茄科植物鏈格孢菌大孢子種分類研究及菌株YZU 161111全基因組測序
發(fā)布時間:2021-12-28 03:14
茄科植物廣泛分布于全球的溫帶及熱帶地區(qū),具有重要的經(jīng)濟(jì)、藥用及觀賞價值,我國有24屬約105種。鏈格孢菌屬是經(jīng)濟(jì)上重要的真菌屬之一,引起多種植物病害,造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失,如茄科植物的早疫病。本研究通過廣泛采集茄科植物病樣組織,并進(jìn)行菌株分離,對相關(guān)的鏈格孢菌大孢子種進(jìn)行了分類研究,并選取了一株代表菌株進(jìn)行了全基因組測序,結(jié)合菌絲和孢子兩個轉(zhuǎn)錄的測序,進(jìn)行了系統(tǒng)分析,具體研究體結(jié)果如下:2017-2019年,從內(nèi)蒙古、吉林、青海、甘肅、湖北等地采集茄科植物病樣,通過保濕培養(yǎng),共分離出鏈格孢菌大孢子種菌株78株。根據(jù)菌落形態(tài),寄主以及采集地的不同,篩選出14個菌株進(jìn)行基于Alt al、GAPDH、RPB2、ITS和TEF1五個基因的系統(tǒng)發(fā)育分析以及形態(tài)學(xué)的分類研究。共鑒定出5個不同種類,其中包含分離自酸漿上的一個新種,命名為Alternaria physalidis sp.nov.;分離自馬鈴薯上的A.blumeae,為中國一新記錄種;分離自馬鈴薯上的A.solani、曼陀羅上的A.crassa以及枸杞上的A.brassicae均為已知種類。此外,研究發(fā)現(xiàn)7個菌株的多個基因序列存在多個雜合...
【文章來源】:長江大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
基于Altal、GAPDH、RPB2、ITS和TEF1五個基因序列構(gòu)建的最大似然法系統(tǒng)發(fā)育樹,outgroup為AlternarianitrimaliCBS109163
AlternariablumeaeYZU171889的形態(tài)學(xué)特征
19此外,同時鑒定為Alternariasolani還有分離自湖北宜昌的菌株YZU161111以及分離自青海西寧的YZU171875,它們均從馬鈴薯中分離得到。A.solani能引起馬鈴薯、番茄、茄子、辣椒等茄科植物的早疫病,在我國乃至世界各地均有分布。圖2-5茄鏈格孢菌AlternariasolaniYZU171806的形態(tài)學(xué)特征。A:于PDA培養(yǎng)基上在25°C下生長7d后的菌落形態(tài)。B:PCA培養(yǎng)基上產(chǎn)生的分生孢子形態(tài)。比例尺為20μm。Fig.2-5MorphologicalcharacteristicsofAlternariasolaniYZU171806.A:ColonyonPDAfor7daysat25°C.B:ConidiaonPCA.Scalebar=20μm.2.3.5粗鏈格孢菌Alternariacrassa菌株YZU171882分離自吉林長春的曼陀羅病樣上,其在PDA培養(yǎng)基上生長7d后菌落淺黃至淺灰色,邊緣呈不規(guī)則圓形,菌絲較為稀疏,背面淺灰色,菌落直徑為43–45mm。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枸杞的生物學(xué)特性及開發(fā)利用[J]. 薛躍強,張建波,班振國,程麗清. 內(nèi)蒙古林業(yè)調(diào)查設(shè)計. 2016(03)
[2]新一代測序技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用[J]. 田李,張穎,趙云峰. 生物技術(shù)通報. 2015(11)
[3]從世界馬鈴薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展談中國馬鈴薯的主糧化[J]. 李文娟,秦軍紅,谷建苗,仇志軍,周俊,謝開云,盧肖平. 中國食物與營養(yǎng). 2015(07)
[4]菌物基因組測定研究進(jìn)展[J]. 劉淑艷,李廣,李玉. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2014(01)
[5]植物病原菌毒素的種類、作用機理和應(yīng)用前景[J]. 耿銳梅,張建萍,余柳青. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2007(05)
[6]矮牽牛繁殖的研究進(jìn)展[J]. 武術(shù)杰. 北方園藝. 2007(05)
[7]比較基因組學(xué)及其應(yīng)用[J]. 宋雪梅,李宏濱,杜立新. 生命的化學(xué). 2006(05)
[8]nr數(shù)據(jù)庫分析及其本地化[J]. 鄧泱泱,荔建琦,吳松鋒,朱云平,陳耀文,賀福初. 計算機工程. 2006(05)
[9]十字花科蔬菜種傳黑斑病研究進(jìn)展[J]. 肖長坤,李勇,李健強. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2003(05)
[10]鏈格孢屬真菌分類研究進(jìn)展[J]. 王洪凱,張?zhí)煊?張猛. 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2001(03)
博士論文
[1]鏈格孢菌比較基因組及bZIP轉(zhuǎn)錄因子功能研究[D]. 蓋云鵬.浙江大學(xué) 2019
[2]黑腐皮殼侵染蘋果的組織細(xì)胞學(xué)及轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 柯希望.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[3]鏈格孢屬真菌現(xiàn)代分類方法研究[D]. 孫霞.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]茄鏈格孢全基因組測序及SSR分子標(biāo)記的開發(fā)[D]. 何佳昱.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號:3553289
【文章來源】:長江大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
基于Altal、GAPDH、RPB2、ITS和TEF1五個基因序列構(gòu)建的最大似然法系統(tǒng)發(fā)育樹,outgroup為AlternarianitrimaliCBS109163
AlternariablumeaeYZU171889的形態(tài)學(xué)特征
19此外,同時鑒定為Alternariasolani還有分離自湖北宜昌的菌株YZU161111以及分離自青海西寧的YZU171875,它們均從馬鈴薯中分離得到。A.solani能引起馬鈴薯、番茄、茄子、辣椒等茄科植物的早疫病,在我國乃至世界各地均有分布。圖2-5茄鏈格孢菌AlternariasolaniYZU171806的形態(tài)學(xué)特征。A:于PDA培養(yǎng)基上在25°C下生長7d后的菌落形態(tài)。B:PCA培養(yǎng)基上產(chǎn)生的分生孢子形態(tài)。比例尺為20μm。Fig.2-5MorphologicalcharacteristicsofAlternariasolaniYZU171806.A:ColonyonPDAfor7daysat25°C.B:ConidiaonPCA.Scalebar=20μm.2.3.5粗鏈格孢菌Alternariacrassa菌株YZU171882分離自吉林長春的曼陀羅病樣上,其在PDA培養(yǎng)基上生長7d后菌落淺黃至淺灰色,邊緣呈不規(guī)則圓形,菌絲較為稀疏,背面淺灰色,菌落直徑為43–45mm。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枸杞的生物學(xué)特性及開發(fā)利用[J]. 薛躍強,張建波,班振國,程麗清. 內(nèi)蒙古林業(yè)調(diào)查設(shè)計. 2016(03)
[2]新一代測序技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用[J]. 田李,張穎,趙云峰. 生物技術(shù)通報. 2015(11)
[3]從世界馬鈴薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展談中國馬鈴薯的主糧化[J]. 李文娟,秦軍紅,谷建苗,仇志軍,周俊,謝開云,盧肖平. 中國食物與營養(yǎng). 2015(07)
[4]菌物基因組測定研究進(jìn)展[J]. 劉淑艷,李廣,李玉. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2014(01)
[5]植物病原菌毒素的種類、作用機理和應(yīng)用前景[J]. 耿銳梅,張建萍,余柳青. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2007(05)
[6]矮牽牛繁殖的研究進(jìn)展[J]. 武術(shù)杰. 北方園藝. 2007(05)
[7]比較基因組學(xué)及其應(yīng)用[J]. 宋雪梅,李宏濱,杜立新. 生命的化學(xué). 2006(05)
[8]nr數(shù)據(jù)庫分析及其本地化[J]. 鄧泱泱,荔建琦,吳松鋒,朱云平,陳耀文,賀福初. 計算機工程. 2006(05)
[9]十字花科蔬菜種傳黑斑病研究進(jìn)展[J]. 肖長坤,李勇,李健強. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2003(05)
[10]鏈格孢屬真菌分類研究進(jìn)展[J]. 王洪凱,張?zhí)煊?張猛. 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2001(03)
博士論文
[1]鏈格孢菌比較基因組及bZIP轉(zhuǎn)錄因子功能研究[D]. 蓋云鵬.浙江大學(xué) 2019
[2]黑腐皮殼侵染蘋果的組織細(xì)胞學(xué)及轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 柯希望.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[3]鏈格孢屬真菌現(xiàn)代分類方法研究[D]. 孫霞.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]茄鏈格孢全基因組測序及SSR分子標(biāo)記的開發(fā)[D]. 何佳昱.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號:3553289
本文鏈接:http://www.sikaile.net/kejilunwen/nykj/3553289.html
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