分子信標(biāo)檢測(cè)模型在若干圖論問(wèn)題中的應(yīng)用
本文關(guān)鍵詞:分子信標(biāo)檢測(cè)模型在若干圖論問(wèn)題中的應(yīng)用,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:上個(gè)世紀(jì)90年代中期,Adleman開(kāi)創(chuàng)性的利用DNA分子求解了七個(gè)頂點(diǎn)的有向賦權(quán)圖的Hamilton路徑問(wèn)題,開(kāi)啟了DNA計(jì)算的篇章。DNA計(jì)算是利用限定條件對(duì)運(yùn)算結(jié)果進(jìn)行刪選的一種可控的生化反應(yīng)。相比傳統(tǒng)電子計(jì)算機(jī),DNA計(jì)算具有海量的數(shù)據(jù)資源、存儲(chǔ)空間大與可高度并行的運(yùn)算能力等優(yōu)點(diǎn),彌補(bǔ)了傳統(tǒng)計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)與運(yùn)算速度方面的不足。分子信標(biāo)(molecularbeacons,MBS)是一種特異性檢測(cè)DNA和RNA靶向序列的發(fā)夾型核酸探針,由Tyagi和Krammer于1996年在實(shí)驗(yàn)室首次建立的,最初用于在液相中定量測(cè)定靶標(biāo)的量。由于分子信標(biāo)具有操作簡(jiǎn)單、靈敏度高、特異性強(qiáng)、可對(duì)核酸進(jìn)行實(shí)時(shí)定量測(cè)定、甚至可以用于活體分析等特點(diǎn),近十年來(lái),在化學(xué)、生物和醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域都有廣泛的應(yīng)用和發(fā)展。圖論可以將現(xiàn)實(shí)生活中許多問(wèn)題用數(shù)學(xué)抽象形式來(lái)描述,可以為任意包含二元關(guān)系的系統(tǒng)提供數(shù)學(xué)模型。伴隨著數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)與生物科學(xué)的發(fā)展,圖論這一經(jīng)典學(xué)科已經(jīng)在許多領(lǐng)域得到應(yīng)用和發(fā)展,如物理學(xué)、計(jì)算機(jī)技術(shù)、通信科學(xué)、建筑學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)和心理學(xué)等。本文在DNA計(jì)算的基礎(chǔ)上,首先,介紹了分子信標(biāo)的設(shè)計(jì)、工作原理及其應(yīng)用;然后,利用分子信標(biāo)中熒光分子-猝滅分子對(duì)選擇的不同可構(gòu)成多色分子信標(biāo)的原理,給出求解Hamilton圈這-NP-完全問(wèn)題的算法;其次,介紹了基于分子信標(biāo)檢測(cè)技術(shù)的最大匹配問(wèn)題,通過(guò)編碼分子信標(biāo)環(huán)部可特異性檢測(cè)圖的特定邊,并通過(guò)檢測(cè)到熒光不再加強(qiáng)來(lái)判定反應(yīng)完全;最后,通過(guò)引入探針機(jī)這一數(shù)學(xué)模型,求解了TSP問(wèn)題。
【關(guān)鍵詞】:DNA計(jì)算 分子信標(biāo) Hamilton圈 最大匹配 探針機(jī) 旅行商問(wèn)題
【學(xué)位授予單位】:安徽理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:O157.5
【目錄】:
- 摘要5-6
- Abstract6-14
- 引言14-16
- 1 緒論16-19
- 1.1 研究背景16
- 1.2 預(yù)備知識(shí)16-18
- 1.2.1 DNA計(jì)算的產(chǎn)生背景及研究現(xiàn)狀16-17
- 1.2.2 DNA的分子結(jié)構(gòu)及計(jì)算原理17-18
- 1.3 本文主要研究?jī)?nèi)容18-19
- 2 分子信標(biāo)技術(shù)的介紹19-23
- 2.1 引言19
- 2.2 分子信標(biāo)的設(shè)計(jì)及其工作原理19-21
- 2.2.1 分子信標(biāo)的設(shè)計(jì)19-20
- 2.2.2 分子信標(biāo)的工作原理20-21
- 2.3 分子信標(biāo)技術(shù)的應(yīng)用21-22
- 2.4 本章小結(jié)22-23
- 3 分子信標(biāo)檢測(cè)模型在Hamilton圈問(wèn)題中的應(yīng)用23-28
- 3.1 引言23
- 3.2 問(wèn)題描述23-24
- 3.3 Hamilton圈問(wèn)題的分子信標(biāo)檢測(cè)模型24-27
- 3.3.1 算法設(shè)計(jì)24-25
- 3.3.2 模型實(shí)現(xiàn)25-27
- 3.4 本章小結(jié)27-28
- 4 分子信標(biāo)檢測(cè)模型在最大匹配問(wèn)題中的應(yīng)用28-35
- 4.1 引言28
- 4.2 問(wèn)題描述28-29
- 4.3 最大匹配問(wèn)題的分子信標(biāo)檢測(cè)模型29-34
- 4.3.1 算法設(shè)計(jì)29
- 4.3.2 生物操作29-30
- 4.3.3 實(shí)例分析30-34
- 4.4 本章小結(jié)34-35
- 5 探針機(jī)求解TSP問(wèn)題35-41
- 5.1 引言35
- 5.2 探針機(jī)定義35-36
- 5.3 實(shí)例分析36-38
- 5.3.1 問(wèn)題描述36
- 5.3.2 探針機(jī)模型求解旅行商問(wèn)題36-38
- 5.4 分子信標(biāo)技術(shù)與探針機(jī)的結(jié)合38-40
- 5.4.1 納米硅38-39
- 5.4.2 熒光波長(zhǎng)轉(zhuǎn)移型分子信標(biāo)39
- 5.4.3 基本思想39-40
- 5.5 本章小結(jié)40-41
- 結(jié)論41-42
- 參考文獻(xiàn)42-46
- 致謝46-47
- 作者簡(jiǎn)介及讀研期間主要科研成果47
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
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本文關(guān)鍵詞:分子信標(biāo)檢測(cè)模型在若干圖論問(wèn)題中的應(yīng)用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):364857
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