線粒體基因組因為快速進化、嚴格遵守母系遺傳等特點已廣泛應用到遺傳結構與系統(tǒng)分類的生物學研究,是研究真菌系統(tǒng)進化與遺傳關系的有效工具。作為昆蟲病原真菌中已有普遍應用的綠僵菌屬真菌（Metarhizium）,其線粒體基因組數(shù)據(jù)尚不完整。為了進一步完善綠僵菌屬線粒體基因組數(shù)據(jù),深入昆蟲病原真菌遺傳與進化的研究,本論文選取羅伯茨綠僵菌（Metarhizium robertsii）ARSEF 2575,采用PDA固體培養(yǎng)基培養(yǎng)、CTAB法提取總DNA,經高通量測序、PCR擴增、Sanger測序成功組裝其線粒體基因組并進行注釋分析,結合在NCBI上已有的麥角菌科真菌的相關數(shù)據(jù),開展比較線粒體基因組學比較,對17種肉座菌目真菌的14個常見的線粒體蛋白的氨基酸序列進行系統(tǒng)發(fā)育關系的重建。結果如下:羅伯茨綠僵菌ARSEF 2575的完整線粒體基因組大小為24945 bp,包含14個常見蛋白編碼基因、2個核糖體RNA基因和25個轉運RNA基因,蛋白編碼基因的種類和排列順序與已經報道的麥角菌科真菌基本一致。此外,同多數(shù)真菌相似,羅伯茨綠僵菌線粒體基因組的蛋白編碼基因、tRNA基因以及核糖體RNA基因均有明顯... 

【文章來源】：山西大學山西省

【文章頁數(shù)】：54 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

Metarhiziumrobertsii線粒體基因組結構圖

的菌種所聚集成的幾個分支則距離Metarhizium robertsii親緣關系較遠，從整體上來看，該系統(tǒng)進化樹與目前的分類系統(tǒng)基本符合一致。圖2-2 基于14個蛋白編碼基因構建的系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 2-2 Phylogenetic tree based on 14 protein-coding genes.

Fig.3-3 Intergenic region of Clavicipitaceae mitogenome3.3.6 麥角菌科線粒體基因組的蛋白編碼基因以及內含子的比較在麥角菌科真菌中，7個線粒體基因組中呈現(xiàn)比較明顯的差異（圖3-4），Metarhizium robertsii、Metarhizium anisopliae、Pochonia chlamydosporia、Paecilomyceshepiali之間的蛋白編碼基因大小比較類似，而Epichloe屬的3個菌種Epichloe festucae、Epichloe hybrid、Epichloe typhina的蛋白編碼基因區(qū)域則明顯較大。將7個菌種的14個蛋白編碼基因比較之后，我們發(fā)現(xiàn)在Epichloe屬的7個基因當中有數(shù)量不等的內含子（圖3-3）。Epichloe屬的3個菌種Epichloe festucae、Epichloe hybrid、Epichloe typhina中的內含子在蛋白編碼基因中的位置與大小，內含子數(shù)量從1-7不等，7個擁有內含子的基因當中，Epichloe typhina中的cox1基因是含有內含子數(shù)量最多的基因，而Epichloefestucae、Epichloe hybrid、Epichloe typhina的nad1基因和Epichloe festucae、Epichloehybrid中的nad2基因是內含子數(shù)量最少的基因。從總體上來看

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本文編號：3138027