為了從轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組水平上揭示巴西蕉響應(yīng)鹽脅迫環(huán)境的分子機(jī)制,本研究以中國(guó)主栽品種‘巴西蕉’（Musa paradisiaca）為試驗(yàn)材料,人工模擬鹽脅迫60 mmol/L NaCl分別處理0 h、12 h和24 h,利用RNA-Seq和iTRAQ技術(shù)對(duì)葉片進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組關(guān)聯(lián)分析。本研究共鑒定出68個(gè)與差異基因表達(dá)趨勢(shì)相同的差異蛋白,其中13個(gè)上調(diào),55個(gè)下調(diào)。這些差異蛋白功能涉及細(xì)胞骨架、結(jié)構(gòu)、抗氧化物、脅迫防御、代謝和其它未知功能蛋白等。上調(diào)表達(dá)的蛋白主要參與了細(xì)胞骨架、結(jié)構(gòu)和脅迫防御等,包括微管蛋白、凝集素和β-半乳糖苷酶等;下調(diào)表達(dá)的蛋白主要參與抗氧化物和代謝等,主要包括放氧增強(qiáng)蛋白、半胱氨酸合酶、蔗糖合酶等。通過(guò)高通量多組學(xué)數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)分析為深入認(rèn)識(shí)巴西蕉響應(yīng)鹽脅迫的分子調(diào)控機(jī)制提供了理論依據(jù)。 

【文章來(lái)源】：分子植物育種. 2020,18(23)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

巴西蕉葉片蛋白質(zhì)組鑒定基本信息統(tǒng)計(jì)

通過(guò)基因本體(gene ontology,GO)分析來(lái)判斷差異表達(dá)基因所承擔(dān)的生物學(xué)功能。在關(guān)聯(lián)分析下，將與m RNA表達(dá)趨勢(shì)一致的差異蛋白進(jìn)行GO功能分類，在細(xì)胞組分中，主要表現(xiàn)在細(xì)胞、細(xì)胞部分、細(xì)胞器等方面；在分子功能中，主要表現(xiàn)在催化活性和結(jié)合；在生物過(guò)程中，主要參與刺激響應(yīng)、代謝過(guò)程和細(xì)胞過(guò)程等(圖3)。

通過(guò)m RNA水平和蛋白質(zhì)水平這兩個(gè)層面進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，鹽脅迫下，香蕉葉片鑒定出68個(gè)與差異基因表達(dá)趨勢(shì)相同的差異蛋白，其中13個(gè)上調(diào)，55個(gè)下調(diào)，差異基因篩選條件為FDR<0.05且|log2FC|>1；篩選差異蛋白條件為，表達(dá)倍數(shù)大于1.2為上調(diào)蛋白和小于0.83為下調(diào)蛋白且FDR<0.05。圖4 與差異基因變化趨勢(shì)相反的差異蛋白

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3355871