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基于機(jī)器學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像非線性配準(zhǔn)技術(shù)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-03-22 09:53
【摘要】:醫(yī)學(xué)圖像非線性配準(zhǔn)技術(shù)可準(zhǔn)確的建立圖像間解剖結(jié)構(gòu)的一致性,是實(shí)現(xiàn)醫(yī)學(xué)圖像精準(zhǔn)分析的基礎(chǔ)與前提。非線性配準(zhǔn)在病種分析、縱向跟蹤研究、疾病診斷、治療方案優(yōu)化等臨床任務(wù)中都具有重要作用。非線性配準(zhǔn)的主要任務(wù)是求解圖像間基于形變模型的空間變換關(guān)系,通過形變場(chǎng)將兩個(gè)圖像空間中具有相同形態(tài)結(jié)構(gòu)的位置對(duì)應(yīng)起來。因此,非線性配準(zhǔn)是一個(gè)復(fù)雜的非線性優(yōu)化問題。隨著現(xiàn)代醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù)維度和規(guī)模的增大,圖像數(shù)據(jù)呈現(xiàn)出更高的復(fù)雜性與多樣性,傳統(tǒng)非線性配準(zhǔn)算法在配準(zhǔn)精度、魯棒性和適用性上表現(xiàn)出一定的局限性。結(jié)合實(shí)際臨床需求,為了更好的解決多模態(tài)、縱向多時(shí)間點(diǎn)、大形變醫(yī)學(xué)圖像非線性配準(zhǔn)問題,本文將機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)應(yīng)用于非線性配準(zhǔn),提出了多種基于機(jī)器學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)圖像非線性形變配準(zhǔn)算法。論文主要研究?jī)?nèi)容包括:1.提出了基于機(jī)器學(xué)習(xí)的多模態(tài)圖像非線性配準(zhǔn)算法,用以解決前列腺癌放射治療中盆腔CT與MRI圖像的非線性配準(zhǔn)問題。針對(duì)CT與MRI圖像外觀灰度差異大,盆腔器官結(jié)構(gòu)局部形變顯著等問題,提出了基于雙向圖像合成的多模態(tài)非線性圖像配準(zhǔn)算法,實(shí)現(xiàn)了盆腔CT與MRI圖像的精確配準(zhǔn),為前列腺癌精準(zhǔn)放療的臨床實(shí)現(xiàn)提供了有力保障。具體包括:在傳統(tǒng)隨機(jī)森林學(xué)習(xí)算法的基礎(chǔ)上,提出了結(jié)構(gòu)化隨機(jī)森林和多目標(biāo)隨機(jī)森林回歸方法,建立了MRI→CT、CT→MRI雙向圖像合成模型,實(shí)現(xiàn)了兩種模態(tài)間的圖像灰度預(yù)測(cè),解決了CT與MRI配準(zhǔn)中圖像灰度不一致的問題。在圖像合成實(shí)現(xiàn)過程中,雙向圖像合成有效保留了兩個(gè)模態(tài)完整的解剖結(jié)構(gòu)信息,為多模態(tài)非線性無偏配準(zhǔn)提供了架構(gòu)設(shè)計(jì)參考;陔p向圖像合成,提出了雙核驅(qū)動(dòng)的多模態(tài)非線性配準(zhǔn)算法。雙向圖像合成將復(fù)雜多模態(tài)配準(zhǔn)問題簡(jiǎn)化為單一模態(tài)配準(zhǔn)問題。為保證多模態(tài)圖像配準(zhǔn)精度,充分使用CT與MRI圖像中互補(bǔ)的解剖結(jié)構(gòu)信息,提出了雙核形變?nèi)诤纤惴?通過CT核與MRI核配準(zhǔn)結(jié)果的迭代融合,可以有效估計(jì)盆腔器官局部形變,提高配準(zhǔn)精度;陔p向圖像合成,提出了區(qū)域自適應(yīng)多模態(tài)非線性配準(zhǔn)算法。為了有效利用CT像中顯著的骨骼結(jié)構(gòu)信息和MRI圖像中顯著的軟組織結(jié)構(gòu)信息,本文提出了區(qū)域自適應(yīng)配準(zhǔn)算法,通過CT模態(tài)核實(shí)現(xiàn)骨骼區(qū)域的局部匹配,通過MRI模態(tài)核實(shí)現(xiàn)軟組織區(qū)域的局部匹配。這樣,兩個(gè)模態(tài)核共同使用,不同模態(tài)顯著性結(jié)構(gòu)信息優(yōu)勢(shì)互補(bǔ),進(jìn)一步提高了整個(gè)盆腔結(jié)構(gòu)的局部形變估計(jì)精度和最終配準(zhǔn)精度。2.提出了基于腦結(jié)構(gòu)發(fā)育模型的縱向嬰兒腦圖像非線性配準(zhǔn)算法,為新生兒腦結(jié)構(gòu)發(fā)育研究、腦相關(guān)疾病的精確分析與診斷奠定基礎(chǔ)。新生兒出生后第一年內(nèi)由于腦結(jié)構(gòu)生長(zhǎng)與白質(zhì)髓鞘形成,不同時(shí)間點(diǎn)的圖像存在巨大的形態(tài)與灰度差異。本文提出了多任務(wù)隨機(jī)森林學(xué)習(xí)方法,對(duì)縱向多時(shí)間點(diǎn)嬰兒腦結(jié)構(gòu)發(fā)育與灰度演化過程進(jìn)行學(xué)習(xí),建立了新生兒出生后2周、3個(gè)月、6個(gè)月及9個(gè)月到第12個(gè)月的腦結(jié)構(gòu)發(fā)育模型與圖像灰度演化模型。通過多任務(wù)回歸學(xué)習(xí),在保證模型預(yù)測(cè)精度的同時(shí),保護(hù)了腦拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)關(guān)系;跈C(jī)器學(xué)習(xí)方法建立的嬰兒腦結(jié)構(gòu)發(fā)育與灰度演化模型對(duì)不同時(shí)間點(diǎn)圖像間較大的形態(tài)與灰度差異進(jìn)行了有效的預(yù)測(cè)與補(bǔ)償,極大的簡(jiǎn)化了非線性配準(zhǔn)過程,實(shí)現(xiàn)了縱向多時(shí)間點(diǎn)嬰兒腦圖像的精確配準(zhǔn)。3.提出了基于深度學(xué)習(xí)的成人腦圖像非線性配準(zhǔn)算法,為腦結(jié)構(gòu)功能探索研究、多樣化成人腦相關(guān)疾病的精確分析奠定基礎(chǔ)。傳統(tǒng)非線性配準(zhǔn)算法需要充分的迭代優(yōu)化,配準(zhǔn)精度對(duì)參數(shù)設(shè)置敏感,圖像間較大的形態(tài)差異會(huì)導(dǎo)致算法精度下降。針對(duì)這些問題,本文提出了基于線索感知的深度回歸網(wǎng)絡(luò),使用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建立準(zhǔn)確的非線性配準(zhǔn)模型,實(shí)現(xiàn)從待配準(zhǔn)圖像到形變場(chǎng)的有效估計(jì)。為了提高深度學(xué)習(xí)模型對(duì)非線性配準(zhǔn)任務(wù)的感知能力,本文提出了數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),為配準(zhǔn)模型的訓(xùn)練提供了有效的輔助參考信息。為了增強(qiáng)深度學(xué)習(xí)配準(zhǔn)模型的精度與泛化能力,本文提出了關(guān)鍵點(diǎn)均衡化訓(xùn)練樣本的采樣策略,提高了訓(xùn)練樣本的完備性,有效避免了訓(xùn)練過程中的過擬合問題。訓(xùn)練好的配準(zhǔn)模型在使用過程中可直接實(shí)現(xiàn)對(duì)形變場(chǎng)的預(yù)測(cè),無需參數(shù)調(diào)節(jié)與迭代優(yōu)化,對(duì)于大形變圖像的配準(zhǔn)也能保證較高的精度。該算法的提出有效的改進(jìn)了傳統(tǒng)配準(zhǔn)算法的精度與魯棒性,增強(qiáng)了配準(zhǔn)算法在臨床多樣化配準(zhǔn)任務(wù)中的適用性。本文以前列腺癌精準(zhǔn)放療、嬰兒腦發(fā)育及疾病診斷、成人腦科學(xué)研究分析三個(gè)醫(yī)學(xué)臨床應(yīng)用為背景,針對(duì)不同醫(yī)學(xué)圖像特性與醫(yī)學(xué)圖像分析的臨床需求,提出了多種基于機(jī)器學(xué)習(xí)的非線性形變配準(zhǔn)算法。對(duì)隨機(jī)森林、卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等機(jī)器學(xué)習(xí)算法進(jìn)行了深入研究與改進(jìn),通過改進(jìn)的機(jī)器學(xué)習(xí)方法設(shè)計(jì)非線性配準(zhǔn)算法,有效的解決了多模態(tài)圖像、縱向多時(shí)間點(diǎn)圖像和大形變圖像配準(zhǔn)等醫(yī)學(xué)圖像配準(zhǔn)難題,對(duì)醫(yī)學(xué)圖像智能化、精準(zhǔn)化分析具有重要意義。
【圖文】:

解剖結(jié)構(gòu),示例,一致性,圖像


對(duì)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)圖像的智能分析提出了涵豐富,包括圖像配準(zhǔn)、圖像分割、圖像增強(qiáng)。圖像配準(zhǔn)是醫(yī)學(xué)圖像分析任務(wù)的基礎(chǔ)。圖像t)或不同對(duì)象(inter-subject)在不同條件下(不同位置或角度)采集的兩幅或多幅圖像進(jìn)行個(gè)體的兩幅或多幅圖像進(jìn)行匹配融合的過程體差異(線性配準(zhǔn))與局部形變(非線性配準(zhǔn)確魯棒的圖像配準(zhǔn)是實(shí)現(xiàn)智能與精準(zhǔn)醫(yī)療的(a)腦核磁共振圖像(MRI)的解剖結(jié)構(gòu)一致性

基本流程,表示圖,灰度值


第 1 章 緒論MI)[43, 44]以及歸一化互信息(Normalized Mutual Information, NMI)[45, 46]等。這些相似度測(cè)度的具體定義參見表 1-1。其中, 分別表示參考圖像與浮動(dòng)圖像,即圖像的灰度信息集合。N 表示參考圖像空間體素總數(shù)。 表示圖像的均值, (д)表示圖像的方差。 表示圖像 對(duì)應(yīng)于圖像 的第 k 個(gè)灰度區(qū)間所覆蓋的體素位置的灰度值集合 表示 中包含的體素?cái)?shù)量,,且 = щ , 表示圖像灰度值區(qū)間索引。 ( ) = щ ( ) 表示圖像 的聯(lián)合熵, 是指基于(i, j)聯(lián)合直方圖區(qū)間估計(jì)的聯(lián)合概率分布, ( )與 ( )表示邊緣概率分布。
【學(xué)位授予單位】:西北工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:TP391.41;TP181

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