本文關(guān)鍵詞：基于代謝網(wǎng)絡(luò)預(yù)測菌種基因改造靶點方法的研究進展

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【摘要】：高產(chǎn)特定產(chǎn)品的人工細(xì)胞工廠的構(gòu)建需要對野生菌株進行大量的基因工程改造,近年來隨著大量基因組尺度代謝網(wǎng)絡(luò)模型的構(gòu)建,人們提出了多種基于代謝網(wǎng)絡(luò)分析預(yù)測基因改造靶點以使某一目標(biāo)化合物合成最優(yōu)的方法。這些方法利用基因組尺度代謝網(wǎng)絡(luò)模型中的反應(yīng)計量關(guān)系約束和反應(yīng)不可逆性約束等,通過約束優(yōu)化的方法預(yù)測可使產(chǎn)物合成最大化的改造靶點,避免了傳統(tǒng)的通過相關(guān)途徑的直觀分析確定靶點的方法的局限性和主觀性,為細(xì)胞工廠的理性設(shè)計提供了新的思路。以下結(jié)合作者的實際研究經(jīng)驗,對這些菌種優(yōu)化方法的原理、優(yōu)缺點及適用性等進行詳細(xì)介紹,并討論了目前存在的主要問題和未來的研究方向,為人們針對不同目標(biāo)產(chǎn)品選擇合適的方法及預(yù)測結(jié)果的可靠性評估提供了指導(dǎo)。
【作者單位】： 天津大學(xué)化工學(xué)院生物工程系;天津大學(xué)教育部系統(tǒng)生物工程重點實驗室;中國科學(xué)院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所中國科學(xué)院系統(tǒng)微生物技術(shù)重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 基因組尺度 代謝網(wǎng)絡(luò) 菌種優(yōu)化 系統(tǒng)生物學(xué) 代謝工程
【基金】：國家重點基礎(chǔ)研究計劃(973計劃)(Nos.2012CB725203;2011CBA00804) 國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)(No.2012AA022103) 天津市應(yīng)用基礎(chǔ)及前沿技術(shù)研究計劃項目(No.12JCYBJC33000)資助~~
【分類號】：Q933
【正文快照】： 生物技術(shù)正在被廣泛地應(yīng)用于一些工業(yè)產(chǎn)品例如抗生素、生物能源、生物材料、大宗化學(xué)品等的生產(chǎn)。生物法相對于傳統(tǒng)的化學(xué)法具有反應(yīng)條件溫和、節(jié)約能源、轉(zhuǎn)化率高和環(huán)境友好等優(yōu)勢。為了進行高效生產(chǎn),通常需要對工業(yè)微生物進行一系列基因改造以提高目標(biāo)產(chǎn)物的生產(chǎn)速率及得率

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中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 趙靜;陶林;俞鴻;駱建華;曹志偉;李亦學(xué);;代謝網(wǎng)絡(luò)的蝴蝶結(jié)結(jié)構(gòu)特征及其功能意義[J];科學(xué)通報;2007年01期

2 王卓;陳琦;劉雷;;代謝網(wǎng)絡(luò)進化過程中拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)聯(lián)[J];科學(xué)通報;2009年02期

3 陳琦;王卓;魏冬青;;代謝網(wǎng)絡(luò)流分析進展及應(yīng)用[J];科學(xué)通報;2010年14期

4 丁德武;丁彥蕊;陸克中;須文波;黃海生;;重建代謝網(wǎng)絡(luò)及其結(jié)構(gòu)與功能的分析[J];計算機與應(yīng)用化學(xué);2010年05期

5 丁德武;黃海生;陸克中;何小青;計博婧;;代謝網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)與功能的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析[J];計算機與應(yīng)用化學(xué);2011年03期

6 陳t，

本文編號：948694