體系對(duì)UDG的選擇性考察59-60
  • 4.3.5 在真實(shí)樣品中的UDG檢測(cè)60-61
  • 4.4 本章小結(jié)61
  • 4.5 實(shí)驗(yàn)步驟61-64
  • 4.5.1 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑61-62
  • 4.5.2 實(shí)驗(yàn)方法62-64
  • 結(jié)論與展望64-66
  • 參考文獻(xiàn)66-75
  • 化合物編號(hào)與結(jié)構(gòu)75-76
  • 附錄76-86
  • 攻讀碩士研究生期間發(fā)表的論文86-88
  • 致謝88

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