抗氟苯蟲酰胺小菜蛾的轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究
發(fā)布時間：2021-06-05 13:45
小菜蛾（Plutella xylostella L.）是鱗翅目世界性害蟲,主要危害十字花科蔬菜,每年都會造成巨大的經(jīng)濟損失。目前小菜蛾幾乎對所有化學(xué)殺蟲劑都產(chǎn)生了抗藥性。自氟苯蟲酰胺問世以來,由于不合理的用藥使得小菜蛾對該藥劑抗藥性發(fā)展迅速。為探討小菜蛾對氟苯蟲酰胺的抗性機制,本項目以敏感品系S、室內(nèi)篩選的氟苯蟲酰胺抗性品系Rh、田間抗性種群Rb和槲皮素處理的氟苯蟲酰胺抗性品系QRh四個品系/種群為研究對象,分別利用RNA-seq和iTRAQ進(jìn)行組學(xué)測序,對獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行比較分析,為揭示抗性小菜蛾的生物學(xué)特征,小菜蛾抗性和敏感品系在轉(zhuǎn)錄和蛋白水平上的差異,和小菜蛾對氟苯蟲酰胺抗性機理研究提供有力的支持。研究結(jié)果如下:1.在前期研究的基礎(chǔ)上,以實驗室篩選的氟苯蟲酰胺抗性品系,反向汰選獲得4946位點為GAG純合基因型的抗性品系,再進(jìn)一步進(jìn)行氟苯蟲酰胺選擇壓抗性汰選,獲得抗性倍數(shù)為1889.82倍的基因型為GAG的小菜蛾抗氟苯蟲酰胺品系（Rh）。測得小菜蛾田間抗性種群（Rb）對氟苯...
【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】：74 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
信息分析流程圖
圖 2 信息分析流程Fig2. Bioinformatics Analysis Pipeline譜數(shù)據(jù)經(jīng)過相應(yīng)工具轉(zhuǎn)換成 mgf 格式文件后，用蛋白質(zhì)鑒定軟件庫搜索鑒定。質(zhì)控分析同時進(jìn)行以判斷本次數(shù)據(jù)是否合格。數(shù)據(jù)合閾值，得到最終可信的蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果。隨后進(jìn)行 iTRAQ 定量分選出我們更為關(guān)心的顯著差異蛋白。在有重復(fù)實驗的情況下，定量次定量數(shù)據(jù)質(zhì)量是否達(dá)到標(biāo)準(zhǔn)。最后會進(jìn)行 GO、Pathway、COG白的 GO、Pathway 富集分析。 iTRAQ 定量 數(shù)據(jù)的定量我們采用華大自主研發(fā)的 IQuant（Wen et al., 2014）軟ascot Percolator（Brosch et al., 2014）算法，該算法采用機器學(xué)習(xí)算結(jié)果進(jìn)行重新打分，從而提高結(jié)果的鑒定率。首先在譜圖/肽段水（PSM-level FDR<=0.01），從而獲得顯著性鑒定的譜圖和肽段列表
圖 3 氟苯蟲酰胺抗性品系總 RNA 檢測Fig.3 Detection of flubendiamide-resistance strain total RNA：1～12 敏感品系 4 齡小菜蛾單頭蟲體總 RNA 提取結(jié)果（重復(fù) 12 次 The results of total RNA isolation from single-headed larvae of the fourth-xylostella in susceptible strains, 12 replicates增片段的檢測%瓊脂糖凝膠電泳檢測目的片段 PCR 擴增結(jié)果（圖 4），目的條增條帶，無引物二聚體，目的條帶大小約為 110bp，表明本次，可用于后續(xù)測序?qū)嶒灐?
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]氯蟲苯甲酰胺對小菜蛾魚尼丁受體基因mRNA表達(dá)量的影響[J]. 孫麗娜,楊代斌,芮昌輝,崔麗,袁會珠. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2012(02)
[2]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[3]蛋白質(zhì)組技術(shù)在昆蟲抗藥性機理研究中的應(yīng)用[J]. 程濱,程羅根,羅勛. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(21)
[4]甜菜夜蛾對氯氟氰菊酯抗性的表皮穿透機理[J]. 劉永杰,沈晉良. 昆蟲學(xué)報. 2003(03)
[5]昆蟲解毒酶解毒機理及其在農(nóng)藥污染治理中的應(yīng)用[J]. 黃菁,喬傳令. 農(nóng)業(yè)環(huán)境保護. 2002(03)
[6]表皮穿透和GABAA受體不敏感性在小菜蛾對阿維菌素抗性中的作用[J]. 吳青君,張文吉,張友軍,徐寶云,朱國仁. 昆蟲學(xué)報. 2002(03)
[7]棉鈴蟲對氰戊菊酯抗性機理研究[J]. 吳益東,沈晉良,譚福杰,尤子平. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1995(02)
博士論文
[1]貴州白背飛虱抗藥性動態(tài)監(jiān)測及其抗性相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D]. 金劍雪.貴州大學(xué) 2017
[2]小菜蛾對Bt Cry1Ac毒素抗性的分子機制研究[D]. 郭兆將.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[3]抗Cry1Ac殺蟲晶體蛋白近等基因系小菜蛾中腸蛋白質(zhì)基因組學(xué)研究[D]. 朱勛.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]淡色庫蚊抗藥性比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王衛(wèi)杰.南京醫(yī)科大學(xué) 2014
本文編號：3212277
【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】：74 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
信息分析流程圖
圖 2 信息分析流程Fig2. Bioinformatics Analysis Pipeline譜數(shù)據(jù)經(jīng)過相應(yīng)工具轉(zhuǎn)換成 mgf 格式文件后，用蛋白質(zhì)鑒定軟件庫搜索鑒定。質(zhì)控分析同時進(jìn)行以判斷本次數(shù)據(jù)是否合格。數(shù)據(jù)合閾值，得到最終可信的蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果。隨后進(jìn)行 iTRAQ 定量分選出我們更為關(guān)心的顯著差異蛋白。在有重復(fù)實驗的情況下，定量次定量數(shù)據(jù)質(zhì)量是否達(dá)到標(biāo)準(zhǔn)。最后會進(jìn)行 GO、Pathway、COG白的 GO、Pathway 富集分析。 iTRAQ 定量 數(shù)據(jù)的定量我們采用華大自主研發(fā)的 IQuant（Wen et al., 2014）軟ascot Percolator（Brosch et al., 2014）算法，該算法采用機器學(xué)習(xí)算結(jié)果進(jìn)行重新打分，從而提高結(jié)果的鑒定率。首先在譜圖/肽段水（PSM-level FDR<=0.01），從而獲得顯著性鑒定的譜圖和肽段列表
圖 3 氟苯蟲酰胺抗性品系總 RNA 檢測Fig.3 Detection of flubendiamide-resistance strain total RNA：1～12 敏感品系 4 齡小菜蛾單頭蟲體總 RNA 提取結(jié)果（重復(fù) 12 次 The results of total RNA isolation from single-headed larvae of the fourth-xylostella in susceptible strains, 12 replicates增片段的檢測%瓊脂糖凝膠電泳檢測目的片段 PCR 擴增結(jié)果（圖 4），目的條增條帶，無引物二聚體，目的條帶大小約為 110bp，表明本次，可用于后續(xù)測序?qū)嶒灐?
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]氯蟲苯甲酰胺對小菜蛾魚尼丁受體基因mRNA表達(dá)量的影響[J]. 孫麗娜,楊代斌,芮昌輝,崔麗,袁會珠. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2012(02)
[2]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[3]蛋白質(zhì)組技術(shù)在昆蟲抗藥性機理研究中的應(yīng)用[J]. 程濱,程羅根,羅勛. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(21)
[4]甜菜夜蛾對氯氟氰菊酯抗性的表皮穿透機理[J]. 劉永杰,沈晉良. 昆蟲學(xué)報. 2003(03)
[5]昆蟲解毒酶解毒機理及其在農(nóng)藥污染治理中的應(yīng)用[J]. 黃菁,喬傳令. 農(nóng)業(yè)環(huán)境保護. 2002(03)
[6]表皮穿透和GABAA受體不敏感性在小菜蛾對阿維菌素抗性中的作用[J]. 吳青君,張文吉,張友軍,徐寶云,朱國仁. 昆蟲學(xué)報. 2002(03)
[7]棉鈴蟲對氰戊菊酯抗性機理研究[J]. 吳益東,沈晉良,譚福杰,尤子平. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1995(02)
博士論文
[1]貴州白背飛虱抗藥性動態(tài)監(jiān)測及其抗性相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D]. 金劍雪.貴州大學(xué) 2017
[2]小菜蛾對Bt Cry1Ac毒素抗性的分子機制研究[D]. 郭兆將.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[3]抗Cry1Ac殺蟲晶體蛋白近等基因系小菜蛾中腸蛋白質(zhì)基因組學(xué)研究[D]. 朱勛.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]淡色庫蚊抗藥性比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王衛(wèi)杰.南京醫(yī)科大學(xué) 2014
本文編號：3212277
本文鏈接：http://www.sikaile.net/kejilunwen/nykj/3212277.html
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