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禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息學分析

發(fā)布時間:2017-09-28 04:19

  本文關鍵詞:禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息學分析


  更多相關文章: 禾谷炭疽菌 G蛋白偶聯(lián)受體 信號肽 二級結構 生物信息學


【摘要】:基于釀酒酵母中已經(jīng)報道的3個典型GPCR序列,利用Blastp以及關鍵詞對炭疽菌蛋白質數(shù)據(jù)庫進行比對、搜索,通過SMART保守結構域及遺傳關系分析。結果表明:發(fā)現(xiàn)該菌存在4個典型的GPCR;4個GPCR在蛋白質二級結構上均含有典型的7跨膜結構域以及較高比例的α螺旋結構,均不含有明顯的信號肽序列;在定位方面,4個GPCR均定位在質膜上;該菌中的GPCR與C.higginsianum、C.fioriniae等炭疽菌屬中的病菌具有較高的同源序列以及較近的親緣關系。
【作者單位】: 西南林業(yè)大學林學院云南省森林災害預警與控制重點實驗室;廊坊市文安縣農(nóng)業(yè)局;
【關鍵詞】禾谷炭疽菌 G蛋白偶聯(lián)受體 信號肽 二級結構 生物信息學
【基金】:國家自然科學基金項目(31560211)資助 云南省森林災害預警與控制重點實驗室開放基金項目(ZK150004)資助 云南省教育廳科學研究基金項目(2014Y330)資助 云南省優(yōu)勢特色重點學科生物學一級學科建設項目(50097505)資助 云南省高校林下生物資源保護及利用科技創(chuàng)新團隊(2014015)資助
【分類號】:S432.4
【正文快照】: 禾谷炭疽菌(Colletotrichum graminicola)侵染小麥(Triticum aestivum)、高粱(Sorghum bicolor)等禾本科作物引起炭疽病,自20世紀70年代以來,由該菌引起的玉米(Zea mays)炭疽病在美國、印度等國就非常普遍,給各國農(nóng)業(yè)造成巨大損失[1-7]。隨著該菌全基因組序列的釋放[8],目前,

【相似文獻】

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7 張中義,劉云龍,劉媛,曹文廣;中國炭疽菌屬(Colletotrichum)的分類研究Ⅰ[J];石河子大學學報(自然科學版);2004年S1期

8 韓長志;;禾谷炭疽菌14-3-3蛋白生物信息學分析[J];河南師范大學學報(自然科學版);2014年03期

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10 董樹林;國內(nèi)外炭疽研究的新進展[J];微生物學免疫學譯刊;1988年01期

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1 崔靜秋;炭疽菌屬與黑痣菌屬分類及分子系統(tǒng)發(fā)育研究[D];西北農(nóng)林科技大學;2009年

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