蛋白質(zhì)分子正確折疊是行使其功能的先決條件,錯誤折疊會導(dǎo)致聚集,從而誘發(fā)嚴重的疾病,如阿爾茨海默病。研究蛋白質(zhì)分子折疊驅(qū)動力、結(jié)構(gòu)和動力學對闡明其折疊機制具有重要作用。另外,在一些生物大分子折疊過程中,關(guān)環(huán)現(xiàn)象普遍存在。本論文中,我們研究了非天然態(tài)疏水作用對蛋白質(zhì)分子折疊行為的影響以及溶劑性質(zhì)和鏈剛性強度對半剛性高分子鏈關(guān)環(huán)動力學的影響。主要內(nèi)容如下:（1）實驗研究表明,天然小蛋白Fyn SH3 domain折疊為兩態(tài)的,而其變異體A39V/N53P/V55L Fyn SH3 domain折疊需經(jīng)過一個低含量的錯誤折疊中間體（～2.0%）。為了闡明其折疊機制差異的物理起源,我們采用基于功能態(tài)結(jié)構(gòu)的db模型以及在該模型基礎(chǔ)上增加序列具體的非天然態(tài)疏水作用的模型（db+MJhφ）,對比地研究了Fyn SH3 domain及其變異體的折疊機制。通過db模型,Fyn SH3domain及其變異體的折疊都為兩態(tài)。采用db+MJhφ模型,Fyn SH3 domain折疊為兩態(tài)的,而A39V/N53P/V55L Fyn SH3 domain折疊經(jīng)過一個錯誤折疊中間態(tài)。由于錯誤折疊中間體含量很低,不足以... 

【文章來源】：西北大學陜西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

能量漏斗模型示意圖

如圖 1-2所示。其折疊速率可以表示為 = 由能壘高度； 為指前系數(shù)，通常被當作有效的擴動限制產(chǎn)生的內(nèi)部摩擦[17,18]。實驗研究表明，對于部摩擦效應(yīng)非常有限[19]。早期，Baker 組收集了一速率，發(fā)現(xiàn)許多小蛋白的折疊速率與其功能態(tài)拓RCO）之間存在重要的相關(guān)性[20]，表明協(xié)同折疊的撲結(jié)構(gòu)決定。鑒于許多小蛋白折疊自由能圖景為漏結(jié)構(gòu)決定，基于功能態(tài)結(jié)構(gòu)的模型（Gō）能夠有效些實驗研究發(fā)現(xiàn)，有些蛋白質(zhì)分子折疊的過程中存native interaction，即該作用不存在于功能態(tài)結(jié)構(gòu)中誤折疊，從而產(chǎn)生復(fù)雜的折疊自由能圖景[22]。對于的 Gō 模型不能有效地識別其折疊機制。

西北大學碩士學位論文蛋白折疊擬實驗除了可以節(jié)省大量的人力、物力，縮短實驗實驗結(jié)果。另外，它還可以實現(xiàn)實驗上不易達到的，由于受其時間的限制，很難觀察到折疊過程，因些實驗上無法探測到的信息。通過模擬捕捉到蛋白結(jié)果提出合理的解釋。計算機模擬和實驗結(jié)果相互簡潔的理論，對未來的實驗和模擬提供指導(dǎo)。因此相成的（圖 1-3）。


本文編號：3608922