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一株土壤新種Rhodopseudomonas albus SK50-23~T的分類鑒定

發(fā)布時間:2020-08-25 14:06
【摘要】:光合細(xì)菌(Photosynthetic bacteria)是自然界中普遍存在的,具有原始光能合成體系的厭氧光照條件下生長的原核生物。光合細(xì)菌在自然界中廣泛分布于江河、湖泊、稻田、沼池、土壤、極地和溫泉等處。光合細(xì)菌依據(jù)所含光合色素和電子供體的不同分為產(chǎn)氧光合細(xì)菌和不產(chǎn)氧光合細(xì)菌。而紫色非硫細(xì)菌是不產(chǎn)氧光合細(xì)菌中的重要分支,其中紅假單胞菌屬(Rhodopseudomonas)主要存在于溝渠的表層水、淡水、微咸水、海洋棲息地及稻田和缺氧的潮汐池。之前,鉈耐性細(xì)菌菌株SK50-23~T是從鉈脅迫土壤懸浮液中作為優(yōu)勢菌被分離出,其16S rRNA部分基因序列與已知的紅假單胞菌(Rhodopseudomonas)模式菌株的相似度達(dá)96%。為此本論文對菌株SK50-23~T從形態(tài)結(jié)構(gòu)、遺傳學(xué)、生理生化學(xué)、化學(xué)成分分析等方面進(jìn)行了新菌的分類鑒定。菌株SK50-23~T的16S rRNA基因序列與其最親緣的非光合營養(yǎng)的“Rhodopseudomonas boonkerdii”NS23,具有97.9%的相似性,而與Rhodopseudomonas屬其他菌株的相似性為95.5-96.7%。菌株SK50-23~T適合生長溫度為15-32℃,最適生長pH和NaCl濃度分別為6-7和0%。碳源利用實驗顯示只能利用葡萄糖酸鹽。酶活性檢測試驗中堿性磷酸酶,酯酶(C4),酯酶脂肪酶(C8),亮氨酸芳基酰胺酶和酸性磷酸酶呈陽性,萘酚磷酸水解酶呈弱陽性。存在氧化酶,過氧化氫酶和脲酶,吲哚產(chǎn)量為陰性。硝酸鹽被還原為N_2。主要脂肪酸(10%)是C18:1ω7c(54.9%)和C18:0(14.8%),C16:1ω7c(13.5%)和C16:0(12.6%),次要脂肪酸是C17:0環(huán)(2.6%),C17:0(0.9%)和未鑒定的脂肪酸(0.7%)。主要的泛醌是Q-10。菌株的DNA G+C含量為61.9mol%。此外,該菌株既沒有檢測出光合功能基因,也不能利用光進(jìn)行光合作用生長。基于形態(tài)學(xué)、化學(xué)分類學(xué)和16S rRNA基因的系統(tǒng)發(fā)育上表現(xiàn)出來的特征,認(rèn)定菌株SK 50-23~T為紅假單胞菌屬的一個細(xì)菌新種。在本文章中我們建議修正的Rhodopseudomonas屬包括非光合生物。因此,提出菌株SK50-23~T被分類為紅假單胞菌屬的新種,命名為Rhodopseudomonas albus sp.nov.模式菌株為SK50-23~T,菌種保藏號分別為NBRC 108825~T和CGMCC No.1.12037~T。菌株SK50-23屬于α-變形菌綱紫色非硫細(xì)菌類群中的紅假單胞菌屬(Rhodopseudomonas)。本研究的意義在于豐富菌種資源的同時為光合細(xì)菌物種進(jìn)化角度和環(huán)境適應(yīng)性等方面的研究打下基礎(chǔ),對深入研究紫色非硫細(xì)菌類群的特性具有一定的現(xiàn)實意義。
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S154.3
【圖文】:

紅假單胞菌,代謝模式


圖1.1 Rhodopseudomonas Palustris的四種代謝方式Fig 1.1 Four metabolic modes of Rhodopseudomonas Palustris正是因為紅假單胞菌(Rhodopseudomonas)屬有多種代謝模式,才能夠讓其在不同

技術(shù)路線圖


技術(shù)路線圖

菌株,活性實驗,基因序列


圖 3.1 菌株 SK50-23 基于 16S rRNA 基因序列的鄰接系統(tǒng)發(fā)育樹Fig 3.1. Neighbour-joining phylogenetic tree based on 16S rRNA gene sequences.3.2 光合功能活性實驗及基因檢測結(jié)果

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本文編號:2803789

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