發(fā)布時(shí)間：2017-11-23 18:04

  本文關(guān)鍵詞：馬鈴薯青枯菌Po82菌株質(zhì)�；蚪M分泌蛋白信號(hào)肽的分析

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【摘要】：應(yīng)用計(jì)算機(jī)技術(shù)和生物信息學(xué)的方法,采用Signal P4.0、Lipo P1.0、Target P1.0.1、TMHMM2.0蛋白質(zhì)分析軟件對(duì)植物病原細(xì)菌Ralstonia solanacearum Po82質(zhì)�；蚪M的1680個(gè)ORFs編碼的分泌蛋白信號(hào)肽氨基酸序列進(jìn)行預(yù)測(cè)分析。結(jié)果表明,質(zhì)�；蚪M的1680個(gè)ORFs中有102個(gè)ORFs所編碼的蛋白質(zhì)具有N-端信號(hào)肽序列,包括85個(gè)Ⅰ型信號(hào)肽,1個(gè)Ⅱ型信號(hào)肽,15個(gè)Prepilin-like信號(hào)肽和1個(gè)細(xì)菌素和信息素信號(hào)肽,所有的分泌蛋白中具有RR-motif信號(hào)肽結(jié)構(gòu)的有14個(gè),且均為Ⅰ型信號(hào)肽。在102個(gè)具有可切割信號(hào)肽的分泌蛋白中,有50.98%的蛋白質(zhì)為胞外分泌型(S型),33.33%為線(xiàn)粒體分泌型(M型),6.87%為葉綠體分泌型(C型),8.82%為其他類(lèi)型的分泌蛋白。信號(hào)肽切割位點(diǎn)的氨基酸組成中非極性氨基酸為53.27%,極性氨基酸為18.79%,帶負(fù)電荷的酸性氨基酸為19.12%,帶正電荷的堿性氨基酸為8.82%。比較R.solanacearum GMI1000和R.solanacearum Po82質(zhì)�；蚪M信號(hào)肽類(lèi)型的區(qū)別,發(fā)現(xiàn)這2種菌在信號(hào)肽類(lèi)型上存在很大差異。文章通過(guò)對(duì)R.solanacearum Po82質(zhì)�；蚪M信號(hào)肽分泌蛋白的研究,揭示了該病原菌與寄主互作的致病機(jī)制在長(zhǎng)期進(jìn)化中的獨(dú)特地位。
【作者單位】： 農(nóng)業(yè)生物多樣性與病蟲(chóng)害控制教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專(zhuān)項(xiàng)經(jīng)費(fèi)項(xiàng)目“作物細(xì)菌性病害防控技術(shù)研究與示范”(201303015)
【分類(lèi)號(hào)】：S432.4
【正文快照】： 茄科雷爾氏菌[Ralstonia solanacearum(Smith)Yabuuhi et al.]是一種植物病原性細(xì)菌,該菌屬于β-變形菌亞門(mén)的一類(lèi)生長(zhǎng)于土壤的革蘭氏陰性細(xì)菌[1],主要分布在熱帶、亞熱帶和溫帶地區(qū)且寄主廣泛。茄科雷爾氏菌能侵染包括茄科、豆科在內(nèi)50多個(gè)科200多種作物[2],主要破壞宿主植物，

本文編號(hào)：1219326