基于深度學(xué)習(xí)的腦部影像分割
發(fā)布時(shí)間:2021-03-26 18:31
腦是人體中最為重要和復(fù)雜的器官,腦部疾病會(huì)對(duì)人類(lèi)健康產(chǎn)生重大威脅。醫(yī)學(xué)影像技術(shù)可以用非入侵的方式取得腦部組織影像。將腦部醫(yī)學(xué)影像中不同組織、器官分割出來(lái)對(duì)于提升醫(yī)學(xué)診斷者對(duì)正常的、有病變器官的診斷能力有重大意義。人工分割影像中的不同組織器官費(fèi)時(shí)、費(fèi)力,且對(duì)于診斷者自身的水平要求較高。本文通過(guò)收集大量的醫(yī)學(xué)影像,設(shè)計(jì)了腦部醫(yī)學(xué)影像快速定位算法以及腦部影像分割算法,實(shí)現(xiàn)了腦部醫(yī)學(xué)影像自動(dòng)分割系統(tǒng)。本文的主要工作如下:1.構(gòu)建醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)集。數(shù)據(jù)集由兩部分組成,一部分是552例人類(lèi)電子計(jì)算機(jī)斷層掃描影像序列(CT),另一部分是140例帶有標(biāo)簽且包含T1、T11mm、T1IR和T2FLAIR四種模態(tài)的磁共振成像序列(MRI)。2.設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了基于目標(biāo)檢測(cè)的腦部影像快速定位算法。構(gòu)建了基于yolo改進(jìn)的多尺度檢測(cè)網(wǎng)絡(luò),使用密集投影、取最大連通區(qū)域和閾值分割的預(yù)處理方式,對(duì)醫(yī)學(xué)影像矢狀面剖面圖進(jìn)行處理,采用腦部影像中心剪裁和旋轉(zhuǎn)的數(shù)據(jù)增強(qiáng)方式進(jìn)行訓(xùn)練后,模型對(duì)于CT影像的的平均測(cè)試分類(lèi)IOU值達(dá)到96.4%,平均單幅的預(yù)測(cè)時(shí)長(zhǎng)保持在...
【文章來(lái)源】:大連交通大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.3來(lái)自北京大學(xué)第三醫(yī)院的MRI標(biāo)簽示例??Fig.?1.3?Example?ofLabel?data?from?Peking?University?Third?Hospital??6??
?大連交通大學(xué)全日制專(zhuān)業(yè)碩士學(xué)位論文?????+?+++?+善私++?+?本++?■+-+??+\^+_,3^-??????+r:_f%?'立?+?+?,二+????:???:??>,??:?0:+??????+:>+,++?:身二??:???:?+?二':??.??:i+;W?卜:iV+?+:,+?:+??(a)極坐標(biāo)?(b)笛卡爾坐標(biāo)??(a)Polar?coordinates?(b)Cartesian?coordinates??圖2.1數(shù)據(jù)不同表示示例??Fig.?2.1?Examples?of?different?representations?of?data??4.誤差、過(guò)擬合、欠擬合、容量??誤差:誤差包括訓(xùn)練誤差(training?error)和泛化誤差(generalization?error),深度??學(xué)習(xí)的核心目標(biāo)就是是降低泛化誤差;過(guò)擬合:過(guò)擬合是指訓(xùn)練誤差和和測(cè)試誤差之間??的差距太大;欠擬合:欠擬合是指模型不能在訓(xùn)練集上獲得足夠低的誤差;容量:模型??的容量是指其擬合各種函數(shù)的能力。??容量和誤差之間的典型關(guān)系,圖2.2所示。訓(xùn)練誤差和測(cè)試誤差表現(xiàn)得非常不同。??在圖的左端,訓(xùn)練誤差和泛化誤差都非常高。這是欠擬合機(jī)制(Underfittingregime)。??當(dāng)我們?cè)黾尤萘繒r(shí),訓(xùn)練誤差減小,但是訓(xùn)練誤差和泛化誤差之間的間距卻不斷擴(kuò)大。??最終,這個(gè)間距的大小超過(guò)了訓(xùn)練誤差的下降,我們進(jìn)入到了過(guò)擬合機(jī)制(Overfitting??regime),其中容量過(guò)大,超過(guò)了最佳容量(Optimal?capacity)??j?一???TVa-ining?
?大連交通大學(xué)全日制專(zhuān)業(yè)碩士學(xué)位論文???在上述公式中,f(x,y)函數(shù)值代表影像里x行y列上點(diǎn)的灰度值。w(x,y)通常被稱(chēng)之??為卷積核、濾波器、響應(yīng)函數(shù)等等,而a和b的值定義了濾波器w(x,y)的大校從公式??2.1中,可以看出,卷積操作中有一個(gè)權(quán)重模板,這個(gè)模板按照一定的順序在影像上滑??動(dòng),每滑動(dòng)一次后,會(huì)將卷積核的參數(shù)與像素值對(duì)應(yīng)起來(lái)做加權(quán)計(jì)算,計(jì)算結(jié)果就是這??個(gè)卷積核在影像上該點(diǎn)的響應(yīng)。卷積過(guò)程如圖2.3所示。??1x1?1x0?1x1?〇?1?1x1?1x0?〇xl??〇x〇?Ixi?lx〇?1?4?0?lxo?lxl?Ixo?4?3??〇xl?〇xO?Ixi?1?0?〇xl?1x0?1x1??1?0?0?1?1?0?0?1??iii?FI-?ii〇??lx〇?Ixi?1?4?3?0?lxl?lx〇?lxl?4?3??〇x〇?〇xi?lx〇?1?2?0?0x0?lxl?ljjo?2?4??1x1?〇xO?〇xl?1?1?〇xl?〇xO?1x1??圖2.3卷積過(guò)程??Fig.?2.3?Convolution?process??圖2.3中,粉色部分即為在圖片上滑動(dòng)的卷積核,上面標(biāo)注了卷積核的參數(shù)。每個(gè)??卷積層里包含多個(gè)卷積核,使用不同的卷積核對(duì)輸入影像進(jìn)行滑動(dòng)卷積計(jì)算,將得到不??同的特征映射。低層卷積核提取影像的局部特征,高層的卷積核,可以提取圖片的全局??特征。輸出特征圖的每個(gè)參數(shù)值也可以被解釋為祌經(jīng)元的輸出,特征圖的數(shù)值與同一激??活層的鏈接共享參數(shù)。??激活函數(shù):激活函數(shù)的主要功能是為卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)提供非線(xiàn)性。如果卷積層被直接??輸入到下一層而沒(méi)有激活
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]現(xiàn)代醫(yī)學(xué)影像技術(shù)中計(jì)算機(jī)圖像處理技術(shù)的應(yīng)用[J]. 于大偉,曹章. 影像研究與醫(yī)學(xué)應(yīng)用. 2019(05)
[2]醫(yī)學(xué)影像技術(shù)在醫(yī)學(xué)影像診斷中的臨床應(yīng)用分析[J]. 馬秀敏. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2019(11)
[3]一種全自動(dòng)的腦部MR圖像分割算法[J]. 繆正飛,陳廣浩,高偉. 中國(guó)醫(yī)療設(shè)備. 2017(11)
[4]關(guān)于提高病人放射治療安全的研究[J]. 文莉娜,何盛烽. 中國(guó)輻射衛(wèi)生. 2013(04)
[5]自適應(yīng)最小誤差閾值分割算法[J]. 龍建武,申鉉京,陳海鵬. 自動(dòng)化學(xué)報(bào). 2012(07)
[6]醫(yī)學(xué)圖像分割進(jìn)展[J]. 李強(qiáng). 中國(guó)醫(yī)療設(shè)備. 2010(05)
[7]一種快速的圖像區(qū)域分割算法[J]. 汪彥,陽(yáng)愛(ài)民,涂立,邱密. 計(jì)算機(jī)應(yīng)用與軟件. 2009(05)
[8]基于高斯混合模型的活動(dòng)輪廓模型腦MRI分割[J]. 陳允杰,張建偉,韋志輝,夏德深,王平安. 計(jì)算機(jī)研究與發(fā)展. 2007(09)
[9]基于劃分的模糊聚類(lèi)算法[J]. 張敏,于劍. 軟件學(xué)報(bào). 2004(06)
[10]一種基于邊緣檢測(cè)的局部閾值分割算法[J]. 張愛(ài)華,余勝生,周敬利. 小型微型計(jì)算機(jī)系統(tǒng). 2003(04)
碩士論文
[1]卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在圖像識(shí)別上的應(yīng)用的研究[D]. 許可.浙江大學(xué) 2012
本文編號(hào):3102049
【文章來(lái)源】:大連交通大學(xué)遼寧省
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.3來(lái)自北京大學(xué)第三醫(yī)院的MRI標(biāo)簽示例??Fig.?1.3?Example?ofLabel?data?from?Peking?University?Third?Hospital??6??
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?大連交通大學(xué)全日制專(zhuān)業(yè)碩士學(xué)位論文???在上述公式中,f(x,y)函數(shù)值代表影像里x行y列上點(diǎn)的灰度值。w(x,y)通常被稱(chēng)之??為卷積核、濾波器、響應(yīng)函數(shù)等等,而a和b的值定義了濾波器w(x,y)的大校從公式??2.1中,可以看出,卷積操作中有一個(gè)權(quán)重模板,這個(gè)模板按照一定的順序在影像上滑??動(dòng),每滑動(dòng)一次后,會(huì)將卷積核的參數(shù)與像素值對(duì)應(yīng)起來(lái)做加權(quán)計(jì)算,計(jì)算結(jié)果就是這??個(gè)卷積核在影像上該點(diǎn)的響應(yīng)。卷積過(guò)程如圖2.3所示。??1x1?1x0?1x1?〇?1?1x1?1x0?〇xl??〇x〇?Ixi?lx〇?1?4?0?lxo?lxl?Ixo?4?3??〇xl?〇xO?Ixi?1?0?〇xl?1x0?1x1??1?0?0?1?1?0?0?1??iii?FI-?ii〇??lx〇?Ixi?1?4?3?0?lxl?lx〇?lxl?4?3??〇x〇?〇xi?lx〇?1?2?0?0x0?lxl?ljjo?2?4??1x1?〇xO?〇xl?1?1?〇xl?〇xO?1x1??圖2.3卷積過(guò)程??Fig.?2.3?Convolution?process??圖2.3中,粉色部分即為在圖片上滑動(dòng)的卷積核,上面標(biāo)注了卷積核的參數(shù)。每個(gè)??卷積層里包含多個(gè)卷積核,使用不同的卷積核對(duì)輸入影像進(jìn)行滑動(dòng)卷積計(jì)算,將得到不??同的特征映射。低層卷積核提取影像的局部特征,高層的卷積核,可以提取圖片的全局??特征。輸出特征圖的每個(gè)參數(shù)值也可以被解釋為祌經(jīng)元的輸出,特征圖的數(shù)值與同一激??活層的鏈接共享參數(shù)。??激活函數(shù):激活函數(shù)的主要功能是為卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)提供非線(xiàn)性。如果卷積層被直接??輸入到下一層而沒(méi)有激活
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]現(xiàn)代醫(yī)學(xué)影像技術(shù)中計(jì)算機(jī)圖像處理技術(shù)的應(yīng)用[J]. 于大偉,曹章. 影像研究與醫(yī)學(xué)應(yīng)用. 2019(05)
[2]醫(yī)學(xué)影像技術(shù)在醫(yī)學(xué)影像診斷中的臨床應(yīng)用分析[J]. 馬秀敏. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2019(11)
[3]一種全自動(dòng)的腦部MR圖像分割算法[J]. 繆正飛,陳廣浩,高偉. 中國(guó)醫(yī)療設(shè)備. 2017(11)
[4]關(guān)于提高病人放射治療安全的研究[J]. 文莉娜,何盛烽. 中國(guó)輻射衛(wèi)生. 2013(04)
[5]自適應(yīng)最小誤差閾值分割算法[J]. 龍建武,申鉉京,陳海鵬. 自動(dòng)化學(xué)報(bào). 2012(07)
[6]醫(yī)學(xué)圖像分割進(jìn)展[J]. 李強(qiáng). 中國(guó)醫(yī)療設(shè)備. 2010(05)
[7]一種快速的圖像區(qū)域分割算法[J]. 汪彥,陽(yáng)愛(ài)民,涂立,邱密. 計(jì)算機(jī)應(yīng)用與軟件. 2009(05)
[8]基于高斯混合模型的活動(dòng)輪廓模型腦MRI分割[J]. 陳允杰,張建偉,韋志輝,夏德深,王平安. 計(jì)算機(jī)研究與發(fā)展. 2007(09)
[9]基于劃分的模糊聚類(lèi)算法[J]. 張敏,于劍. 軟件學(xué)報(bào). 2004(06)
[10]一種基于邊緣檢測(cè)的局部閾值分割算法[J]. 張愛(ài)華,余勝生,周敬利. 小型微型計(jì)算機(jī)系統(tǒng). 2003(04)
碩士論文
[1]卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在圖像識(shí)別上的應(yīng)用的研究[D]. 許可.浙江大學(xué) 2012
本文編號(hào):3102049
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