禾谷炭疽菌磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C生物信息學(xué)分析
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【摘要】:磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C(PI-PLC)作為植物病原菌G蛋白信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程中的重要調(diào)節(jié)因子,在對(duì)植物侵染、定殖、擴(kuò)展等致病過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。禾谷炭疽菌侵染玉米、小麥等農(nóng)作物引起炭疽病,給各國(guó)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成了巨大經(jīng)濟(jì)損失;卺劸平湍傅湫蚉I-PLC序列,利用Blastp以及關(guān)鍵詞對(duì)禾谷炭疽菌蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)、搜索,以及通過(guò)SMART保守結(jié)構(gòu)域分析,明確該菌存在7個(gè)典型的PI-PLC;同時(shí),通過(guò)對(duì)上述氨基酸序列進(jìn)行細(xì)胞信號(hào)肽、跨膜結(jié)構(gòu)域以及二級(jí)結(jié)構(gòu)等生物信息學(xué)分析,明確上述PI-PLC在蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)組成、信號(hào)肽等方面均具有一定差異,除Cg PLC1具有信號(hào)肽外,其他均不含有;7個(gè)PI-PLC中4個(gè)定位在細(xì)胞質(zhì)中,其他則定位在細(xì)胞核、高爾基體上。此外,通過(guò)對(duì)禾谷炭疽菌中的7個(gè)PI-PLC與其他物種中的30個(gè)同源序列進(jìn)行遺傳關(guān)系比較分析,發(fā)現(xiàn)禾谷炭疽菌中的PI-PLC與C.higginsianum、C.fioriniae等炭疽菌屬中的病菌具有較高的同源序列,較近的親緣關(guān)系。該研究為深入開(kāi)展禾谷炭疽菌PI-PLC定位、功能研究打下堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ),同時(shí),也為進(jìn)一步開(kāi)展其他炭疽菌的研究提供重要的理論指導(dǎo)。
【作者單位】: 西南林業(yè)大學(xué)林學(xué)院 云南省森林災(zāi)害預(yù)警與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 禾谷炭疽菌 磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C 信號(hào)肽 二級(jí)結(jié)構(gòu) 炭疽菌屬
【基金】:云南省教育廳科學(xué)研究基金(2014Y330)資助
【分類號(hào)】:S432.4
【正文快照】: 植物與病原菌互作過(guò)程中,眾多細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑參與其中,現(xiàn)已明確G蛋白(Guanine nucleotidebinding protein,鳥(niǎo)嘌呤核苷酸結(jié)合蛋白)信號(hào)途徑是真核生物中最保守的信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制之一。磷酸肌醇特異磷脂酶C(PI-PLC)、腺苷酸環(huán)化酶(AC)、G蛋白信號(hào)調(diào)控因子(RGS)作為G#-GTP的效應(yīng)分
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,本文編號(hào):624860
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