叢枝菌根真菌和根瘤菌互作對苜蓿根際土壤細菌群落結構的影響及PICRUSt功能預測分析
發(fā)布時間:2022-02-13 21:06
【背景】紫花苜蓿是優(yōu)良的豆科牧草,可以與叢枝菌根(Arbuscular mycorrhizae,AM)真菌和根瘤菌形成共生關系,接種AM真菌和根瘤菌可以促進土壤氮、磷循環(huán)以及提高苜蓿產(chǎn)量。【目的】探究接種AM真菌和根瘤菌對苜蓿根際細菌群落結構和功能的影響!痉椒ā坎杉6個不同處理組苜蓿根際、非根際土壤樣品,基于細菌16S rRNA基因V3-V4區(qū)進行高通量測序,分析比較不同處理組苜蓿根際、非根際土壤中細菌群落分布的規(guī)律,并采用PICRUSt軟件對不同處理組間菌群功能進行預測!窘Y果】36個土壤樣品中共檢測到3849個OTU,分屬于50門59綱132目249科595屬398種。其中主要的優(yōu)勢菌門為Proteobacteria (52.81%-81.46%)、Bacteroidetes (7.83%-19.68%)及Actinobacteria(2.21%-16.4%)。與不接種相比,接種根內(nèi)球囊霉和摩西球囊霉分別提高了Gammaproteobacteria和Bacteroidia有益菌的豐度,接種根瘤菌提高了固氮菌(Alphaproteobacteria)的豐度。PICRUSt功能預測表...
【文章來源】:微生物學通報. 2020,47(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
不同接種處理下苜蓿土壤細菌門水平的相對豐度弦圖
試驗通過高通量測序在6個不同處理組共檢測到595屬,其中優(yōu)勢細菌屬(豐度>1%)為Stenotrophomonas、Lysobacter、Pontibacter、Bacillus、Sphingomonas、Rheinheimera及Cellvibrio,其中Stenotrophomonas為占絕對優(yōu)勢的菌屬。為了研究不同接種處理組在屬水平的組成差異,繪制了各屬的相對豐度熱圖(圖3)。圖3 不同接種處理下苜蓿土壤細菌屬水平豐度熱圖
圖2 不同接種處理下苜蓿土壤綱水平細菌菌群組成由圖3可知,CKTR處理組中豐度較大的屬有Phyllobacterium、Brevundimonas及Marmoricola,CKTB處理組中Bifidobacterium和Lactobacillus豐度較高,GIR處理組中豐度較大的屬有Stenotrophomonas、Sphingomonas及Delftia,而且Sphingomonas和Delftia兩屬在GIB、GIKR、GIKB處理組中豐度也較大,但在其他組細菌群落中顯著降低甚至消失;在GIB處理組中豐度較大的屬有Cetobacterium,GMR處理組中豐度較大的屬有Algoriphagus、Pseudomonas、Pontibacter、Arenimonas及Methylophage,GMB處理組中豐度較大的屬有Rheinheimera和Cellvibrio,KR處理組中Massilia、Gemmatimonas及Bradyrhizobium豐度較大,KB處理組中Pseudomonas豐度較大,GIKR處理組中Arthrobacter、Unidentified_Lachnospiraceae及Faecalibacterium豐度較大,GIKB處理組中Pedobacter豐度較大,GMKR處理組中Unidentified_Prevotellaceae和Bacteroide豐度較大,GMKB處理組中Stenotrophomonas豐度較大。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃渤海海草分布區(qū)日本鰻草根際微生物群落結構特征及其功能分析[J]. 劉鵬遠,張海坤,陳琳,孫延瑜,王彩霞,宋虹,胡曉珂. 微生物學報. 2019(08)
[2]香蕉假莖生物炭對根際土壤細菌豐度和群落結構的影響[J]. 王明元,侯式貞,董濤,張敏瑜,劉建福,徐志周. 微生物學報. 2019(07)
[3]不同生境黑果枸杞根際與非根際土壤微生物群落多樣性[J]. 李巖,何學敏,楊曉東,張雪妮,呂光輝. 生態(tài)學報. 2018(17)
[4]基于高通量測序的兩種高寒草甸土壤原核生物群落特征研究[J]. 盧慧,趙珩,盛玉鈺,叢微,王秀磊,李迪強,張于光. 生態(tài)學報. 2018(22)
[5]紫穗槐叢枝菌根(AM)根系分泌物誘導根瘤菌結瘤因子及作用研究[J]. 莊倩,趙曉娟,宋福強. 西北林學院學報. 2018(03)
[6]基于Miseq測序技術分析不同元胡產(chǎn)區(qū)土壤細菌功能基因組成與差異[J]. 宋騰蛟,楊蔣舜,周靜,丁沈威,袁小鳳. 浙江中醫(yī)藥大學學報. 2018(03)
[7]高通量測序分析環(huán)保肥料增效劑對馬鈴薯根際土壤真菌多樣性變化影響[J]. 張國青,趙盼,董彥旭,武東波,鄭維平,詹虹,鈔亞鵬,仲乃琴. 微生物學通報. 2017(11)
[8]松針中游離氨基酸代謝對環(huán)境氮的響應[J]. 胡居吾,朱仁果,王慧賓,鄧朝陽,張蕾. 生物化工. 2017(03)
[9]高通量測序分析云南騰沖熱海熱泉真菌多樣性[J]. 劉開輝,丁小維,張波,唐小飛,肖敏,鮮文東,李文均. 微生物學報. 2017(09)
[10]枸杞根際土壤真菌群落多樣性的高通量測序[J]. 李越鯤,孫燕飛,雷勇輝,周旋,尹躍,秦墾. 微生物學報. 2017(07)
碩士論文
[1]玉米根際微生物群落特征分析及生防菌篩選[D]. 劉泉成.中國農(nóng)業(yè)科學院 2018
[2]馬鈴薯黑痣病生防細菌的篩選鑒定及其生防作用機理研究[D]. 馬龍.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]煙草自毒物質(zhì)及其對根際土壤微生物影響的研究[D]. 吳文祥.福建農(nóng)林大學 2010
[4]磷對番茄產(chǎn)量和品質(zhì)影響的研究[D]. 高美玲.東北農(nóng)業(yè)大學 2003
本文編號:3623918
【文章來源】:微生物學通報. 2020,47(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
不同接種處理下苜蓿土壤細菌門水平的相對豐度弦圖
試驗通過高通量測序在6個不同處理組共檢測到595屬,其中優(yōu)勢細菌屬(豐度>1%)為Stenotrophomonas、Lysobacter、Pontibacter、Bacillus、Sphingomonas、Rheinheimera及Cellvibrio,其中Stenotrophomonas為占絕對優(yōu)勢的菌屬。為了研究不同接種處理組在屬水平的組成差異,繪制了各屬的相對豐度熱圖(圖3)。圖3 不同接種處理下苜蓿土壤細菌屬水平豐度熱圖
圖2 不同接種處理下苜蓿土壤綱水平細菌菌群組成由圖3可知,CKTR處理組中豐度較大的屬有Phyllobacterium、Brevundimonas及Marmoricola,CKTB處理組中Bifidobacterium和Lactobacillus豐度較高,GIR處理組中豐度較大的屬有Stenotrophomonas、Sphingomonas及Delftia,而且Sphingomonas和Delftia兩屬在GIB、GIKR、GIKB處理組中豐度也較大,但在其他組細菌群落中顯著降低甚至消失;在GIB處理組中豐度較大的屬有Cetobacterium,GMR處理組中豐度較大的屬有Algoriphagus、Pseudomonas、Pontibacter、Arenimonas及Methylophage,GMB處理組中豐度較大的屬有Rheinheimera和Cellvibrio,KR處理組中Massilia、Gemmatimonas及Bradyrhizobium豐度較大,KB處理組中Pseudomonas豐度較大,GIKR處理組中Arthrobacter、Unidentified_Lachnospiraceae及Faecalibacterium豐度較大,GIKB處理組中Pedobacter豐度較大,GMKR處理組中Unidentified_Prevotellaceae和Bacteroide豐度較大,GMKB處理組中Stenotrophomonas豐度較大。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃渤海海草分布區(qū)日本鰻草根際微生物群落結構特征及其功能分析[J]. 劉鵬遠,張海坤,陳琳,孫延瑜,王彩霞,宋虹,胡曉珂. 微生物學報. 2019(08)
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[3]不同生境黑果枸杞根際與非根際土壤微生物群落多樣性[J]. 李巖,何學敏,楊曉東,張雪妮,呂光輝. 生態(tài)學報. 2018(17)
[4]基于高通量測序的兩種高寒草甸土壤原核生物群落特征研究[J]. 盧慧,趙珩,盛玉鈺,叢微,王秀磊,李迪強,張于光. 生態(tài)學報. 2018(22)
[5]紫穗槐叢枝菌根(AM)根系分泌物誘導根瘤菌結瘤因子及作用研究[J]. 莊倩,趙曉娟,宋福強. 西北林學院學報. 2018(03)
[6]基于Miseq測序技術分析不同元胡產(chǎn)區(qū)土壤細菌功能基因組成與差異[J]. 宋騰蛟,楊蔣舜,周靜,丁沈威,袁小鳳. 浙江中醫(yī)藥大學學報. 2018(03)
[7]高通量測序分析環(huán)保肥料增效劑對馬鈴薯根際土壤真菌多樣性變化影響[J]. 張國青,趙盼,董彥旭,武東波,鄭維平,詹虹,鈔亞鵬,仲乃琴. 微生物學通報. 2017(11)
[8]松針中游離氨基酸代謝對環(huán)境氮的響應[J]. 胡居吾,朱仁果,王慧賓,鄧朝陽,張蕾. 生物化工. 2017(03)
[9]高通量測序分析云南騰沖熱海熱泉真菌多樣性[J]. 劉開輝,丁小維,張波,唐小飛,肖敏,鮮文東,李文均. 微生物學報. 2017(09)
[10]枸杞根際土壤真菌群落多樣性的高通量測序[J]. 李越鯤,孫燕飛,雷勇輝,周旋,尹躍,秦墾. 微生物學報. 2017(07)
碩士論文
[1]玉米根際微生物群落特征分析及生防菌篩選[D]. 劉泉成.中國農(nóng)業(yè)科學院 2018
[2]馬鈴薯黑痣病生防細菌的篩選鑒定及其生防作用機理研究[D]. 馬龍.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]煙草自毒物質(zhì)及其對根際土壤微生物影響的研究[D]. 吳文祥.福建農(nóng)林大學 2010
[4]磷對番茄產(chǎn)量和品質(zhì)影響的研究[D]. 高美玲.東北農(nóng)業(yè)大學 2003
本文編號:3623918
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