本文關(guān)鍵詞：酪氨酸激酶表皮生長因子受體抑制劑的生物活性的構(gòu)效關(guān)系研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《北京化工大學(xué)》 2015年

酪氨酸激酶表皮生長因子受體抑制劑的生物活性的構(gòu)效關(guān)系研究

陳曉燕  

【摘要】：表皮生長因子受體作為抗癌靶向藥物設(shè)計的重要靶標(biāo)之一,目前已經(jīng)成為抗癌藥物設(shè)計的一大焦點。本課題利用自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、支持向量機和多元線性回歸等機器學(xué)習(xí)算法,以及化合物相似性比較的方法,對表皮生長因子受體抑制劑生物活性的構(gòu)效關(guān)系進行研究。本論文研究內(nèi)容可分為以下三部分：第一部分,利用自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和支持向量機兩種方法,對表皮生長因子受體抑制劑和非抑制劑進行定性分類研究。收集了1248個抑制劑分子和3093個非抑制劑分子,基于隨機分類原則將數(shù)據(jù)分為訓(xùn)練集和測試集；計算每個化合物的ADRIANA.Code結(jié)構(gòu)參數(shù),利用相關(guān)性分析選擇了13個與活性相關(guān)性較高的結(jié)構(gòu)參數(shù),建立分類模型。在自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型和支持向量機模型中,訓(xùn)練集和測試集的模型正確率分別為98.48%、96.33%和99.45%、97.58%。此外,還研究分析抑制劑的結(jié)構(gòu)特征與分子生物活性之間的內(nèi)在關(guān)系。第二部分,是利用多元線性回歸和支持向量機兩種方法,對表皮生長因子受體抑制劑的生物活性進行定量預(yù)測研究。依據(jù)化合物生物活性的測定方法,抑制劑化合物被歸為兩大類：基于熒光檢測測定生物活性的化合物數(shù)據(jù)集(包括793個化合物)和基于放射性元素檢測生物活性的化合物數(shù)據(jù)集(包括819個化合物)。針對每一個數(shù)據(jù)集分別用隨機和自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)兩種方法分訓(xùn)練集和測試集。同樣,利用相關(guān)性分析和逐步回歸對結(jié)構(gòu)參數(shù)進行選擇,最后基于選擇的結(jié)構(gòu)參數(shù)建立一系列的活性預(yù)測模型。所有的模型中,訓(xùn)練集的相關(guān)系數(shù)R2均大于0.70,標(biāo)準(zhǔn)偏差均小于0.71；測試集的相關(guān)系數(shù)R2均大于0.62,標(biāo)準(zhǔn)偏差均小于0.86。第三部分,以表皮生長因子受體抑制劑為研究對象,進行了化合物二維和三維結(jié)構(gòu)相似性檢索方法的探索。二維相似性研究基于五種fingerprints描述符(包括MACCS、Tree、Path、Circular、Path)和三種相似性計算系數(shù)(Tanimoto、Consine、Euclid)進行,三維相似性研究基于分子的形狀和性質(zhì)特征和Tanimoto相似性系數(shù)進行。此研究旨在比較不同的相似性檢索方法在化合物數(shù)據(jù)庫檢索的效果。研究結(jié)果表明,兩種最佳的二維相似性檢索方法為：Tanimoto-Path和Euclid距離-Path,富集率均為0.948,三維相似性的檢索富集率為0.879。

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：北京化工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R914
【目錄】：

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本文編號：136430