閩江河口潮汐沼澤濕地土壤產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌群落結(jié)構(gòu)和豐度的研究
發(fā)布時(shí)間:2023-03-04 04:53
應(yīng)用PCR-RFLP技術(shù)、克隆測(cè)序及實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)對(duì)閩江河口鱔魚(yú)灘濕地3個(gè)不同優(yōu)勢(shì)沼澤植被帶土壤中產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)、豐度及其空間分布特征進(jìn)行了研究,同時(shí)分析了產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)、豐度與土壤理化因子、甲烷產(chǎn)生速率之間的關(guān)系。閩江河口蘆葦、短葉茳芏、互花米草濕地土壤(0-30cm)中檢測(cè)到的產(chǎn)甲烷菌類群包括:甲烷桿菌目(Methanobacteriales)、甲烷微菌目(Methanomirobiales)、甲烷八疊球菌目(Methanosarcinales)和甲烷球菌目(Methanococcales)。甲烷微菌目(Methanomirobiales)是閩江河口鱔魚(yú)灘濕地3個(gè)優(yōu)勢(shì)植被帶沼澤濕地的優(yōu)勢(shì)類群,暗示閩江河口濕地0-30cm土層甲烷產(chǎn)生的主要途徑為H2/CO2.不同植被類型的濕地土壤中,產(chǎn)甲烷菌的主要菌屬各不相同;在同一植被類型濕地不同土壤深度中,產(chǎn)甲烷菌群落的分布也呈現(xiàn)出垂向變化的特征。Methanoregula在3種植被類型濕地中均為優(yōu)勢(shì)菌屬。蘆葦、短葉茳芏、互花米草濕地土壤(0-30cm)中產(chǎn)甲烷菌數(shù)量的平均值依次為3.72×108copi...
【文章頁(yè)數(shù)】:199 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
中文文摘
緒論
1 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌的分類
1.1 產(chǎn)甲烷菌的分類
1.2 硫酸鹽還原菌的分類
2 天然濕地產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌多樣性檢測(cè)的標(biāo)記基因
2.1 16S rRNA基因
2.2 功能基因
3 天然濕地產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌多樣性檢測(cè)的分子生物學(xué)方法
3.1 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌群落結(jié)構(gòu)分析的分子生物學(xué)方法
3.2 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌豐度分析的分子生物學(xué)方法
4 天然濕地甲烷產(chǎn)生及其與產(chǎn)甲烷菌、硫酸鹽還原菌的關(guān)系
4.1 天然濕地甲烷的產(chǎn)生
4.2 甲烷的產(chǎn)生及其與產(chǎn)甲烷菌、硫酸鹽還原菌的關(guān)系
5 影響天然濕地產(chǎn)甲烷菌和和硫酸還原菌多樣性的生態(tài)因子
5.1 溫度
5.2 土壤pH
5.3 植被類型
5.4 基質(zhì)
5.5 鹽度
6 本研究的目的和意義
7 擬解決的科學(xué)問(wèn)題及技術(shù)路線
第一章 材料與方法
1.1 研究區(qū)概況
1.2 分子生物學(xué)主要試劑及儀器
1.3 土樣的采集與預(yù)處理
1.4 土壤理化性質(zhì)的測(cè)定
1.5 甲烷產(chǎn)生速率的測(cè)定
1.6 土壤總DNA的提取
1.7 mcrA基因的擴(kuò)增及克隆文庫(kù)的構(gòu)建
1.8 mcrA基因克隆文庫(kù)的RFLP分析和測(cè)序
1.9 dsrAB基因的擴(kuò)增及克隆文庫(kù)的構(gòu)建
1.10 dsrAB基因克隆文庫(kù)的RFLP分析和測(cè)序
1.11 功能基因的序列分析和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建
1.12 多樣性分析的相關(guān)指數(shù)
1.13 產(chǎn)甲烷菌數(shù)量的測(cè)定
1.14 硫酸鹽還原菌數(shù)量的測(cè)定
1.15 數(shù)據(jù)分析方法
第二章 不同植被類型濕地土壤產(chǎn)甲烷菌的群落結(jié)構(gòu)
2.1 蘆葦沼澤濕地產(chǎn)甲烷菌的群落結(jié)構(gòu)
2.2 短葉茳芏沼澤濕地產(chǎn)甲烷菌的群落結(jié)構(gòu)
2.3 互花米草沼澤濕地產(chǎn)甲烷菌的群落結(jié)構(gòu)
2.4 討論
2.5 本章小結(jié)
第三章 不同植被類型沼澤濕地土壤產(chǎn)甲烷菌的豐度
3.1 利用qPCR技術(shù)進(jìn)行濕地土壤產(chǎn)甲烷菌豐度的測(cè)定
3.2 利用MPN法進(jìn)行產(chǎn)甲烷菌豐度的測(cè)定
3.3 討論
3.4 本章小結(jié)
第四章 不同植被類型沼澤濕地土壤硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)
4.1 蘆葦沼澤濕地硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)
4.2 短葉茳芏沼澤濕地硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)
4.3 互花米草沼澤濕地硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)
4.4 討論
4.5 本章小結(jié)
第五章 不同植被類型沼澤濕地土壤硫酸鹽還原菌的豐度
5.1 利用qPCR技術(shù)進(jìn)行硫酸鹽還原菌豐度的測(cè)定
5.2 利用MPN法進(jìn)行硫酸鹽還原菌豐度的測(cè)定
5.3 討論
5.4 本章小結(jié)
第六章 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌與土壤理化因子及甲烷產(chǎn)生的關(guān)系
6.1 不同植被類型沼澤濕地土壤的理化特征
6.2 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌豐度與土壤理化因子之間的關(guān)系
6.3 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌群落組成與土壤理化因子之間的關(guān)系
6.4 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌的豐度與甲烷產(chǎn)生之間的關(guān)系
6.5 討論
6.6 本章小結(jié)
第七章 結(jié)論與展望
7.1 結(jié)論
7.2 本文的創(chuàng)新點(diǎn)
7.3 研究建議及展望
附錄
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間承擔(dān)的科研任務(wù)與主要成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3753754
【文章頁(yè)數(shù)】:199 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
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摘要
Abstract
中文文摘
緒論
1 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌的分類
1.1 產(chǎn)甲烷菌的分類
1.2 硫酸鹽還原菌的分類
2 天然濕地產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌多樣性檢測(cè)的標(biāo)記基因
2.1 16S rRNA基因
2.2 功能基因
3 天然濕地產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌多樣性檢測(cè)的分子生物學(xué)方法
3.1 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌群落結(jié)構(gòu)分析的分子生物學(xué)方法
3.2 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌豐度分析的分子生物學(xué)方法
4 天然濕地甲烷產(chǎn)生及其與產(chǎn)甲烷菌、硫酸鹽還原菌的關(guān)系
4.1 天然濕地甲烷的產(chǎn)生
4.2 甲烷的產(chǎn)生及其與產(chǎn)甲烷菌、硫酸鹽還原菌的關(guān)系
5 影響天然濕地產(chǎn)甲烷菌和和硫酸還原菌多樣性的生態(tài)因子
5.1 溫度
5.2 土壤pH
5.3 植被類型
5.4 基質(zhì)
5.5 鹽度
6 本研究的目的和意義
7 擬解決的科學(xué)問(wèn)題及技術(shù)路線
第一章 材料與方法
1.1 研究區(qū)概況
1.2 分子生物學(xué)主要試劑及儀器
1.3 土樣的采集與預(yù)處理
1.4 土壤理化性質(zhì)的測(cè)定
1.5 甲烷產(chǎn)生速率的測(cè)定
1.6 土壤總DNA的提取
1.7 mcrA基因的擴(kuò)增及克隆文庫(kù)的構(gòu)建
1.8 mcrA基因克隆文庫(kù)的RFLP分析和測(cè)序
1.9 dsrAB基因的擴(kuò)增及克隆文庫(kù)的構(gòu)建
1.10 dsrAB基因克隆文庫(kù)的RFLP分析和測(cè)序
1.11 功能基因的序列分析和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建
1.12 多樣性分析的相關(guān)指數(shù)
1.13 產(chǎn)甲烷菌數(shù)量的測(cè)定
1.14 硫酸鹽還原菌數(shù)量的測(cè)定
1.15 數(shù)據(jù)分析方法
第二章 不同植被類型濕地土壤產(chǎn)甲烷菌的群落結(jié)構(gòu)
2.1 蘆葦沼澤濕地產(chǎn)甲烷菌的群落結(jié)構(gòu)
2.2 短葉茳芏沼澤濕地產(chǎn)甲烷菌的群落結(jié)構(gòu)
2.3 互花米草沼澤濕地產(chǎn)甲烷菌的群落結(jié)構(gòu)
2.4 討論
2.5 本章小結(jié)
第三章 不同植被類型沼澤濕地土壤產(chǎn)甲烷菌的豐度
3.1 利用qPCR技術(shù)進(jìn)行濕地土壤產(chǎn)甲烷菌豐度的測(cè)定
3.2 利用MPN法進(jìn)行產(chǎn)甲烷菌豐度的測(cè)定
3.3 討論
3.4 本章小結(jié)
第四章 不同植被類型沼澤濕地土壤硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)
4.1 蘆葦沼澤濕地硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)
4.2 短葉茳芏沼澤濕地硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)
4.3 互花米草沼澤濕地硫酸鹽還原菌的群落結(jié)構(gòu)
4.4 討論
4.5 本章小結(jié)
第五章 不同植被類型沼澤濕地土壤硫酸鹽還原菌的豐度
5.1 利用qPCR技術(shù)進(jìn)行硫酸鹽還原菌豐度的測(cè)定
5.2 利用MPN法進(jìn)行硫酸鹽還原菌豐度的測(cè)定
5.3 討論
5.4 本章小結(jié)
第六章 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌與土壤理化因子及甲烷產(chǎn)生的關(guān)系
6.1 不同植被類型沼澤濕地土壤的理化特征
6.2 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌豐度與土壤理化因子之間的關(guān)系
6.3 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌群落組成與土壤理化因子之間的關(guān)系
6.4 產(chǎn)甲烷菌和硫酸鹽還原菌的豐度與甲烷產(chǎn)生之間的關(guān)系
6.5 討論
6.6 本章小結(jié)
第七章 結(jié)論與展望
7.1 結(jié)論
7.2 本文的創(chuàng)新點(diǎn)
7.3 研究建議及展望
附錄
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間承擔(dān)的科研任務(wù)與主要成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3753754
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