本文關(guān)鍵詞：2種類(lèi)型的煙草扭脈病毒外殼蛋白基因的序列和結(jié)構(gòu)分析

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【摘要】：煙草叢頂病主要由煙草叢頂病毒(Tobacco bushy top virus,TBTV)和煙草扭脈病毒(Tobacco vein distorting virus,TVDV)復(fù)合侵染引起。其中,TVDV的CP蛋白可分別包裝TBTV和TVDV形成病毒粒子;但也存在TVDV單獨(dú)侵染不攜帶TBTV的病樣。本文利用RT-PCR對(duì)自然狀態(tài)下攜帶TBTV的TVDV(采自云南彌渡)和不攜帶TBTV的TVDV(采自云南保山)的cp基因進(jìn)行序列克隆,發(fā)現(xiàn)TVDV彌渡分離物的cp基因?yàn)?18個(gè)核苷酸,而TVDV保山分離物的cp基因?yàn)?21個(gè)核苷酸,二者的核苷酸序列一致性為90.02%,氨基酸序列一致性為89.81%;而長(zhǎng)度相同的TVDV cp基因序列一致性為98.5%~100%。表明這2個(gè)cp基因?qū)儆?種不同類(lèi)型。系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析也表明這2個(gè)cp基因?qū)儆谶M(jìn)化距離較遠(yuǎn)的2個(gè)群。利用SWISS-MODEL進(jìn)行同源建模,發(fā)現(xiàn)2種類(lèi)型的TVDV CP蛋白的主要空間結(jié)構(gòu)域基本一致,存在細(xì)小的結(jié)構(gòu)域及結(jié)構(gòu)域之間無(wú)規(guī)則卷曲角度的差異,整體空間結(jié)構(gòu)沒(méi)有發(fā)生明顯改變。推斷TVDV保山分離物CP蛋白中關(guān)鍵氨基酸的序列突變是導(dǎo)致CP無(wú)法包裝TBTV,從而在病害傳播過(guò)程中丟失TBTV的主要因素。
【作者單位】： 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院山東省農(nóng)業(yè)微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)生物多樣性控制病蟲(chóng)害教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 煙草扭脈病毒 煙草叢頂病毒 外殼蛋白 同源建模
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31370179) 山東省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(ZR2013CM015)
【分類(lèi)號(hào)】：S432.41
【正文快照】： 煙草叢頂病1993年在我國(guó)云南保山地區(qū)首次大面積爆發(fā)流行。1996年和1998年該病在云南省三江流域再度大規(guī)模流行,對(duì)部分煙區(qū)造成毀滅性損失。截至2001年,累計(jì)發(fā)病51 300 hm2,約17%田塊絕收[1]。近年來(lái)通過(guò)對(duì)該病主要傳播介體—蚜蟲(chóng)的綜合防治,其發(fā)生程度大大減輕[2]。典型的煙

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1 李凡,錢(qián)寧剛,張雪峰,吳建宇,孔寶華,周雪平,陳海如;煙草扭脈病毒復(fù)制酶基因克隆及序列分析[J];云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2003年02期

2 李凡,錢(qián)寧剛,楊根華,吳建宇,周雪平,陳海如;煙草扭脈病毒外殼蛋白基因克隆及序列分析[J];云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2002年04期

3 ;[J];;年期

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本文編號(hào)：975908