本文關鍵詞： 堆肥化 GH家族基因 PCR-DGGE 冗余分析 蒙特卡羅置換檢驗　出處：《環(huán)境科學》2017年11期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：采用PCR-DGGE技術,研究農業(yè)廢物稻草堆肥化過程中參與纖維素降解的糖苷水解酶GH6家族基因的變化,并使用冗余分析(redundancy analysis,RDA)和蒙特卡羅置換檢驗(Monte Carlo permutation test)研究了生物信息矩陣與環(huán)境因子矩陣間的相關性.結果表明,8個理化參數(shù)對GH6家族基因變化影響的相對大小為:p H堆體溫度TN(total nitrogen)TOM(total organic matters)C/N(TOC/TN)含水率環(huán)境溫度WSC(water soluble carbon),8個理化參數(shù)共解釋了83.1%的GH6家族基因變化,對GH6家族基因變化有重要影響,其中pH(P=0.002)、堆體溫度(P=0.004)和TN(P=0.004)是影響GH6家族基因變化的顯著因子,三者分別解釋了24.92%、15.57%和15.04%的GH6家族基因變化.含GH6家族基因的優(yōu)勢菌種在堆體不同時期有所不同.GH6家族基因的多樣性和豐度隨堆肥化進程整體呈現(xiàn)出波動趨勢.基于冗余分析的t-value分析表明3個顯著因子對GH6家族基因的動態(tài)變化具有不同的正負相關性.
[Abstract]:PCR-DGGE technique was used to study the changes of glycoside hydrolase (GH6) family genes involved in cellulose degradation during rice straw composting. The correlation between biologic information matrix and environmental factor matrix was studied by using redundancy analysis and Monte Carlo permutation test (Monte Carlo Carlo permutation test). The results showed that the effects of eight physical and chemical parameters on GH6 family genes were as follows: 1. TN(total nitrogen)TOM(total organic matters (C / NTOC / TNN) water content environmental temperature WSC(water soluble carbon.Eighteen physicochemical parameters explain the changes of GH6 family genes in 83.1%. The gene changes of GH6 family were significantly affected by P0. 002, P0. 004) and P0. 004). The variation of GH6 family genes in 24.92% and 15.04%% was explained respectively. The diversity and abundance of GH6 family genes in dominant strains containing GH6 family genes were different at different stages of the heap. The diversity and abundance of GH6 family genes fluctuated with the composting process as a whole. T-value analysis of redundancy analysis showed that three significant factors had different positive and negative correlations to the dynamic changes of GH6 family genes.
【作者單位】： 湖南大學環(huán)境科學與工程學院;環(huán)境生物與控制教育部重點實驗室(湖南大學);湖南城市學院市政與測繪工程學院;湖南省林業(yè)科學院生物環(huán)境工程研究所;
【基金】：國家自然科學基金項目(51378190,51521006,51578222,51579094) 湖南省自然科學基金項目(13JJB002) 湖南省科技廳重點研發(fā)計劃項目(2016SK2045) 湖南省教育廳創(chuàng)新平臺開放基金項目(17K019)
【分類號】：S141.4

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本文編號：1526686