本文關(guān)鍵詞：黃單胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： Xanthomonas campestris pv.raphani C Ⅵ型分泌系統(tǒng) Ⅵ型分泌蛋白 黃單胞菌屬

【摘要】：為明確黃單胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)數(shù)量及其所具有的信號(hào)肽、保守motif等信息以及該菌中Tss與其他病菌中同源序列之間的遺傳關(guān)系,利用關(guān)鍵詞對(duì)Xcr蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜索,并對(duì)Xcr中Tss氨基酸序列開展信號(hào)肽、跨膜結(jié)構(gòu)域以及保守基序(motif)的生物信息學(xué)分析,同時(shí),對(duì)Xcr中所含有的Tss與其他病原菌中同源序列之間的遺傳關(guān)系進(jìn)行分析。明確Xcr中存在3個(gè)Tss,分別命名為TssA、TssB、TssC,上述Tss均含有高于50%比例的!螺旋結(jié)構(gòu),均定位在細(xì)胞膜上以及具有3個(gè)保守motif,而就信號(hào)肽而言,僅TssC含有明顯的信號(hào)肽序列。Xcr中的Tss與Xcc、Xca等黃單胞菌屬病菌中的Tss具有較近的親緣關(guān)系。
【作者單位】： 西南林業(yè)大學(xué)林學(xué)院/云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南省林業(yè)科學(xué)院/國(guó)家林業(yè)局云南珍稀瀕特森林植物保護(hù)和繁育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/云南省森林植物培育與開發(fā)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： Xanthomonas campestris pv.raphani C Ⅵ型分泌系統(tǒng) Ⅵ型分泌蛋白 黃單胞菌屬
【基金】：云南省森林植物培育與開發(fā)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/國(guó)家林業(yè)局云南珍稀瀕特植物保護(hù)與繁育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放基金項(xiàng)目(2016-05) 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31200488,31560211) 云南省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2015IA005) 云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放基金項(xiàng)目(ZK150004) 云南省教育廳科學(xué)研究基金項(xiàng)目(2014Y330)
【分類號(hào)】：S432.4
【正文快照】： 病原細(xì)菌與植物相互作用過程中,病原細(xì)菌為了有效地侵染植物,可通過分泌系統(tǒng)將分泌蛋白輸入到寄主組織中,這些分泌蛋白作為效應(yīng)分子具有操控植物防衛(wèi)反應(yīng)的功能[1]。目前,在細(xì)菌中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)有7種分泌系統(tǒng),包括Ⅰ型分泌系統(tǒng)(typeⅠsecretion system,T1SS)到Ⅶ型分泌系統(tǒng)(typeⅦs

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 盧鋼 ,曹家樹 ,陳杭;Genetic linkage map of Brassica campestris L. using AFLP and RAPD markers[J];Journal of Zhejiang University Science;2002年05期

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中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

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本文編號(hào)：825881