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單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)缺失元素補(bǔ)全算法

發(fā)布時(shí)間:2021-04-10 19:53
  基于非負(fù)矩陣分解模型,提出一種新的數(shù)據(jù)補(bǔ)全算法.該算法通過循環(huán)遍歷確定最佳構(gòu)造矩陣和rank值,解決了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)數(shù)據(jù)中存在缺失值的問題,避免了由于單細(xì)胞測序深度不足對細(xì)胞分型分析的影響.在慢性粒細(xì)胞白血病單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,由補(bǔ)全算法恢復(fù)缺失值后的細(xì)胞分型更清晰,驗(yàn)證了該算法的有效性. 

【文章來源】:吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版). 2020,58(05)北大核心

【文章頁數(shù)】:3 頁

【部分圖文】:

單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)缺失元素補(bǔ)全算法


原始數(shù)據(jù)與迭代重構(gòu)基因表達(dá)矩陣數(shù)據(jù)細(xì)胞分型結(jié)果比較


本文編號:3130241

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