本文關(guān)鍵詞：基于線粒體COⅠ基因序列的DNA條形碼在中國南海緋鯉屬魚類鑒定中的應(yīng)用

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【摘要】：為探討COⅠ基因作為DNA條形碼對緋鯉屬(Upeneus)魚類鑒定的有效性,明確物種的分類地位,通過COⅠ基因5'端652 bp序列研究中國南海緋鯉屬的黑斑緋鯉(Upeneus tragula)、馬六甲緋鯉(Upeneus moluccensis)、縱帶緋鯉(Upeneus subvittatus)、黃帶緋鯉(Upeneus sulphureus)、呂宋緋鯉(Upeneus luzonius)以及條尾緋鯉(Upeneus bensasi)6個種56 ind標(biāo)本的標(biāo)準DNA條形碼序列的種內(nèi)種間遺傳距離,并構(gòu)建分子系統(tǒng)樹。研究表明:所測樣品的堿基組成為T:29.2%,C:29.6%,A:21.4%,G:19.8%,A+T含量(50.6%)略高于G+C含量(49.4%),轉(zhuǎn)換/顛換率為3.08。6種緋鯉屬魚類組成5個自展支持率為100%的分支,其中黑斑緋鯉和馬六甲緋鯉混雜分布于同一分支上,其余4種緋鯉獨自成支;分支間平均遺傳距離10.10%(8.60%~12.40%),是分支內(nèi)平均遺傳距離0.18%(0.00%~0.30%)的56倍�？v帶緋鯉、黃帶緋鯉、呂宋緋鯉、條尾緋鯉種間平均遺傳距離為10.70%(8.80%~12.40%),約為這4個種種內(nèi)平均遺傳距離0.125%(0.00%~0.20%)的85倍,種間遺傳距離大于種內(nèi)遺傳距離的10倍以上,確定了它們的物種有效性。黑斑緋鯉和馬六甲緋鯉種內(nèi)遺傳距離分別為0.40%和0.20%,與其它4種緋鯉為同一水平;但種間遺傳距離僅為0.30%,屬于一般物種的種內(nèi)遺傳距離范圍,因此推測二者或為同一物種,但還需從形態(tài)學(xué)和基因組序列分析等方面加以進一步確證,其是否受到種間雜交和近期輻射進化的影響也需要今后更多的研究。標(biāo)準的DNA條形碼雖然能夠有效地區(qū)分中國南海緋鯉屬魚類中的縱帶緋鯉、黃帶緋鯉、呂宋緋鯉和條尾緋鯉,但DNA條形碼對黑斑緋鯉和馬六甲緋鯉的鑒定與形態(tài)學(xué)的鑒定結(jié)果不一致,表明在物種鑒定時,母系遺傳的線粒體COⅠ基因有時需要結(jié)合其它核基因分子標(biāo)記或生態(tài)調(diào)查資料加以輔助。
【作者單位】： 暨南大學(xué)水生生物研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 緋鯉屬 DNA條形碼 COⅠ基因 中國南海
【基金】：國家自然科學(xué)基金(41071034) 中央高校基本科研業(yè)務(wù)費專項資金(21613105) 歐盟Erasmus Mundus TECHNO Ⅰ博士后教育交流項目
【分類號】：S917.4
【正文快照】： 準確的物種鑒定是開展生理生態(tài)研究和資源開發(fā)利用的前提與基礎(chǔ)。傳統(tǒng)的魚類分類主要依據(jù)外部形態(tài)特征,并結(jié)合比較解剖學(xué)特性和生態(tài)習(xí)性來確定,雖能區(qū)分大部分魚類,但通常比較依賴鑒定者的個人經(jīng)驗,且很多魚類的條紋、斑點、體色等外部形態(tài)易受外界環(huán)境及發(fā)育階段的影響而產(chǎn)生，

本文編號：936165