家蠶金屬羧肽酶基因家族的鑒定與表達(dá)分析
發(fā)布時間:2017-10-08 01:34
本文關(guān)鍵詞:家蠶金屬羧肽酶基因家族的鑒定與表達(dá)分析
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【摘要】:金屬羧肽酶是昆蟲消化管中參與食物消化吸收的重要酶類,并可能在昆蟲變態(tài)、發(fā)育、抗病免疫等多種生命過程中發(fā)揮重要作用。利用家蠶全基因組數(shù)據(jù)庫,基于同源搜索和隱馬爾可夫模型搜索相結(jié)合的方法,對家蠶金屬羧肽酶基因家族進(jìn)行鑒定。全基因組預(yù)測家蠶的金屬羧肽酶基因家族包括22個成員,推導(dǎo)的氨基酸序列均具有鋅離子結(jié)合位點(diǎn)和金屬羧肽酶M14的保守特征。根據(jù)其保守氨基酸序列不同,家蠶的金屬羧肽酶分屬于M14A、M14B和M14D 3個亞家族。通過RTPCR方法檢測顯示22個家蠶金屬羧肽酶基因中有18個基因在家蠶不同組織和發(fā)育時期中表達(dá),其中7個基因在家蠶5齡第3天幼蟲中腸組織特異高量表達(dá),提示金屬羧肽酶在家蠶對營養(yǎng)物質(zhì)的消化吸收中有重要作用;家蠶5齡幼蟲添食感染Bm NPV后24 h內(nèi),中腸中有5個金屬羧肽酶基因上調(diào)表達(dá),表現(xiàn)出對病原微生物侵染的應(yīng)答反應(yīng)。研究結(jié)果有助于解析家蠶金屬羧肽酶在蠶體對營養(yǎng)物質(zhì)的消化和對病原物入侵應(yīng)答中的功能作用。
【作者單位】: 家蠶基因組生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 農(nóng)業(yè)部蠶桑功能基因組與生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 金屬羧肽酶基因 全基因組預(yù)測 序列結(jié)構(gòu) 表達(dá)分析
【基金】:公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(No.201403049)
【分類號】:S881.2;Q78
【正文快照】: 羧肽酶(carboxypeptidase,CPs)是一類肽鏈端解酶,作用于肽鏈的游離羧基末端降解釋放單個游離氨基酸。羧肽酶廣泛存在于高等植物和動物的組織器官中以及真菌中。已明確不同物種的羧肽酶在多個組織和生長發(fā)育時期有重要功能,其中動物體內(nèi)的羧肽酶在食物消化、組織解離和酶原活化
【相似文獻(xiàn)】
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 龍菲菲;家蠶金屬羧肽酶基因的克隆分析與功能研究[D];蘇州大學(xué);2012年
,本文編號:991286
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