Bacillus amyloliquefaciens YP6在降解有機(jī)磷農(nóng)藥中的作用及機(jī)理
發(fā)布時(shí)間:2022-01-04 01:47
有機(jī)磷農(nóng)藥廣泛地應(yīng)用于家庭和農(nóng)業(yè)中病蟲害的防治,但其對(duì)非靶標(biāo)生物的高毒性及潛在的遲發(fā)性神經(jīng)毒性,已經(jīng)造成了嚴(yán)重的環(huán)境污染和生態(tài)破壞。論文篩選高效降解毒死蜱的菌株,分析其16S rRNA和gyrB基因序列、研究其生理生化特征和降解特性;通過全基因組測(cè)序獲得該菌株完整的遺傳信息;利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)探討其降解有機(jī)磷農(nóng)藥的機(jī)制,并獲得降解相關(guān)的基因;研究其降解酶的基因特性、降解功能和酶學(xué)性質(zhì);利用環(huán)境模式生物斑馬魚對(duì)辛硫磷酶解產(chǎn)物的毒理性進(jìn)行評(píng)估;具有一定的理論意義和潛在的應(yīng)用價(jià)值。論文的主要研究結(jié)果如下:(1)比較了實(shí)驗(yàn)室保藏的20株具有促生和解磷作用的芽孢桿菌,從中篩選出一株高效降解毒死蜱的菌株YP6,經(jīng)16S rRNA和gyrB基因序列分析及生理生化實(shí)驗(yàn)鑒定,確定菌株YP6屬于解淀粉芽孢桿菌,并命名為Bacillus amyloliquefaciens YP6,其保藏號(hào)為CCTCC NO:M 2018875。Bacillus amyloliquefaciens YP6是一株廣譜型降解菌,對(duì)有機(jī)磷農(nóng)藥毒死蜱、敵敵畏、敵百蟲、三唑磷和辛硫磷具有較高的降解能力,尤其對(duì)辛硫磷的降解效率最高;該菌...
【文章來源】:江南大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:118 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
有機(jī)磷農(nóng)藥的結(jié)構(gòu)式Fig.1-1Chemicalstructureoforganophosphatepesticides注:a,有機(jī)磷農(nóng)藥的結(jié)構(gòu)通式;b,幾種常見的有機(jī)磷農(nóng)藥結(jié)構(gòu)式
。同時(shí),進(jìn)入環(huán)境中的有機(jī)磷農(nóng)藥會(huì)在各種物理、化學(xué)、生物因素的作用下發(fā)生光解、水解、微生物降解等一系列反應(yīng)[12]。有機(jī)磷農(nóng)藥在環(huán)境中的遷移轉(zhuǎn)化與其本身的理化性質(zhì)(包括:揮發(fā)性能、水溶解度、分配系數(shù)和在環(huán)境中的代謝能力等)有關(guān)。蒸汽壓高的有機(jī)磷農(nóng)藥揮發(fā)性強(qiáng),易從土壤和水體揮發(fā)到大氣中,并由呼吸道進(jìn)入人體[13];水溶性大的有機(jī)磷農(nóng)藥在土壤中移動(dòng)性強(qiáng),易經(jīng)淋溶或徑流進(jìn)入地下水,易被生物吸收而引發(fā)急性危害[12];水溶性小的有機(jī)磷農(nóng)藥土壤吸附性強(qiáng),一旦進(jìn)入生物體內(nèi),極易造成富集而引發(fā)慢性危害[14]。圖1-2農(nóng)藥在環(huán)境介質(zhì)中遷移與轉(zhuǎn)化[10]Fig.1-2Migrationandtransformationofpesticidesinenvironmentalmedium[10]有機(jī)磷農(nóng)藥的高使用量、低利用率以及其在環(huán)境中復(fù)雜的遷移轉(zhuǎn)化能力,在我國(guó)各個(gè)地區(qū)、各種環(huán)境系統(tǒng)和各類食品中均能檢測(cè)到有機(jī)磷農(nóng)藥的殘留。表1-1和1-2為2002~2017年期間,我國(guó)主要江河湖泊、土壤、動(dòng)物以及食品中部分有機(jī)磷農(nóng)藥殘留狀況[10]。
江南大學(xué)博士學(xué)位論文8圖1-3P450cam(PDB:2CPP)的蛋白結(jié)構(gòu)[97]Fig.1-3TheproteinstructureofP450cam(PDB:2CPP)[97]1.3微生物基因組研究1.3.1基因組及基因組學(xué)簡(jiǎn)介基因組是生物體內(nèi)包含的完整基因和染色體。自1995年以來,基因組分析已經(jīng)從最初的圖譜繪制和測(cè)序擴(kuò)展到基因功能分析。為了更全面進(jìn)行基因組分析,研究者們提出了以“基因組結(jié)構(gòu)和功能”為研究主題的基因組學(xué)。盡管基因組學(xué)這一術(shù)語已經(jīng)被普遍接受,但它的確切含義從未得到明確定義。在大多數(shù)情況下,基因組學(xué)仍然是指基因組的圖譜繪制、測(cè)序和分析。為了反映基于基因組序列和蛋白質(zhì)功能分析的相關(guān)研究,研究者們提出了各種具體的基因組學(xué)術(shù)語,如功能基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和結(jié)構(gòu)基因組學(xué)等[102]。1.3.2微生物基因組分析微生物是地球上最豐富多樣的生物群,不同的微生物在廣泛的自然和人為環(huán)境中執(zhí)行許多重要的生態(tài)功能,例如它們調(diào)節(jié)全球生化循環(huán),影響人類健康,并負(fù)責(zé)環(huán)境中污染物質(zhì)的轉(zhuǎn)化。因此,深入分析微生物基因組序列不僅可以使人們系統(tǒng)的了解微生物多樣性及其所具有的功能,還能夠幫助人們了解環(huán)境微生物的作用機(jī)制,尤其是微生物與靶物質(zhì)之間的相互作用及調(diào)控機(jī)制[26]。基于基因組水平上的微生物基因序列比較分析,研究者們發(fā)現(xiàn)了大量的功能類似基因和新基因。自1995年完成首個(gè)細(xì)菌(Haemophilusinfluenzae)的全基因組序列測(cè)定,人們的研究重點(diǎn)由單個(gè)基因擴(kuò)展到基因組水平研究以及多基因間的互作機(jī)制。對(duì)于有機(jī)磷農(nóng)藥降解菌基因組的研究,可以在已完成測(cè)序的基因組序列基礎(chǔ)上,通過序列比對(duì)的方式來尋找與有機(jī)磷降解酶基因相似的序列。而且通過全基因組測(cè)序發(fā)現(xiàn)很多細(xì)菌中含有有機(jī)磷農(nóng)藥降解酶基因或相似基因[26,28]。隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,細(xì)菌全基因組數(shù)據(jù)不
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]類球紅細(xì)菌XR12的分離、鑒定及其解毒效果研究[J]. 曹海鵬,張書萌,虞晶晶,安健. 水生生物學(xué)報(bào). 2020(01)
[2]Bioinformatics and Expression Pattern Analysis of Tomato ns LTP 2-like cDNA full-length Gene Clone[J]. Zhang Jia,He Shan-shan,Zhao Ting-ting,Jiang Jing-bin,Li Jing-fu,Xu Xiang-yang. Journal of Northeast Agricultural University(English Edition). 2019(01)
[3]環(huán)境中有機(jī)磷農(nóng)藥污染狀況、來源及風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)[J]. 丁浩東,萬紅友,秦攀,劉曉暉,劉濤,南嵐,國(guó)曉春,畢斌,楊勇,盧少勇. 環(huán)境化學(xué). 2019(03)
[4]金屬離子對(duì)微生物蛋白酶活性的影響及機(jī)理[J]. 余茜,張國(guó)麗,敖曉琳. 中國(guó)食品學(xué)報(bào). 2019(04)
[5]有機(jī)磷農(nóng)藥污染土壤的微生物降解研究進(jìn)展[J]. 張娜娜,姜博,邢奕,連路寧,陳亞婷. 土壤. 2018(04)
[6]微生物細(xì)胞色素P450酶及其對(duì)異源物質(zhì)的代謝研究進(jìn)展[J]. 丁俊美,李國(guó)濤,黃遵錫. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào). 2018(03)
[7]基于生物修復(fù)技術(shù)修復(fù)有機(jī)磷農(nóng)藥污染土壤概況[J]. 陳家明. 廣東化工. 2017(20)
[8]Bacillus cereus HY-4對(duì)有機(jī)磷農(nóng)藥毒死蜱的降解特性[J]. 余利,段海明. 安徽科技學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(05)
[9]解淀粉芽孢桿菌的研究進(jìn)展[J]. 王繼華,徐世強(qiáng),張木清. 亞熱帶農(nóng)業(yè)研究. 2017(03)
[10]Pseudomonas sp.ZXY-1,a newly isolated and highly efficient atrazine-degrading bacterium,and optimization of biodegradation using response surface methodology[J]. Xinyue Zhao,Li Wang,Fang Ma,Shunwen Bai,Jixian Yang,Shanshan Qi. Journal of Environmental Sciences. 2017(04)
博士論文
[1]多溴聯(lián)苯醚的微生物降解機(jī)制及產(chǎn)物毒性研究[D]. 唐少宇.華南理工大學(xué) 2018
[2]應(yīng)用生物信息學(xué)手段的酶催化性能優(yōu)化研究[D]. 曹浩.北京化工大學(xué) 2017
[3]芳香族污染物降解菌的分離及降解機(jī)理研究[D]. 任磊.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[4]Bacillus altitudinis SYBC hb4的分離鑒定及其過氧化氫酶性質(zhì)與應(yīng)用研究[D]. 張言周.江南大學(xué) 2016
[5]有機(jī)磷農(nóng)藥和硝酸鹽的電化學(xué)快速檢測(cè)方法研究[D]. 唐文志.浙江大學(xué) 2016
[6]農(nóng)藥降解菌施氏假單胞菌YC-YH1的分離鑒定及降解機(jī)理研究[D]. 史延華.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[7]致癌染料的生理毒性及分子機(jī)制研究[D]. 沈兵.浙江大學(xué) 2015
[8]飛蝗羧酸酯酶基因轉(zhuǎn)錄組分析及殺蟲劑解毒功能研究[D]. 張建琴.山西大學(xué) 2014
[9]煙嘧磺隆降解菌黃籃狀菌(Talaromyces flavus)的分離鑒定及降解機(jī)理研究[D]. 宋金龍.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[10]中國(guó)農(nóng)產(chǎn)品農(nóng)藥殘留成因與影響研究[D]. 張秀玲.江南大學(xué) 2013
碩士論文
[1]向日葵銹菌金屬蛋白酶基因的生物信息學(xué)分析及其原核表達(dá)[D]. 李鑫淳.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]抗小白菜炭疽病多功效生物有機(jī)肥的研制及其生防效果評(píng)價(jià)[D]. 張楠.大連理工大學(xué) 2017
[3]Bacillus amyloliquefaciens DC-12細(xì)胞色素P450基因克隆表達(dá)、發(fā)酵條件優(yōu)化及酶學(xué)性質(zhì)研究[D]. 李俊霞.華南理工大學(xué) 2016
[4]咪唑乙煙酸對(duì)土壤微生物、酶活性的影響及其降解真菌的篩選[D]. 史偉.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
[5]堆肥中毒死蜱降解菌的篩選及其產(chǎn)生物表面活性劑研究[D]. 李鏡.湖南大學(xué) 2009
本文編號(hào):3567404
【文章來源】:江南大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:118 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
有機(jī)磷農(nóng)藥的結(jié)構(gòu)式Fig.1-1Chemicalstructureoforganophosphatepesticides注:a,有機(jī)磷農(nóng)藥的結(jié)構(gòu)通式;b,幾種常見的有機(jī)磷農(nóng)藥結(jié)構(gòu)式
。同時(shí),進(jìn)入環(huán)境中的有機(jī)磷農(nóng)藥會(huì)在各種物理、化學(xué)、生物因素的作用下發(fā)生光解、水解、微生物降解等一系列反應(yīng)[12]。有機(jī)磷農(nóng)藥在環(huán)境中的遷移轉(zhuǎn)化與其本身的理化性質(zhì)(包括:揮發(fā)性能、水溶解度、分配系數(shù)和在環(huán)境中的代謝能力等)有關(guān)。蒸汽壓高的有機(jī)磷農(nóng)藥揮發(fā)性強(qiáng),易從土壤和水體揮發(fā)到大氣中,并由呼吸道進(jìn)入人體[13];水溶性大的有機(jī)磷農(nóng)藥在土壤中移動(dòng)性強(qiáng),易經(jīng)淋溶或徑流進(jìn)入地下水,易被生物吸收而引發(fā)急性危害[12];水溶性小的有機(jī)磷農(nóng)藥土壤吸附性強(qiáng),一旦進(jìn)入生物體內(nèi),極易造成富集而引發(fā)慢性危害[14]。圖1-2農(nóng)藥在環(huán)境介質(zhì)中遷移與轉(zhuǎn)化[10]Fig.1-2Migrationandtransformationofpesticidesinenvironmentalmedium[10]有機(jī)磷農(nóng)藥的高使用量、低利用率以及其在環(huán)境中復(fù)雜的遷移轉(zhuǎn)化能力,在我國(guó)各個(gè)地區(qū)、各種環(huán)境系統(tǒng)和各類食品中均能檢測(cè)到有機(jī)磷農(nóng)藥的殘留。表1-1和1-2為2002~2017年期間,我國(guó)主要江河湖泊、土壤、動(dòng)物以及食品中部分有機(jī)磷農(nóng)藥殘留狀況[10]。
江南大學(xué)博士學(xué)位論文8圖1-3P450cam(PDB:2CPP)的蛋白結(jié)構(gòu)[97]Fig.1-3TheproteinstructureofP450cam(PDB:2CPP)[97]1.3微生物基因組研究1.3.1基因組及基因組學(xué)簡(jiǎn)介基因組是生物體內(nèi)包含的完整基因和染色體。自1995年以來,基因組分析已經(jīng)從最初的圖譜繪制和測(cè)序擴(kuò)展到基因功能分析。為了更全面進(jìn)行基因組分析,研究者們提出了以“基因組結(jié)構(gòu)和功能”為研究主題的基因組學(xué)。盡管基因組學(xué)這一術(shù)語已經(jīng)被普遍接受,但它的確切含義從未得到明確定義。在大多數(shù)情況下,基因組學(xué)仍然是指基因組的圖譜繪制、測(cè)序和分析。為了反映基于基因組序列和蛋白質(zhì)功能分析的相關(guān)研究,研究者們提出了各種具體的基因組學(xué)術(shù)語,如功能基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和結(jié)構(gòu)基因組學(xué)等[102]。1.3.2微生物基因組分析微生物是地球上最豐富多樣的生物群,不同的微生物在廣泛的自然和人為環(huán)境中執(zhí)行許多重要的生態(tài)功能,例如它們調(diào)節(jié)全球生化循環(huán),影響人類健康,并負(fù)責(zé)環(huán)境中污染物質(zhì)的轉(zhuǎn)化。因此,深入分析微生物基因組序列不僅可以使人們系統(tǒng)的了解微生物多樣性及其所具有的功能,還能夠幫助人們了解環(huán)境微生物的作用機(jī)制,尤其是微生物與靶物質(zhì)之間的相互作用及調(diào)控機(jī)制[26]。基于基因組水平上的微生物基因序列比較分析,研究者們發(fā)現(xiàn)了大量的功能類似基因和新基因。自1995年完成首個(gè)細(xì)菌(Haemophilusinfluenzae)的全基因組序列測(cè)定,人們的研究重點(diǎn)由單個(gè)基因擴(kuò)展到基因組水平研究以及多基因間的互作機(jī)制。對(duì)于有機(jī)磷農(nóng)藥降解菌基因組的研究,可以在已完成測(cè)序的基因組序列基礎(chǔ)上,通過序列比對(duì)的方式來尋找與有機(jī)磷降解酶基因相似的序列。而且通過全基因組測(cè)序發(fā)現(xiàn)很多細(xì)菌中含有有機(jī)磷農(nóng)藥降解酶基因或相似基因[26,28]。隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,細(xì)菌全基因組數(shù)據(jù)不
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]類球紅細(xì)菌XR12的分離、鑒定及其解毒效果研究[J]. 曹海鵬,張書萌,虞晶晶,安健. 水生生物學(xué)報(bào). 2020(01)
[2]Bioinformatics and Expression Pattern Analysis of Tomato ns LTP 2-like cDNA full-length Gene Clone[J]. Zhang Jia,He Shan-shan,Zhao Ting-ting,Jiang Jing-bin,Li Jing-fu,Xu Xiang-yang. Journal of Northeast Agricultural University(English Edition). 2019(01)
[3]環(huán)境中有機(jī)磷農(nóng)藥污染狀況、來源及風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)[J]. 丁浩東,萬紅友,秦攀,劉曉暉,劉濤,南嵐,國(guó)曉春,畢斌,楊勇,盧少勇. 環(huán)境化學(xué). 2019(03)
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[5]有機(jī)磷農(nóng)藥污染土壤的微生物降解研究進(jìn)展[J]. 張娜娜,姜博,邢奕,連路寧,陳亞婷. 土壤. 2018(04)
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[8]Bacillus cereus HY-4對(duì)有機(jī)磷農(nóng)藥毒死蜱的降解特性[J]. 余利,段海明. 安徽科技學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(05)
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博士論文
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[3]芳香族污染物降解菌的分離及降解機(jī)理研究[D]. 任磊.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[4]Bacillus altitudinis SYBC hb4的分離鑒定及其過氧化氫酶性質(zhì)與應(yīng)用研究[D]. 張言周.江南大學(xué) 2016
[5]有機(jī)磷農(nóng)藥和硝酸鹽的電化學(xué)快速檢測(cè)方法研究[D]. 唐文志.浙江大學(xué) 2016
[6]農(nóng)藥降解菌施氏假單胞菌YC-YH1的分離鑒定及降解機(jī)理研究[D]. 史延華.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[7]致癌染料的生理毒性及分子機(jī)制研究[D]. 沈兵.浙江大學(xué) 2015
[8]飛蝗羧酸酯酶基因轉(zhuǎn)錄組分析及殺蟲劑解毒功能研究[D]. 張建琴.山西大學(xué) 2014
[9]煙嘧磺隆降解菌黃籃狀菌(Talaromyces flavus)的分離鑒定及降解機(jī)理研究[D]. 宋金龍.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
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碩士論文
[1]向日葵銹菌金屬蛋白酶基因的生物信息學(xué)分析及其原核表達(dá)[D]. 李鑫淳.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
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[5]堆肥中毒死蜱降解菌的篩選及其產(chǎn)生物表面活性劑研究[D]. 李鏡.湖南大學(xué) 2009
本文編號(hào):3567404
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