基于多標記學習預測藥物-靶標相互作用
發(fā)布時間:2018-01-09 23:03
本文關鍵詞:基于多標記學習預測藥物-靶標相互作用 出處:《計算機工程與應用》2017年15期 論文類型:期刊論文
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【摘要】:對藥物-靶標關聯進行了研究,提出基于弱標記和多信息融合的藥物-靶標相互作用預測方法 PDML。通過與其他方法對比和數據庫檢索驗證評估PDML模型的性能:與Yamanishi提出的方法、RLSMDA、Lap RLS及Net CBP相比,除在核受體數據集中該方法在AUC上的性能比Lap RLS略有降低之外,模型在敏感性、特異性、AUC和AUPR上的性能均優(yōu)于其他四種方法;提取前5個預測分值最高的藥物-靶標對,這些藥物-靶標對能通過檢索Drug Bank、Super Target和KEGG數據庫而得到驗證。
[Abstract]:The drug target association were studied. The proposed method for performance prediction of PDML. weak labeling and multi information fusion of drug target interaction based on PDML model retrieval validation by comparison with other methods and database: RLSMDA method, proposed by Yamanishi, RLS and Net compared to Lap CBP, in addition to performance in the data set of nuclear receptors methods on the AUC is slightly lower than the Lap model in RLS, sensitivity, specificity, AUC and AUPR on the properties are better than the other four methods; extracting the former 5 prediction score the highest drug target of these drug target pairs by searching Drug Bank, Super Target and KEGG database is verified.
【作者單位】: 長沙醫(yī)學院信息工程學院;長沙醫(yī)學院藥學院;
【基金】:湖南省教育廳優(yōu)秀青年項目(No.14B023);湖南省教育廳一般項目(No.13C1108,No.14C0115)
【分類號】:R96;TP181
【正文快照】: 1引言藥物靶標是指與疾病的發(fā)生有因果關系或者參與疾病的發(fā)展過程,并通過藥物對其進行調節(jié)而實現治療目的的生物分子[1]。網絡藥理學技術[2]為尋找藥物靶標提供了全新的手段,其研究結果認為:具有多藥理性的藥物可能與多個靶標發(fā)生低親和力相互作用,從而可能使得該藥物對各靶
【參考文獻】
相關期刊論文 前1條
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【共引文獻】
相關期刊論文 前7條
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,本文編號:1402859
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