近年來,人工智能普及和發(fā)展的速度就像飛馳的列車,越來越多研究生物大分子關(guān)系的科研人員也乘上了這趟列車。因?yàn)橄鄬鹘y(tǒng)生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)而言,這可以極大地節(jié)省研究成本和精力。最近發(fā)現(xiàn),非編碼RNA在發(fā)育、代謝、疾病等生命活動(dòng)中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。非編碼RNA是指不編碼蛋白質(zhì)的RNA,長度各不相同,從幾十個(gè)到幾百個(gè)核苷酸不等。長非編碼RNA與微小RNA都屬于非編碼RNA,并且長非編碼RNA可以調(diào)控微小RNA,從而能夠?qū)膊‘a(chǎn)生一定的影響。因此,運(yùn)用推薦算法研究長非編碼RNA與微小RNA的關(guān)聯(lián)技術(shù)成為了當(dāng)前的研究熱點(diǎn)。在本實(shí)驗(yàn)中,采用了變換式組合推薦算法。該算法首先使用高斯算法和翁施算法計(jì)算非編碼RNA相似性,并且通過變換系數(shù)α把K近鄰矩陣分解,置信度算法和余弦相似度算法組合,根據(jù)變換系數(shù)α的變化而采用不同的算法。然后,將組合推薦算法應(yīng)用在了生物信息學(xué)領(lǐng)域,推薦TOP長非編碼RNA與微小RNA關(guān)聯(lián)。在五折交叉驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)中,三個(gè)模型在所屬變換系數(shù)區(qū)間內(nèi)分別取得了0.8217,0.8810和0.9814的AUC值。進(jìn)一步地又分別基于不同非編碼RNA類型測試集去測試變換式組合推薦算法的適用性,并且對三個(gè)實(shí)...

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1長非編碼RNA和微小RNA關(guān)系網(wǎng)絡(luò)模型

第1章緒論3之間已知關(guān)系的二部圖組成。此外，他們還假設(shè)彼此高度相似的微小RNA與長非編碼RNA具有相似的相互作用或非相互作用模式。隨后，Liu等人提出了LMFNRLMI模型，該模型利用鄰域內(nèi)最強(qiáng)的相鄰關(guān)系，通過K近鄰思想建立鄰接矩陣，推薦長非編碼RNA和微小RNA之間地相關(guān)性[2....

圖3-1系統(tǒng)總體功能用例圖

第3章系統(tǒng)需求分析和系統(tǒng)設(shè)計(jì)11圖3-1系統(tǒng)總體功能用例圖3.1.1.1注冊登錄功能需求分析在用戶接觸到的系統(tǒng)當(dāng)中，基本都包含注冊登錄功能，這是為了更好地保護(hù)系統(tǒng)以及使用此系統(tǒng)的人，并且可以記錄使用者操作信息，從而為使用者提供所需便利。因此，在數(shù)據(jù)庫中會相應(yīng)的添加使用者信息表。此....

圖3-2注冊登錄功能用例圖

第3章系統(tǒng)需求分析和系統(tǒng)設(shè)計(jì)11圖3-1系統(tǒng)總體功能用例圖3.1.1.1注冊登錄功能需求分析在用戶接觸到的系統(tǒng)當(dāng)中，基本都包含注冊登錄功能，這是為了更好地保護(hù)系統(tǒng)以及使用此系統(tǒng)的人，并且可以記錄使用者操作信息，從而為使用者提供所需便利。因此，在數(shù)據(jù)庫中會相應(yīng)的添加使用者信息表。此....

圖3-3數(shù)據(jù)準(zhǔn)備功能用例圖

第3章系統(tǒng)需求分析和系統(tǒng)設(shè)計(jì)123.1.1.2數(shù)據(jù)準(zhǔn)備功能需求分析非編碼RNA數(shù)據(jù)一般是以字符序列的形式存儲的，而本系統(tǒng)建模計(jì)算時(shí)通常使用數(shù)字或字符來計(jì)算，所以為了滿足這個(gè)需求，便有了數(shù)據(jù)準(zhǔn)備功能。在這個(gè)過程中，需要將使用者輸入的非編碼RNA序列轉(zhuǎn)化為本系統(tǒng)所需要的格式，并且將無....

本文編號：3921519