隨著現(xiàn)代測序技術(shù)的發(fā)展,產(chǎn)生海量生物數(shù)據(jù),快速發(fā)展的生物信息學(xué)也在不斷剖析這些數(shù)據(jù)的隱藏生物信息。通過生物網(wǎng)絡(luò)研究基因型與疾病表型的關(guān)聯(lián)關(guān)系從而實現(xiàn)致病基因的預(yù)測和尋找基因?qū)е碌募膊　；诩膊』蚰K性特征,提出整合蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)、疾病表型相似性網(wǎng)絡(luò)、疾病-基因?qū)?yīng)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)建異構(gòu)生物網(wǎng)絡(luò),改進網(wǎng)頁排序算法TrustRank,對候選基因與疾病進行優(yōu)先級排序,實現(xiàn)預(yù)測功能。本文還將通過Spark平臺開發(fā)基因疾病搜索系統(tǒng),數(shù)據(jù)存儲在HBase中,形成大數(shù)據(jù)存儲、處理、分析的解決方案,對臨床診斷和疾病治療提供新思路。

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【部分圖文】：

圖1整合后的異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)Fig．1Integratedheterogeneousnetwork"!"""*")

后的轉(zhuǎn)移概率滿足:MDG=p(gi|dj)=Ai，j/∑jAi，j(3)同理，從基因到疾病的轉(zhuǎn)移矩陣MGD滿足:MGD=p(dj|gi)=Aj，i/∑iAj，i(4)首先構(gòu)建生物信息的異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)表明來自多個公共資源的先驗信息，表示成G=(V，E)，其中V表示節(jié)點集合，E表示邊集合，....

圖5系統(tǒng)首頁

大數(shù)據(jù)框架是Sparkonyarn平臺，主要選用技術(shù)包括MongoDB數(shù)據(jù)庫存儲和SparkSQL查詢，輸出的是與輸入相關(guān)的基因型或者表型。設(shè)計課題提供一個可擴展且高性能的存儲、處理、分析基因大數(shù)據(jù)的解決方案，設(shè)計構(gòu)建框架如圖4所示。!!!!!!!!!!""#$$%$&’()*+....

圖6搜索結(jié)果頁面Fig．6Searchresultspage

大數(shù)據(jù)框架是Sparkonyarn平臺，主要選用技術(shù)包括MongoDB數(shù)據(jù)庫存儲和SparkSQL查詢，輸出的是與輸入相關(guān)的基因型或者表型。設(shè)計課題提供一個可擴展且高性能的存儲、處理、分析基因大數(shù)據(jù)的解決方案，設(shè)計構(gòu)建框架如圖4所示。!!!!!!!!!!""#$$%$&’()*+....

圖7鏈接HPＲD頁面Fig．7LinktheHPＲDpage

圖7鏈接HPＲD頁面Fig．7LinktheHPＲDpage4結(jié)束語使用計算方法預(yù)測候選基因－疾病相關(guān)性既可以研究發(fā)病機理，而且也有助于疾病診斷、治療，以及預(yù)防。近年來隨著精準(zhǔn)醫(yī)療的提出與廣受關(guān)注，個人醫(yī)療數(shù)據(jù)正日趨豐富，通過大數(shù)據(jù)技術(shù)來展開處理研究已成為未來的熱點領(lǐng)域。同時個人....

本文編號：3924881