癌癥是人類面臨的復(fù)雜疾病之一。目前治療方法主要是傳統(tǒng)的手術(shù)治療,其次是局部放療、化學(xué)療法和內(nèi)分泌治療,但是術(shù)后復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移仍是困擾研究者的主要問題。隨著生物信息學(xué)的發(fā)展,基因治療逐漸應(yīng)用于癌癥�；蛑委煹念A(yù)后效果依賴于癌癥基因標(biāo)志物的準(zhǔn)確度,因此篩選癌癥基因標(biāo)志物成為當(dāng)前的研究熱點(diǎn)之一。為了篩選具有較高診斷與鑒別能力的癌癥基因標(biāo)志物,本文主要探討基于基因標(biāo)志物構(gòu)建的癌癥患者預(yù)后指數(shù)優(yōu)化方法。首先,對來源于腫瘤基因組圖譜數(shù)據(jù)庫的癌癥基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,對癌癥基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析,選出癌癥中差異表達(dá)的基因,分別對比當(dāng)預(yù)后指數(shù)選取中位數(shù)、平均數(shù)和眾數(shù)時的生存分析結(jié)果。然后,運(yùn)用擬合函數(shù)法優(yōu)化患者預(yù)后指數(shù)的選取,將差異表達(dá)的基因數(shù)據(jù)分組,進(jìn)行生存分析和受試者特性曲線評估,篩選出差異性較大的基因,作為基因標(biāo)志物。進(jìn)而,運(yùn)用基因綜合表達(dá)數(shù)據(jù)庫中的獨(dú)立數(shù)據(jù)庫,對篩選出的基因標(biāo)志物進(jìn)行評估,驗證所篩選出基因標(biāo)志物的預(yù)后結(jié)果。此外,本文以發(fā)病率較高的乳腺癌和死亡率較高的肺癌為例,運(yùn)用優(yōu)化的預(yù)后指數(shù)選取方法篩選出乳腺癌和肺癌的基因標(biāo)志物,為乳腺癌和肺癌的治療策略和準(zhǔn)確預(yù)后提供一定的科學(xué)依據(jù)。

【文章頁數(shù)】：45 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-1PI選取為中位數(shù)時的生存分析

第三章乳腺癌患者預(yù)后指數(shù)優(yōu)化13第三章乳腺癌患者預(yù)后指數(shù)優(yōu)化第二章主要研究了在選取癌癥基因標(biāo)志物時癌癥患者預(yù)后指數(shù)優(yōu)化方法。本章將討論在選取乳腺癌的基因標(biāo)志物時乳腺癌患者的PI優(yōu)化問題。首先，對來源于TCGA數(shù)據(jù)庫的乳腺癌數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理，選取差異表達(dá)基因的中位數(shù)、平均數(shù)和眾數(shù)進(jìn)行....

圖3-2PI選取為平均數(shù)時的生存分析

西北民族大學(xué)碩士學(xué)位論文14（2）選取PI為差異表達(dá)基因的平均數(shù)時，平均數(shù)是差異表達(dá)基因組中所有數(shù)值的平均值，得到PI為0.428。獲得PI選取為平均數(shù)時的生存分析如圖3-2所示，p值為0.000032。從以上當(dāng)PI分別選取中位數(shù)和平均數(shù)時的生存分析結(jié)果可以看出，乳腺癌患者PI選....

圖3-3PI選取為眾數(shù)時的生存分析

西北民族大學(xué)碩士學(xué)位論文14（2）選取PI為差異表達(dá)基因的平均數(shù)時，平均數(shù)是差異表達(dá)基因組中所有數(shù)值的平均值，得到PI為0.428。獲得PI選取為平均數(shù)時的生存分析如圖3-2所示，p值為0.000032。從以上當(dāng)PI分別選取中位數(shù)和平均數(shù)時的生存分析結(jié)果可以看出，乳腺癌患者PI選....

圖3-4當(dāng)乳腺癌患者PI選取中位數(shù)時的ROC曲線和AUC值

第三章乳腺癌患者預(yù)后指數(shù)優(yōu)化15ROC曲線及其對應(yīng)的AUC值分別如圖3-4、圖3-5、圖3-6所示。圖3-4當(dāng)乳腺癌患者PI選取中位數(shù)時的ROC曲線和AUC值圖3-5當(dāng)乳腺癌患者PI選取平均數(shù)時的ROC曲線和AUC值圖3-6當(dāng)乳腺癌患者PI選取眾數(shù)時的ROC曲線和AUC值乳腺癌患....

本文編號：3907570