發(fā)布時間：2022-01-01 00:44

　　核盤菌（Sclerotinia sclerotiorum）能夠侵染世界范圍內(nèi)的600多種植物,是一種寄主范圍極其廣泛的死體營養(yǎng)型植物致病真菌。多種油料經(jīng)濟作物能夠被其侵染,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上造成巨大的經(jīng)濟損失。核盤菌是一種白色絲狀真菌,有自己完整的生活史,菌絲能夠形成質地堅硬的黑色菌核結構,該結構可以適應極端環(huán)境并且長期存活。一旦條件允許,菌核就會萌發(fā)生成有性結構子囊盤,成熟的子囊盤釋放大量的子囊孢子,子囊孢子可以萌發(fā)后再次形成菌絲,菌核上也能生長出白色菌絲。無論是菌絲還是子囊孢子都能夠侵染寄主,引發(fā)大范圍的農(nóng)作物致病,因此核盤菌的防治十分困難。為了更深入的了解核盤菌不同形態(tài)發(fā)育過程中的基因表達情況,更進一步完善核盤菌基因組數(shù)據(jù)庫的信息,我們進行了菌絲,菌核與子囊盤三個發(fā)育階段的比較轉錄組分析。獲取新基因并進行注釋,對核盤菌基因的可變剪接與SNP位點進行合理的預測分析。結合表達量的變化情況,通過GO,KEGG及COG的注釋及分類,對相關基因進行功能模塊的預測。對于轉錄組測序獲得的數(shù)據(jù),選取其中較大的一類鋅指蛋白轉錄因子家族基因進行深入分析,對其在核盤菌中不同形態(tài)發(fā)育過程中的表達情況進行統(tǒng)計,... 

【文章來源】：吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：131 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

核盤菌生活史示意圖(JeffreyA.Rollins)

圖 2.1 菌核和子囊盤的發(fā)育過程he Development of Sclerotium and Apothecia（from Jeffrey A.RolA-Seq 數(shù)據(jù)質控合成邊測序（Sequencing By Synthesis，SBS）技術，Illumina Hi平臺對 cDNA 文庫進行測序，產(chǎn)出大量的高質量 Reads 為原ta）經(jīng)過去除測序接頭以及引物序列；過濾低質量值數(shù)據(jù)。經(jīng)過之后得到的高質量 Reads 或堿基，獲得 Clean Data。使用序列2 將轉錄組測序 Reads 比對到基因組上，然后通過分析比對結果剪接點（Splicing Junction）。將比對到指定的參考基因組上的ed Reads，對應的數(shù)據(jù)為 Mapped Data。

吉林大學博士學位論文部分是功能未知基因，Swissprot_annotation 數(shù)據(jù)庫注釋獲親和、轉座子、脂肪酶、乙酰輔酶 A、功能未知的絲氨。菌核中特異性表達的基因有 129 條，蛋白數(shù)據(jù)庫中只為 U3 小核仁 RNA 相關蛋白，MAPK 信號通路的調(diào)節(jié)關的疏水蛋白Cryparin 前體和細胞壁完整性及抗性響應

【參考文獻】：
期刊論文
[1]結合于GATA元件的Ⅳ型鋅指蛋白[J]. 陳曉紅,印莉萍.  生命的化學. 1999(04)

博士論文
[1]基于RNA-seq的叢枝菌根真菌Gigaspora rosea基因構成及其共生發(fā)育相關基因的分析[D]. 唐年武.華中農(nóng)業(yè)大學 2016
[2]禾谷鐮刀菌AREA基因的功能研究[D]. 侯瑞.西北農(nóng)林科技大學 2015
[3]轉錄因子Ss-Nsd1和Ss-Fox1調(diào)控核盤菌有性及無性發(fā)育的功能研究[D]. 穆文輝.吉林大學 2013

碩士論文
[1]蕓薹生鏈格孢轉錄因子基因Ab06986的克隆與功能研究[D]. 張敏.山東農(nóng)業(yè)大學 2018
[2]禾谷鐮刀菌Fgwc1、Fgwc2和Fgvvd基因的功能分析[D]. 宋陽陽.華中農(nóng)業(yè)大學 2017
[3]核盤菌菌核的菌絲型萌發(fā)與侵染特性研究[D]. 母紅巖.華中農(nóng)業(yè)大學 2017
[4]核盤菌bZIP轉錄因子Ss-Adal的功能研究[D]. 陳景源.吉林大學 2014
[5]草酸在核盤菌（Sclerotinia sclerotiorum）與寄主植物互作中的生物學作用[D]. 李雙勝.浙江大學 2013



本文編號：3561310