微型反向重復轉(zhuǎn)座子(MITEs)廣泛分布于真核生物基因組中,相對于其它物種,MITEs轉(zhuǎn)座子在植物基因組中的研究較為深入。已有的研究表明MITEs轉(zhuǎn)座子在植物中不僅能夠促進基因組進化還可以通過多種機制影響鄰近基因的表達和結(jié)構(gòu)。鱗翅目昆蟲是農(nóng)林業(yè)的主要害蟲,隨著近年基因組測序技術(shù)的發(fā)展,已有5種鱗翅目昆蟲基因組序列相繼被公布。這為本文比較研究不同鱗翅目昆蟲基因組中MITEs轉(zhuǎn)座子的含量、種類和進化模式提供了機遇。 由于MITEs轉(zhuǎn)座子家族豐富多樣并且不具有編碼轉(zhuǎn)座酶的能力,因此無法應(yīng)用基于同源性搜索的方法將其從基因組中鑒定出來。本文采用基于結(jié)構(gòu)的方法,搜索5個已測序的鱗翅目昆蟲(家蠶、煙草天蛾、小菜蛾、帝王蝶和詩神袖蝶)基因組,系統(tǒng)鑒定MITEs轉(zhuǎn)座子在不同鱗翅目昆蟲基因組中的含量、種類和分布。進一步應(yīng)用生物信息學和群體遺傳學的方法研究MITEs轉(zhuǎn)座子在不同鱗翅目昆蟲中的進化和擴增模式。主要結(jié)果如下： 1.五種鱗翅目昆蟲中MITEs轉(zhuǎn)座子的鑒定,含量和特征分析 本研究應(yīng)用MITE-Hunter軟件對家蠶、煙草天蛾、小菜蛾、帝王蝶和詩神袖蝶的全基因組進行搜索,并經(jīng)過一系列人工檢索和核對后統(tǒng)...

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
    1.1 轉(zhuǎn)座子的發(fā)現(xiàn)
    1.2 轉(zhuǎn)座子的種類與功能
    1.3 MITEs轉(zhuǎn)座子的簡介
    1.4 MITEs轉(zhuǎn)座子的鑒定方法
    1.5 鱗翅目轉(zhuǎn)座子的概述
第二章 引言
    2.1 研究背景、目的和意義
        2.1.1 研究背景
        2.1.2 研究日的
        2.1.3 研究意義
    2.2 主要研究內(nèi)容
    2.3 研究思路和技術(shù)路線
        2.3.1 主要研究思路
        2.3.2 技術(shù)路線
第三章 五種鱗翅目昆蟲中MITEs轉(zhuǎn)座子的鑒定,含量和特征分析
    3.1 數(shù)據(jù)和軟件
    3.2 方法
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 五種鱗翅目昆蟲中MITEs轉(zhuǎn)座子的鑒定
        3.3.2 五種鱗翅目昆蟲中MITEs轉(zhuǎn)座子的特征分析和含量
    3.4 討論
第四章 五種鱗翅目昆蟲中MITEs轉(zhuǎn)座子的進化分析
    4.1 方法
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 五種鱗翅目昆蟲中MITEs轉(zhuǎn)座子家族插入時間的估計
        4.2.2 預測五種鱗翅目昆蟲中MITEs轉(zhuǎn)座子家族的擴增模式
    4.3 討論
第五章 全文總結(jié)
    5.1 五種鱗翅目昆蟲中MITEs轉(zhuǎn)座子的鑒定,含量和特征分析
    5.2 五種鱗翅目昆蟲中MITEs轉(zhuǎn)座子的進化分析
第六章 論文創(chuàng)新點
參考文獻
在讀期間發(fā)表論文
致謝



本文編號：3767996