隨著蛋白質(zhì)與基因測序技術(shù)的進一步發(fā)展,尤其是基因組計劃的啟動使得有關(guān)蛋白質(zhì)的生物序列飛速增長。生物序列的海量產(chǎn)生、收集,造成已知蛋白質(zhì)序列和已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能之間的數(shù)量差距越來越大。開發(fā)具有一定智能、可以自動識別蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能等生物信息的自動系統(tǒng)或模式識別方法成為了現(xiàn)實地、迫切地需求。基于機器學(xué)習(xí)和人工智能方法的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能預(yù)測一直是生物信息學(xué)研究的重點問題同時也是生物信息學(xué)面臨的重大挑戰(zhàn)。大量的文獻報道和研究結(jié)果表明模式識別方法在蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測中取得了巨大的成功,同時產(chǎn)生了大量魯棒性的方法,一些方法對蛋質(zhì)二級結(jié)構(gòu)地預(yù)測準(zhǔn)確率可以達到75%以上。在高效、快捷地實驗室蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能測定技術(shù)出現(xiàn)前,通過綜合應(yīng)用計算機技術(shù)、數(shù)學(xué)方法和分子生物學(xué)理論從大量的蛋白質(zhì)一級序列數(shù)據(jù)中獲取蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能等生物意義是生物信息學(xué)的首要任務(wù)和重點研究對象之一。本文的主要工作就是從生物序列出發(fā),應(yīng)用支持向量機（SVM）和蛋白質(zhì)序列融合表征方法進行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)類預(yù)測研究。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)類預(yù)測是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的一個重要組成部分,使得人們從大體上把握蛋白質(zhì)的折疊情況成為現(xiàn)實。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)類型預(yù)測可以對二級結(jié)構(gòu)... 

【文章來源】：西安電子科技大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

最優(yōu)分類面示意圖

圖 2.1 提取 CIF 文件中的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)類數(shù)據(jù)蛋白質(zhì)一級序列是由 20 種氨基酸組合構(gòu)成的，分別用字母 A-T 表示不同種類酸的序列。表 2. 1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)類數(shù)據(jù)集

是 3 類樣本，故需要訓(xùn)練 3 個分類器。如圖 2.2 所示，3 類樣本兩兩進+β 類蛋白質(zhì)為正樣本類，α 類蛋白質(zhì)為負(fù)樣本類；再令 α+β 類蛋白質(zhì)為 類蛋白質(zhì)為負(fù)樣本類；再令 β 類蛋白質(zhì)為正樣本類，α 類蛋白質(zhì)為負(fù)樣one-against-rest)分解策略：在面對多分類問題時，將單個類別取出作為

【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于機器學(xué)習(xí)的凋亡蛋白的亞細(xì)胞位點預(yù)測[J]. 秦玉芳.  價值工程. 2012(30)
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碩士論文
[1]半監(jiān)督學(xué)習(xí)若干問題的研究[D]. 易星.清華大學(xué) 2004



本文編號：3282287